Publications

@article{lamer_barriers_2024,
	title = {Barriers encountered with clinical data warehouses: {Recommendations} from a focus group},
	volume = {256},
	issn = {1872-7565},
	shorttitle = {Barriers encountered with clinical data warehouses},
	doi = {10.1016/j.cmpb.2024.108404},
	abstract = {BACKGROUND AND OBJECTIVE: The increasing implementation and use of electronic health records over the last few decades has made a significant volume of clinical data being available. Over the past 20 years, hospitals have also adopted and implemented data warehouse technology to facilitate the reuse of administrative and clinical data for research. However, the implementation of clinical data warehouses encounters a set of barriers: ethical, legislative, technical, human and organizational. This paper proposes an overview of difficulties and barriers encountered during a clinical data warehouse (CDW) development and implementation project.
METHODS: We conducted a focus group at the 2023 Medical Informatics Europe Conference and invited professionals involved in the implementation of CDW. These experts described their CDW and the difficulties and barriers they encountered at each phase: (i) launching of the data warehouse project, (ii) implementing the data warehouse and (iii) using a data warehouse in routine operations. They were also asked to propose solutions they were able to implement to address the barriers previously reported.
RESULTS: After synthesis and consensus, a total of 26 barriers were identified, 10 pertained to tasks, 5 to tools and technologies, 4 to persons, 4 to organization, and 3 to the external environment. To address these challenges, a set of 15 practical recommendations was offered, covering essential aspects such as governance, stakeholder engagement, interdisciplinary collaboration, and external expertise utilization.
CONCLUSIONS: These recommendations serve as a valuable resource for healthcare institutions seeking to establish and optimize CDWs, offering a roadmap for leveraging clinical data for research, quality enhancement, and improved patient care.},
	language = {eng},
	journal = {Computer Methods and Programs in Biomedicine},
	author = {Lamer, Antoine and Popoff, Benjamin and Delange, Boris and Doutreligne, Matthieu and Chazard, Emmanuel and Marcilly, Romaric and Priou, Sonia and Quindroit, Paul},
	month = nov,
	year = {2024},
	pmid = {39241462},
	keywords = {Data Warehousing, Data reuse, Data warehouse, Electronic Health Records, Europe, Focus Groups, Guidelines, Health data, Humans, Medical Informatics, Recommendations},
	pages = {108404},
}

BACKGROUND AND OBJECTIVE: The increasing implementation and use of electronic health records over the last few decades has made a significant volume of clinical data being available. Over the past 20 years, hospitals have also adopted and implemented data warehouse technology to facilitate the reuse of administrative and clinical data for research. However, the implementation of clinical data warehouses encounters a set of barriers: ethical, legislative, technical, human and organizational. This paper proposes an overview of difficulties and barriers encountered during a clinical data warehouse (CDW) development and implementation project. METHODS: We conducted a focus group at the 2023 Medical Informatics Europe Conference and invited professionals involved in the implementation of CDW. These experts described their CDW and the difficulties and barriers they encountered at each phase: (i) launching of the data warehouse project, (ii) implementing the data warehouse and (iii) using a data warehouse in routine operations. They were also asked to propose solutions they were able to implement to address the barriers previously reported. RESULTS: After synthesis and consensus, a total of 26 barriers were identified, 10 pertained to tasks, 5 to tools and technologies, 4 to persons, 4 to organization, and 3 to the external environment. To address these challenges, a set of 15 practical recommendations was offered, covering essential aspects such as governance, stakeholder engagement, interdisciplinary collaboration, and external expertise utilization. CONCLUSIONS: These recommendations serve as a valuable resource for healthcare institutions seeking to establish and optimize CDWs, offering a roadmap for leveraging clinical data for research, quality enhancement, and improved patient care.

@article{demoule_primary_2024,
	title = {Primary care monitoring of {HbA1c} tests in type 2 diabetic patients in {Northern} {France} and impact of the successive {COVID}-19 pandemic containments},
	volume = {16},
	issn = {2666-9706},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666970624000386},
	doi = {10.1016/j.deman.2024.100233},
	abstract = {Background
French health authorities recommend the testing of HbA1c every 3 to 6 months in patients with diabetes. The successive containments linked to the SARSCoV-2 pandemic may have had a profound impact on the follow-up of diabetic patients in primary care. The objective of this study was to investigate the effect of containments on the volume of HbA1c assays and on HbA1c values of type 2 diabetic patients monitored in primary care in Northern France compared to usual seasonal variations.
Methods
Epidemiological study of a multicentre retrospective cohort, collecting the number and the value of HbA1c assays from type 2 diabetic patients, carried out in 73 private medical analysis laboratories in Northern France region between October 1, 2018 and October 31, 2022.
Results
A total of 196,744 patients and 828,037 tests were included. The first and third containments were associated with a significant decrease in the mean number of performed HbA1c tests, the decrease in the 2nd containment did not reach significance. We observed a significant decrease in HbA1c testing during the winter holiday season and the summer months. The variations in HbA1c values were not substantial compared to seasonal variations.},
	urldate = {2024-09-16},
	journal = {Diabetes Epidemiology and Management},
	author = {Demoule, Dr. Julie and Quindroit, Dr. Paul and Frévent, Dr. Camille and Collins, Prof. Dr. Claire and Chazard, Prof. Dr. Emmanuel and Beuscart, Prof. Dr. Jean-Baptiste and Berkhout, Prof. Dr. Christophe and Calafiore, Dr. Matthieu and Quersin, Dr. François},
	month = oct,
	year = {2024},
	keywords = {COVID-19, Diabetes mellitus, Disease management, Glycated hemoglobin, Primary health care, Type 2},
	pages = {100233},
}

Background French health authorities recommend the testing of HbA1c every 3 to 6 months in patients with diabetes. The successive containments linked to the SARSCoV-2 pandemic may have had a profound impact on the follow-up of diabetic patients in primary care. The objective of this study was to investigate the effect of containments on the volume of HbA1c assays and on HbA1c values of type 2 diabetic patients monitored in primary care in Northern France compared to usual seasonal variations. Methods Epidemiological study of a multicentre retrospective cohort, collecting the number and the value of HbA1c assays from type 2 diabetic patients, carried out in 73 private medical analysis laboratories in Northern France region between October 1, 2018 and October 31, 2022. Results A total of 196,744 patients and 828,037 tests were included. The first and third containments were associated with a significant decrease in the mean number of performed HbA1c tests, the decrease in the 2nd containment did not reach significance. We observed a significant decrease in HbA1c testing during the winter holiday season and the summer months. The variations in HbA1c values were not substantial compared to seasonal variations.

@article{saint-dizier_variations_2024,
	title = {Variations in {Dispensing} {Psychotropic} {Drugs} to {Adolescents} {Depending} on {School} {Periods}: {A} {French} {Nationwide} {Retrospective} {Study}},
	volume = {316},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {Variations in {Dispensing} {Psychotropic} {Drugs} to {Adolescents} {Depending} on {School} {Periods}},
	doi = {10.3233/SHTI240736},
	abstract = {Seasonality patterns are reported for various psychiatric disorders. Concerning adolescents, there is an increased frequency of general emergency department visits for mental health disorders observed between March and May, as well as in October and November. We conducted a retrospective cohort study using the French health insurance medico-administrative database. We extracted psychotropic drug deliveries occurring between 2015 and 2019 for patients aged between 12 and 18 years old. Each drug delivery was classified as occurring during a school period (Sc), the summer holidays (SumH) or other shorter holidays periods (ShH). We compared the number of distinct patients, as well as the proportion of new consumers, according to week status. Anxiolytics and hypnotics were more frequently dispensed during the school periods and short breaks than during the summer holidays. Conversely, antidepressants were more commonly dispensed during the short breaks rather than school periods and summer holidays. The stressful effects induced by schooling appear to be addressed in the first line by anxiolytics and hypnotics, while antidepressants are more frequently introduced during school holidays.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Saint-Dizier, Chloé and Betremieux, Julian and Chazard, Emmanuel and Bubrovszky, Maxime and Lamer, Antoine},
	month = aug,
	year = {2024},
	pmid = {39176523},
	keywords = {Adolescent, Child, Data reuse, Female, France, Holidays, Humans, Male, Mental health, Psychotropic Drugs, Psychotropics, Retrospective Studies, School, Schools, Seasonality, Seasons},
	pages = {1632--1636},
}

Seasonality patterns are reported for various psychiatric disorders. Concerning adolescents, there is an increased frequency of general emergency department visits for mental health disorders observed between March and May, as well as in October and November. We conducted a retrospective cohort study using the French health insurance medico-administrative database. We extracted psychotropic drug deliveries occurring between 2015 and 2019 for patients aged between 12 and 18 years old. Each drug delivery was classified as occurring during a school period (Sc), the summer holidays (SumH) or other shorter holidays periods (ShH). We compared the number of distinct patients, as well as the proportion of new consumers, according to week status. Anxiolytics and hypnotics were more frequently dispensed during the school periods and short breaks than during the summer holidays. Conversely, antidepressants were more commonly dispensed during the short breaks rather than school periods and summer holidays. The stressful effects induced by schooling appear to be addressed in the first line by anxiolytics and hypnotics, while antidepressants are more frequently introduced during school holidays.

@article{lallemant_midterm_2024,
	title = {Midterm complications after primary obstetrical anal sphincter injury repair in {France}},
	volume = {24},
	issn = {1471-2393},
	doi = {10.1186/s12884-024-06691-w},
	abstract = {BACKGROUND: Incidence of complications following obstetrical anal sphincter injury (OASI) during vaginal delivery are poorly defined. They are only studied in high level maternities, small cohorts, all stages of perineal tear or in low-income countries. The aim of our study was to describe complications after primary OASI repair following a vaginal delivery in all French maternity wards at short and midterm and to assess factors associated with complication occurrence.
METHODS: We conducted a historical cohort study using the French nationwide claim database (PMSI) from January 2013 to December 2021. All women who sustained an OASI repair following a vaginal delivery were included and virtually followed-up for 2 years. Then, we searched for OASIS complications. Finally, we evaluated factors associated with OASIS complication repaired or not and OASIS complication repairs.
RESULTS: Among the 61,833 included women, 2015 (2.8\%) had an OASI complication and 842 (1.16\%) underwent an OASI complication repair. Women were mainly primiparous (71.6\%) and 44.3\% underwent an instrumental delivery. During a follow-up of 2 years, 0.6\% (n = 463), 0.3\% (n = 240), 0.2\% (n = 176), 0.1\% (n = 84), 0.06\% (n = 43) and 0.01\% (n = 5) of patients underwent second surgery for a perineal repair, a fistula repair, a sphincteroplasty, a perineal infection, a colostomy and a sacral nervous anal stimulation, respectively. Only one case of artificial anal sphincter was noticed. Instrumental deliveries (OR = 1.56 CI95\%[1.29;1.9]), private for-profit hospitals (OR = 1.42 [1.11;1.82], reference group "public hospital"), obesity (OR = 1.36 [1;1.84]), stage IV OASIS (OR = 2.98 [2.4;3.72]), perineal wound breakdown (OR = 2.8 [1.4;5.48]), ages between 25 and 29 years old (OR = 1.59 [1.17;2.18], refence group "age between 13 and 24 years old") and 30 and 34 years old (OR = 1.57 [1.14; 2.16], refence group "age between 13 and 24 years old") were factors associated with OASIS complication repairs.
CONCLUSIONS: Maternal age, stage IV OASIS, obesity, instrumental deliveries and private for-profit hospitals seemed to predict OASIS complications. Understanding factors associated with OASIS complications could be beneficial for the patient to inform them and to influence the patient's follow-up in order to prevent complications, repairs and maternal distress.},
	language = {eng},
	number = {1},
	journal = {BMC pregnancy and childbirth},
	author = {Lallemant, Marine and Bartolo, Stéphanie and Ghesquiere, Louise and Rubod, Chrystèle and Ruffolo, Alessandro Ferdinando and Kerbage, Yohan and Chazard, Emmanuel and Cosson, Michel},
	month = aug,
	year = {2024},
	pmid = {39143527},
	pmcid = {PMC11325760},
	keywords = {Adult, Anal Canal, Anal sphincter repair, Cohort Studies, Delivery, Obstetric, Female, France, Humans, Incidence, Lacerations, Obstetric Labor Complications, Perineal care, Perineal trauma, Perineum, Postoperative Complications, Pregnancy, Risk Factors, Wound breakdown, Wound complication, Wound infection, Young Adult},
	pages = {539},
}

BACKGROUND: Incidence of complications following obstetrical anal sphincter injury (OASI) during vaginal delivery are poorly defined. They are only studied in high level maternities, small cohorts, all stages of perineal tear or in low-income countries. The aim of our study was to describe complications after primary OASI repair following a vaginal delivery in all French maternity wards at short and midterm and to assess factors associated with complication occurrence. METHODS: We conducted a historical cohort study using the French nationwide claim database (PMSI) from January 2013 to December 2021. All women who sustained an OASI repair following a vaginal delivery were included and virtually followed-up for 2 years. Then, we searched for OASIS complications. Finally, we evaluated factors associated with OASIS complication repaired or not and OASIS complication repairs. RESULTS: Among the 61,833 included women, 2015 (2.8%) had an OASI complication and 842 (1.16%) underwent an OASI complication repair. Women were mainly primiparous (71.6%) and 44.3% underwent an instrumental delivery. During a follow-up of 2 years, 0.6% (n = 463), 0.3% (n = 240), 0.2% (n = 176), 0.1% (n = 84), 0.06% (n = 43) and 0.01% (n = 5) of patients underwent second surgery for a perineal repair, a fistula repair, a sphincteroplasty, a perineal infection, a colostomy and a sacral nervous anal stimulation, respectively. Only one case of artificial anal sphincter was noticed. Instrumental deliveries (OR = 1.56 CI95%[1.29;1.9]), private for-profit hospitals (OR = 1.42 [1.11;1.82], reference group "public hospital"), obesity (OR = 1.36 [1;1.84]), stage IV OASIS (OR = 2.98 [2.4;3.72]), perineal wound breakdown (OR = 2.8 [1.4;5.48]), ages between 25 and 29 years old (OR = 1.59 [1.17;2.18], refence group "age between 13 and 24 years old") and 30 and 34 years old (OR = 1.57 [1.14; 2.16], refence group "age between 13 and 24 years old") were factors associated with OASIS complication repairs. CONCLUSIONS: Maternal age, stage IV OASIS, obesity, instrumental deliveries and private for-profit hospitals seemed to predict OASIS complications. Understanding factors associated with OASIS complications could be beneficial for the patient to inform them and to influence the patient's follow-up in order to prevent complications, repairs and maternal distress.

@article{quindroit_home_2024,
	title = {Home {Care} {Nursing} on {Long}-{Term} {Illness} {Management} in the {French} {Healthcare} {System}},
	volume = {315},
	issn = {1879-8365},
	doi = {10.3233/SHTI240286},
	abstract = {This study explores the role of home care nurses in managing long-term illnesses (L-TI) within the French healthcare system, utilizing data from the SNDS. Focused on data from 2022, it categorizes nursing actions into medical procedures, care procedures, and nursing processes, revealing significant involvement in patient care. The findings highlight the crucial, evolving role of home care nurses in addressing the complex needs of millions suffering from chronic conditions like diabetes and cardiovascular diseases in France.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Quindroit, Paul and Teston, Antoine and Millevile, Nicolas and Chazard, Emmanuel and Saint-Dizier, Chloé and Lamer, Antoine},
	month = jul,
	year = {2024},
	pmid = {39049388},
	keywords = {Chronic Disease, Disease Management, France, Home Care Services, Home Health Nursing, Humans, Long-Term Care, Nurse's Role, Nursing care practices, SNDS, data reuse, long-term illness},
	pages = {699--700},
}

This study explores the role of home care nurses in managing long-term illnesses (L-TI) within the French healthcare system, utilizing data from the SNDS. Focused on data from 2022, it categorizes nursing actions into medical procedures, care procedures, and nursing processes, revealing significant involvement in patient care. The findings highlight the crucial, evolving role of home care nurses in addressing the complex needs of millions suffering from chronic conditions like diabetes and cardiovascular diseases in France.

@article{lamer_data_2024,
	title = {Data {Lake}, {Data} {Warehouse}, {Datamart}, and {Feature} {Store}: {Their} {Contributions} to the {Complete} {Data} {Reuse} {Pipeline}},
	volume = {12},
	issn = {2291-9694},
	shorttitle = {Data {Lake}, {Data} {Warehouse}, {Datamart}, and {Feature} {Store}},
	doi = {10.2196/54590},
	abstract = {The growing adoption and use of health information technology has generated a wealth of clinical data in electronic format, offering opportunities for data reuse beyond direct patient care. However, as data are distributed across multiple software, it becomes challenging to cross-reference information between sources due to differences in formats, vocabularies, and technologies and the absence of common identifiers among software. To address these challenges, hospitals have adopted data warehouses to consolidate and standardize these data for research. Additionally, as a complement or alternative, data lakes store both source data and metadata in a detailed and unprocessed format, empowering exploration, manipulation, and adaptation of the data to meet specific analytical needs. Subsequently, datamarts are used to further refine data into usable information tailored to specific research questions. However, for efficient analysis, a feature store is essential to pivot and denormalize the data, simplifying queries. In conclusion, while data warehouses are crucial, data lakes, datamarts, and feature stores play essential and complementary roles in facilitating data reuse for research and analysis in health care.},
	language = {eng},
	journal = {JMIR medical informatics},
	author = {Lamer, Antoine and Saint-Dizier, Chloé and Paris, Nicolas and Chazard, Emmanuel},
	month = jul,
	year = {2024},
	pmid = {39037339},
	pmcid = {PMC11267403},
	keywords = {data lake, data reuse, data warehouse, datamart, feature extraction, feature store},
	pages = {e54590},
}

The growing adoption and use of health information technology has generated a wealth of clinical data in electronic format, offering opportunities for data reuse beyond direct patient care. However, as data are distributed across multiple software, it becomes challenging to cross-reference information between sources due to differences in formats, vocabularies, and technologies and the absence of common identifiers among software. To address these challenges, hospitals have adopted data warehouses to consolidate and standardize these data for research. Additionally, as a complement or alternative, data lakes store both source data and metadata in a detailed and unprocessed format, empowering exploration, manipulation, and adaptation of the data to meet specific analytical needs. Subsequently, datamarts are used to further refine data into usable information tailored to specific research questions. However, for efficient analysis, a feature store is essential to pivot and denormalize the data, simplifying queries. In conclusion, while data warehouses are crucial, data lakes, datamarts, and feature stores play essential and complementary roles in facilitating data reuse for research and analysis in health care.

@article{lamer_prolonged_2024,
	title = {Prolonged increase in psychotropic drug use among young women following the {COVID}-19 pandemic: a {French} nationwide retrospective study},
	volume = {22},
	issn = {1741-7015},
	shorttitle = {Prolonged increase in psychotropic drug use among young women following the {COVID}-19 pandemic},
	doi = {10.1186/s12916-024-03496-8},
	abstract = {BACKGROUND: The COVID-19 pandemic has had a significant impact on mental health, with evidence suggesting an enduring mental health crisis. Studies worldwide observed increased usage of antidepressants, anxiolytics, and hypnotics during the pandemic, notably among young people and women. However, few studies tracked consumption post-2021. Our study aimed to fill this gap by investigating whether the surge in the number psychotropic drug consumers in France persisted 2 years after the first lockdown, particularly focusing on age and gender differences.
METHODS: We conducted a national retrospective observational study based on the French national insurance database. We retrieved all prescriptions of anxiolytics, hypnotics, and antidepressants dispensed in pharmacies in France for the period 2015-2022. We performed interrupted time series analyses based on Poisson models for five age classes (12-18; 19-25; 26-50; 51-75; 76 and more) to assess the trend before lockdown, the gap induced and the change in trend after.
RESULTS: In the overall population, the number of consumers remained constant for antidepressants while it decreased for anxiolytics and hypnotics. Despite this global trend, a long-term increase was observed in the 12-18 and 19-25 groups for the three drug classes. Moreover, for these age classes, the increases were more pronounced for women than men, except for hypnotics where the trends were similar.
CONCLUSIONS: The number of people using antidepressants continues to increase more than 2 years after the first lockdown, showing a prolonged effect on mental health. This effect is particularly striking among adolescents and young adults confirming the devastating long-term impact of the pandemic on their mental health.},
	language = {eng},
	number = {1},
	journal = {BMC medicine},
	author = {Lamer, Antoine and Saint-Dizier, Chloé and Levaillant, Mathieu and Hamel-Broza, Jean-François and Ayed, Eiya and Chazard, Emmanuel and Bubrovszky, Maxime and D'Hondt, Fabien and Génin, Michael and Horn, Mathilde},
	month = jul,
	year = {2024},
	pmid = {38956514},
	keywords = {Adolescent, Adult, Aged, Anti-Anxiety Agents, Antidepressive Agents, COVID-19, Child, Data reuse, Female, France, Humans, Hypnotics and Sedatives, Male, Mental health, Middle Aged, Pandemics, Pharmacoepidemiology, Psychiatry, Psychotropic Drugs, Psychotropic drugs, Retrospective Studies, SARS-CoV-2, Sex Factors, Young Adult},
	pages = {274},
}

BACKGROUND: The COVID-19 pandemic has had a significant impact on mental health, with evidence suggesting an enduring mental health crisis. Studies worldwide observed increased usage of antidepressants, anxiolytics, and hypnotics during the pandemic, notably among young people and women. However, few studies tracked consumption post-2021. Our study aimed to fill this gap by investigating whether the surge in the number psychotropic drug consumers in France persisted 2 years after the first lockdown, particularly focusing on age and gender differences. METHODS: We conducted a national retrospective observational study based on the French national insurance database. We retrieved all prescriptions of anxiolytics, hypnotics, and antidepressants dispensed in pharmacies in France for the period 2015-2022. We performed interrupted time series analyses based on Poisson models for five age classes (12-18; 19-25; 26-50; 51-75; 76 and more) to assess the trend before lockdown, the gap induced and the change in trend after. RESULTS: In the overall population, the number of consumers remained constant for antidepressants while it decreased for anxiolytics and hypnotics. Despite this global trend, a long-term increase was observed in the 12-18 and 19-25 groups for the three drug classes. Moreover, for these age classes, the increases were more pronounced for women than men, except for hypnotics where the trends were similar. CONCLUSIONS: The number of people using antidepressants continues to increase more than 2 years after the first lockdown, showing a prolonged effect on mental health. This effect is particularly striking among adolescents and young adults confirming the devastating long-term impact of the pandemic on their mental health.

@article{robert_integration_2024,
	title = {Intégration d’un score d’optimisation des analyses pharmaceutiques dans un système d’aide à la décision : un match pas gagné d’avance !},
	volume = {59},
	issn = {2772-9532},
	shorttitle = {Intégration d’un score d’optimisation des analyses pharmaceutiques dans un système d’aide à la décision},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2772953224000509},
	doi = {10.1016/j.phacli.2024.04.006},
	abstract = {Contexte
Les systèmes d’aide à la décision en pharmacie (SADP) se développent de plus en plus et leur intérêt dans l’aide à la détection de problèmes liés à la thérapeutique est incontestable. Plusieurs outils existent pour optimiser l’analyse pharmaceutique des prescriptions ainsi que le nombre d’interventions pharmaceutiques (IP). Avec l’augmentation du nombre de données issues des séjours hospitaliers, ils pourraient bénéficier d’une approche fondée sur l’aide à la décision, mais en réalité peu sont intégrés dans les SADP.
Objectifs
L’objectif de ce travail est d’évaluer l’intégration d’un score dans un SADP afin de déterminer un seuil qui permettrait de distinguer les séjours hospitaliers bénéficiant d’une analyse pharmaceutique pouvant être à l’origine d’IP des séjours hospitaliers moins à risque de conduire à une ou plusieurs IP.
Méthode
Il s’agit d’une étude rétrospective et observationnelle, menée du 2 mars au 16 avril 2022. Le score qui a été intégré dans le SADP PharmaClass® (Keenturtle) est inspiré d’un score canadien. Les critères du score se composent de l’âge, du nombre de médicaments et du type de médicaments présents dans la prescription. Pour chaque hospitalisation, un score a été calculé au début du séjour et nous avons regardé rétrospectivement si un pharmacien avait fait une analyse pharmaceutique et si cette analyse avait abouti à une ou plusieurs IP. Une analyse statistique (courbe ROC et indice de Youden) a ensuite été menée pour déterminer le seuil de score optimal distinguant les séjours hospitaliers avec analyse pharmaceutique susceptible de conduire à une IP des séjours avec analyse pharmaceutique moins probable de conduire à une IP.
Résultats
Pendant la période de l’étude, 1717 séjours ont bénéficié d’un calcul de score, dont 973 (56,7 \%) séjours, une analyse pharmaceutique a été effectuée. Suite aux analyses statistiques, un seuil de 4 a été considéré comme discriminant pour identifier les séjours analysés conduisant à une ou plusieurs IP. À ce seuil, 600 (61,7 \%) séjours hospitaliers sont détectés dont 33,3 \% ont conduit à une IP, et 5,0 \% des séjours totaux n’ont pas été détectés bien qu’ayant fait l’objet d’au moins une IP.
Discussion - Conclusion
Les résultats de cette étude montrent qu’un score intégré dans un SADP peut aider les pharmaciens à détecter les séjours hospitaliers susceptibles de conduire à une IP. Cependant, le seuil optimal est difficile à déterminer, car il faut contrebalancer les séjours qui seront bien détectés de ceux qui seront détectés à tort ou encore des séjours qui ne seront pas détectés, alors qu’ils auraient dû. En pratique, ce score pourrait être utilisé en premier lieu sans seuil pour optimiser l’organisation des analyses pharmaceutiques à entreprendre et ainsi maximiser la détection des prescriptions à risque. L’intégration d’un score pour optimiser l’analyse pharmaceutique est une tâche complexe et les résultats peuvent être améliorés en collaborant avec les développeurs des SADP.},
	number = {2},
	urldate = {2024-09-16},
	journal = {Le Pharmacien Clinicien},
	author = {Robert, L. and Rousselière, C. and Vidoni, N. and Gerard, E. and Chazard, E. and Odou, P. and Décaudin, B.},
	month = jun,
	year = {2024},
	keywords = {Pharmacie d’hôpital, Prescription inappropriée, Systèmes d’aide à la décision clinique},
	pages = {e22--e23},
}

Contexte Les systèmes d’aide à la décision en pharmacie (SADP) se développent de plus en plus et leur intérêt dans l’aide à la détection de problèmes liés à la thérapeutique est incontestable. Plusieurs outils existent pour optimiser l’analyse pharmaceutique des prescriptions ainsi que le nombre d’interventions pharmaceutiques (IP). Avec l’augmentation du nombre de données issues des séjours hospitaliers, ils pourraient bénéficier d’une approche fondée sur l’aide à la décision, mais en réalité peu sont intégrés dans les SADP. Objectifs L’objectif de ce travail est d’évaluer l’intégration d’un score dans un SADP afin de déterminer un seuil qui permettrait de distinguer les séjours hospitaliers bénéficiant d’une analyse pharmaceutique pouvant être à l’origine d’IP des séjours hospitaliers moins à risque de conduire à une ou plusieurs IP. Méthode Il s’agit d’une étude rétrospective et observationnelle, menée du 2 mars au 16 avril 2022. Le score qui a été intégré dans le SADP PharmaClass® (Keenturtle) est inspiré d’un score canadien. Les critères du score se composent de l’âge, du nombre de médicaments et du type de médicaments présents dans la prescription. Pour chaque hospitalisation, un score a été calculé au début du séjour et nous avons regardé rétrospectivement si un pharmacien avait fait une analyse pharmaceutique et si cette analyse avait abouti à une ou plusieurs IP. Une analyse statistique (courbe ROC et indice de Youden) a ensuite été menée pour déterminer le seuil de score optimal distinguant les séjours hospitaliers avec analyse pharmaceutique susceptible de conduire à une IP des séjours avec analyse pharmaceutique moins probable de conduire à une IP. Résultats Pendant la période de l’étude, 1717 séjours ont bénéficié d’un calcul de score, dont 973 (56,7 %) séjours, une analyse pharmaceutique a été effectuée. Suite aux analyses statistiques, un seuil de 4 a été considéré comme discriminant pour identifier les séjours analysés conduisant à une ou plusieurs IP. À ce seuil, 600 (61,7 %) séjours hospitaliers sont détectés dont 33,3 % ont conduit à une IP, et 5,0 % des séjours totaux n’ont pas été détectés bien qu’ayant fait l’objet d’au moins une IP. Discussion - Conclusion Les résultats de cette étude montrent qu’un score intégré dans un SADP peut aider les pharmaciens à détecter les séjours hospitaliers susceptibles de conduire à une IP. Cependant, le seuil optimal est difficile à déterminer, car il faut contrebalancer les séjours qui seront bien détectés de ceux qui seront détectés à tort ou encore des séjours qui ne seront pas détectés, alors qu’ils auraient dû. En pratique, ce score pourrait être utilisé en premier lieu sans seuil pour optimiser l’organisation des analyses pharmaceutiques à entreprendre et ainsi maximiser la détection des prescriptions à risque. L’intégration d’un score pour optimiser l’analyse pharmaceutique est une tâche complexe et les résultats peuvent être améliorés en collaborant avec les développeurs des SADP.

@article{leblanc_corrigendum_2024,
	title = {Corrigendum du résumé « {Optimiser} la recherche d'articles scientifiques - {Une} étude comparative de la performance de {BibliZap}, un outil innovant s'appuyant sur l'analyse de réseau, par rapport à l'utilisation de {PubMed} »[{Journal} of {Epidemiology} and {Population} {Health} {72S1} (2024) 202240]},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324003379},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202527},
	number = {3},
	urldate = {2024-09-16},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Leblanc, V. and Le Guellec, B. and Lenain, R. and Gauthier, V. and Dauchet, L. and Amouyel, P. and Hamroun, A. and Chazard, E. and Bentegeac, R.},
	month = jun,
	year = {2024},
	pages = {202527},
}

@article{philippoteaux_proton_2024,
	title = {Proton pump inhibitors, bone and phosphocalcic metabolism},
	volume = {91},
	issn = {1778-7254},
	doi = {10.1016/j.jbspin.2024.105714},
	abstract = {Proton pump inhibitors (PPIs) are widely used for acid-related gastrointestinal disorders; however, concerns have arisen about their prolonged and inappropriate use. Although generally considered safe, recent evidence has linked PPI use with an increased risk of kidney disease, stomach cancer, pneumonia, dementia, cardiovascular events and potential bone health problems. This systematic review examines the effects of PPIs on bone health, including osteoporosis and changes in phosphocalcic and magnesium metabolism, through a comprehensive analysis of the recent literature. The relationship between PPIs, bone mineral density and fracture risk, especially in populations with comorbidities, is complex and we propose a focus based on recent data. Studies of the effect of PPI use on bone mineral density have shown mixed results and require further investigation. Observational studies have indicated an increased risk of fractures, particularly vertebral fractures, associated with PPI use. Recent meta-analyses have confirmed an association between PPI use and hip fractures with a dose-dependent effect. More recently, PPIs have been associated with serious disturbances in phosphocalcic and magnesium metabolism that require careful management and discontinuation. Proton pump inhibitor-induced hypomagnesemia (PPIH) is a well-established phenomenon. In addition, hypocalcemia secondary to severe hypomagnesemia has been described. Despite growing evidence of PPI-related risks, further research is essential to better understand the complex mechanisms, as most data are from observational studies and do not establish a causal relationship. This review emphasizes the need for judicious prescription practices, particularly in long-term use scenarios and rheumatological contexts.},
	language = {eng},
	number = {5},
	journal = {Joint Bone Spine},
	author = {Philippoteaux, Cécile and Paccou, Julien and Chazard, Emmanuel and Cortet, Bernard},
	month = mar,
	year = {2024},
	pmid = {38458487},
	keywords = {Hypocalcemia, Hypomagnesemia, Osteoporosis, Osteoporotic fractures, Proton pump inhibitors},
	pages = {105714},
}

Proton pump inhibitors (PPIs) are widely used for acid-related gastrointestinal disorders; however, concerns have arisen about their prolonged and inappropriate use. Although generally considered safe, recent evidence has linked PPI use with an increased risk of kidney disease, stomach cancer, pneumonia, dementia, cardiovascular events and potential bone health problems. This systematic review examines the effects of PPIs on bone health, including osteoporosis and changes in phosphocalcic and magnesium metabolism, through a comprehensive analysis of the recent literature. The relationship between PPIs, bone mineral density and fracture risk, especially in populations with comorbidities, is complex and we propose a focus based on recent data. Studies of the effect of PPI use on bone mineral density have shown mixed results and require further investigation. Observational studies have indicated an increased risk of fractures, particularly vertebral fractures, associated with PPI use. Recent meta-analyses have confirmed an association between PPI use and hip fractures with a dose-dependent effect. More recently, PPIs have been associated with serious disturbances in phosphocalcic and magnesium metabolism that require careful management and discontinuation. Proton pump inhibitor-induced hypomagnesemia (PPIH) is a well-established phenomenon. In addition, hypocalcemia secondary to severe hypomagnesemia has been described. Despite growing evidence of PPI-related risks, further research is essential to better understand the complex mechanisms, as most data are from observational studies and do not establish a causal relationship. This review emphasizes the need for judicious prescription practices, particularly in long-term use scenarios and rheumatological contexts.

@article{rochoy_declaration_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Une déclaration administrative de médecin traitant n'est pas synonyme d'un suivi par un médecin généraliste : étude descriptive dans les établissements d'hébergement pour personnes âgées dépendantes ({Ehpad}) du {Boulonnais}},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	shorttitle = {Une déclaration administrative de médecin traitant n'est pas synonyme d'un suivi par un médecin généraliste},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324001605},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202350},
	abstract = {Introduction
Le cap fixé par le Président de la République en janvier 2023 visait à ce que chaque personne en affection longue durée (ALD) puisse signer une déclaration médecin traitant avant la fin de l'année. Or, en Etablissement d'hébergement pour personnes âgées dépendantes (Ehpad), de nombreux résidents en ALD ont bien une déclaration administrative mais ne sont plus suivis par leur médecin traitant (notamment après un départ en retraite, si l'Ehpad est éloignée ou si le médecin choisit de ne pas y intervenir). Notre objectif était de déterminer le taux de résidents d'Ehpad ayant un suivi par un médecin traitant avec ou sans déclaration administrative, et le taux de résidents n'ayant pas de suivi par un médecin traitant avec ou sans déclaration administrative.
Méthodes
En mai 2023, nous avons réalisé une étude épidémiologique descriptive auprès des 215 résidents des quatre Ehpad rattachés au Centre hospitalier de Boulogne-sur-Mer. Le suivi par un médecin traitant était déterminé par les équipes infirmières. Les troubles neurocognitifs ont été déterminés dans le dossier médical.
Résultats
Nous avons recensé 154 femmes (71,6 \%), 61 hommes (28,4 \%), de 82,0±10,3 ans, dont 64 \% étaient atteints de troubles neurocognitifs. Parmi les 215 résidents, 130 (60 \%) avaient un suivi par un médecin traitant — 121 déclaré administrativement (56 \%) et 9 non déclaré (4 \%). Il y avait 85 résidents (40 \%) sans suivi par un médecin traitant — 70 ayant pourtant un médecin déclaré administrativement (33 \%) et 15 non déclaré (7 \%). Au total, sur 72 médecins généralistes déclarés, 30 assuraient un suivi (dont 3 exerçant entre 10 et 16 km).
Conclusion
Notre travail exploratoire sur 4 des 11 000 établissements d'hébergement du pays mériterait d’être conduit de façon coordonnée par la Caisse nationale d'assurance maladie. Les Ehpad rattachés à un centre hospitalier étaient ceux où l'absence de suivi était la plus élevée. Outre l'identification de ce problème, augmenter le temps médical disponible reste un préalable indispensable pour améliorer l'accès aux soins, y compris en Ehpad où notre étude confirme des besoins non satisfaits : cela passe notamment par une meilleure prévention des maladies (infections, cancers, etc.), une meilleure éducation à la santé et une réduction de la surcharge administrative (certificats absurdes).},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Rochoy, M. and Cangardel, A. and Ouk, T. and Gautier, S. and Serman, F. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Ehpad, Médecin traitant, Médecine générale, Parcours de santé},
	pages = {202350},
}

Introduction Le cap fixé par le Président de la République en janvier 2023 visait à ce que chaque personne en affection longue durée (ALD) puisse signer une déclaration médecin traitant avant la fin de l'année. Or, en Etablissement d'hébergement pour personnes âgées dépendantes (Ehpad), de nombreux résidents en ALD ont bien une déclaration administrative mais ne sont plus suivis par leur médecin traitant (notamment après un départ en retraite, si l'Ehpad est éloignée ou si le médecin choisit de ne pas y intervenir). Notre objectif était de déterminer le taux de résidents d'Ehpad ayant un suivi par un médecin traitant avec ou sans déclaration administrative, et le taux de résidents n'ayant pas de suivi par un médecin traitant avec ou sans déclaration administrative. Méthodes En mai 2023, nous avons réalisé une étude épidémiologique descriptive auprès des 215 résidents des quatre Ehpad rattachés au Centre hospitalier de Boulogne-sur-Mer. Le suivi par un médecin traitant était déterminé par les équipes infirmières. Les troubles neurocognitifs ont été déterminés dans le dossier médical. Résultats Nous avons recensé 154 femmes (71,6 %), 61 hommes (28,4 %), de 82,0±10,3 ans, dont 64 % étaient atteints de troubles neurocognitifs. Parmi les 215 résidents, 130 (60 %) avaient un suivi par un médecin traitant — 121 déclaré administrativement (56 %) et 9 non déclaré (4 %). Il y avait 85 résidents (40 %) sans suivi par un médecin traitant — 70 ayant pourtant un médecin déclaré administrativement (33 %) et 15 non déclaré (7 %). Au total, sur 72 médecins généralistes déclarés, 30 assuraient un suivi (dont 3 exerçant entre 10 et 16 km). Conclusion Notre travail exploratoire sur 4 des 11 000 établissements d'hébergement du pays mériterait d’être conduit de façon coordonnée par la Caisse nationale d'assurance maladie. Les Ehpad rattachés à un centre hospitalier étaient ceux où l'absence de suivi était la plus élevée. Outre l'identification de ce problème, augmenter le temps médical disponible reste un préalable indispensable pour améliorer l'accès aux soins, y compris en Ehpad où notre étude confirme des besoins non satisfaits : cela passe notamment par une meilleure prévention des maladies (infections, cancers, etc.), une meilleure éducation à la santé et une réduction de la surcharge administrative (certificats absurdes).

@article{saint-dizier_effets_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Effets des vacances scolaires sur les habitudes de délivrance de médicaments - {Focus} sur psychotropes, insulines et inhibiteurs de la pompe à proton},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000909},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202280},
	abstract = {Introduction
Les fluctuations saisonnières dans les comportements de santé sont un sujet d'intérêt croissant dans le domaine de la santé publique et de l'épidémiologie, en particulier en psychiatrie et santé mentale. En effet, des variations saisonnières ont déjà été montrées sur les hospitalisations pour catatonie. Cette étude se concentre sur l'impact des vacances scolaires sur les délivrances de trois classes de psychotropes. En comparaison, nous étudions les médicaments non psychiatriques par les délivrances des insulines et des inhibiteurs de la pompe à proton (IPP).
Méthodes
Les délivrances en pharmacie d'anxiolytiques, antidépresseurs, hypnotiques, insulines et IPP sont identifiés dans le Système national de données de santé par les codes ATC correspondants. Pour chaque classe, le nombre de patients ayant au moins une délivrance a été calculée par semaine de 2015 à 2019. Les périodes de « petites vacances » (PV) sont définies comme les semaines où au moins l'une des zones est en vacances, les vacances d’été (VE) correspondent aux semaines où les trois zones sont en vacances entre deux années scolaires. L'effet des vacances sur le nombre de patients ayant une délivrance en pharmacie est estimé par un modèle de poisson pour chaque classe d’âge et classe médicamenteuse avec un risque de 5\%.
Résultats
Une diminution des délivrances d'anxiolytiques est observée dans chaque sous-groupe pour tout type de vacances hormis pendant les PV chez les 19-25 ans où le nombre de patients augmente. Les délivrances d'antidépresseurs sont plus fréquentes durant les PV pour les 12-18, les 19-25 et les 50-75 ans ainsi que durant les VE chez les 12-18 ans. Les délivrances d'hypnotiques sont diminuées pour tout type de vacances à tout âge, d'autant plus lors des VE. Pour les insulines, les délivrances sont plus nombreuses lors de tout type de vacances quel que soit l’âge. Enfin, les consommations d'IPP sont plus importantes pour tout type de vacances chez les 12-18 et 26-50 ans. Dans les autres groupes, on observe une augmentation durant les PE et une diminution au cours des VE.
Conclusion
L'effet des vacances sur l'activité en pharmacie est dépendant des indications et de l’âge des consommateurs. Une étude similaire sur les consultations de médecine générale ou de psychiatrie est à envisager pour expliquer l'effet persistant des vacances dans les populations les plus âgées.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Saint-Dizier, C. and Chazard, E. and Ayed, E. and Bubrovszky, M. and Lamer, A.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Délivrances en pharmacie, Psychotropes, Réutilisation de données, SNDS, Vacances},
	pages = {202280},
}

Introduction Les fluctuations saisonnières dans les comportements de santé sont un sujet d'intérêt croissant dans le domaine de la santé publique et de l'épidémiologie, en particulier en psychiatrie et santé mentale. En effet, des variations saisonnières ont déjà été montrées sur les hospitalisations pour catatonie. Cette étude se concentre sur l'impact des vacances scolaires sur les délivrances de trois classes de psychotropes. En comparaison, nous étudions les médicaments non psychiatriques par les délivrances des insulines et des inhibiteurs de la pompe à proton (IPP). Méthodes Les délivrances en pharmacie d'anxiolytiques, antidépresseurs, hypnotiques, insulines et IPP sont identifiés dans le Système national de données de santé par les codes ATC correspondants. Pour chaque classe, le nombre de patients ayant au moins une délivrance a été calculée par semaine de 2015 à 2019. Les périodes de « petites vacances » (PV) sont définies comme les semaines où au moins l'une des zones est en vacances, les vacances d’été (VE) correspondent aux semaines où les trois zones sont en vacances entre deux années scolaires. L'effet des vacances sur le nombre de patients ayant une délivrance en pharmacie est estimé par un modèle de poisson pour chaque classe d’âge et classe médicamenteuse avec un risque de 5%. Résultats Une diminution des délivrances d'anxiolytiques est observée dans chaque sous-groupe pour tout type de vacances hormis pendant les PV chez les 19-25 ans où le nombre de patients augmente. Les délivrances d'antidépresseurs sont plus fréquentes durant les PV pour les 12-18, les 19-25 et les 50-75 ans ainsi que durant les VE chez les 12-18 ans. Les délivrances d'hypnotiques sont diminuées pour tout type de vacances à tout âge, d'autant plus lors des VE. Pour les insulines, les délivrances sont plus nombreuses lors de tout type de vacances quel que soit l’âge. Enfin, les consommations d'IPP sont plus importantes pour tout type de vacances chez les 12-18 et 26-50 ans. Dans les autres groupes, on observe une augmentation durant les PE et une diminution au cours des VE. Conclusion L'effet des vacances sur l'activité en pharmacie est dépendant des indications et de l’âge des consommateurs. Une étude similaire sur les consultations de médecine générale ou de psychiatrie est à envisager pour expliquer l'effet persistant des vacances dans les populations les plus âgées.

@article{leblanc_optimiser_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Optimiser la recherche d'articles scientifiques - {Une} étude comparative de la performance de {BibliZap}, un outil innovant s'appuyant sur l'analyse de réseau, par rapport à l'utilisation de {PubMed}},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000508},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202240},
	abstract = {Introduction
Le volume de connaissances scientifiques augmente de manière exponentielle. Actuellement, les chercheurs sont confrontés à un défi colossal pour identifier rapidement des articles d'intérêt. En réponse à cette problématique, les moteurs de recherche offrent un tri par pertinence. Cependant, ces algorithmes s'appuient sur les mots du texte, or ces derniers perdent parfois leur signification lorsqu'ils sont isolés de leur contexte. Une alternative pourrait être l'exploration des réseaux de citations. Notre objectif était d’évaluer la performance de l'analyse de réseaux pour trouver des articles scientifiques d'intérêts en la comparant à la recherche via PubMed.
Méthodes
Nous avons développé un outil en ligne, BibliZap (app.biblizap.org), qui permet une fouille systématique des références s'appuyant sur une base de plus de 200 millions d'articles (lens.org). Pour le comparateur, nous avons récupéré les résultats renvoyés par PubMed avec le tri par pertinence activé de 70 requêtes issues de revues systématiques (RS). Nous avons également extrait les articles sélectionnés par les auteurs de ces RS, ceux-ci constituaient les articles à retrouver. Pour l'analyse de réseaux, deux requêtes différentes par RS étaient faites à BibliZap : un article puis trois articles tirés au hasard parmi les articles à retrouver de la RS.
Résultats
PubMed trouvait 67,4 \% des articles d'intérêts (20 \% atteint à 220 articles lus, 60 \% atteint à 2640 articles lus). Avec un article d'intérêt en requête, BibliZap trouvait 70,6 \% des articles d'intérêts (20 \% atteint à 51 articles lus, 60 \% atteint à 1747 articles lus). Avec trois articles d'intérêt en requête, BibliZap trouvait 87,1 \% des articles d'intérêt (20 \% atteint à 23 articles lus, 60 \% atteint à 377 articles lus). Pour 44 \% des cas où la requête PubMed n'atteignait pas 100 \% de sensibilité, BibliZap permettait de compléter la recherche d'articles pour atteindre une sensibilité de 100 \%.
Conclusion
La recherche d'articles scientifiques par analyse de réseaux semble prometteuses pour trouver rapidement des articles d'intérêts. Elle semble également pertinente dans le cadre des revues systématiques en complément des requêtes textuelles. BibliZap pourrait devenir dans le futur un outil incontournable à la fois dans le cadre de recherche bibliographique de routine, et dans le cadre de revues systématiques de la littérature.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Leblanc, V. and Le Guellec, B. and Gauthier, V. and Chazard, E. and Lenain, R. and Dauchet, L. and Bentegeac, R. and Amouyel, P. and Hamroun, A.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Analyse de réseaux, Bibliographie, PubMed, Revues systématiques, Réseaux de citations},
	pages = {202240},
}

Introduction Le volume de connaissances scientifiques augmente de manière exponentielle. Actuellement, les chercheurs sont confrontés à un défi colossal pour identifier rapidement des articles d'intérêt. En réponse à cette problématique, les moteurs de recherche offrent un tri par pertinence. Cependant, ces algorithmes s'appuient sur les mots du texte, or ces derniers perdent parfois leur signification lorsqu'ils sont isolés de leur contexte. Une alternative pourrait être l'exploration des réseaux de citations. Notre objectif était d’évaluer la performance de l'analyse de réseaux pour trouver des articles scientifiques d'intérêts en la comparant à la recherche via PubMed. Méthodes Nous avons développé un outil en ligne, BibliZap (app.biblizap.org), qui permet une fouille systématique des références s'appuyant sur une base de plus de 200 millions d'articles (lens.org). Pour le comparateur, nous avons récupéré les résultats renvoyés par PubMed avec le tri par pertinence activé de 70 requêtes issues de revues systématiques (RS). Nous avons également extrait les articles sélectionnés par les auteurs de ces RS, ceux-ci constituaient les articles à retrouver. Pour l'analyse de réseaux, deux requêtes différentes par RS étaient faites à BibliZap : un article puis trois articles tirés au hasard parmi les articles à retrouver de la RS. Résultats PubMed trouvait 67,4 % des articles d'intérêts (20 % atteint à 220 articles lus, 60 % atteint à 2640 articles lus). Avec un article d'intérêt en requête, BibliZap trouvait 70,6 % des articles d'intérêts (20 % atteint à 51 articles lus, 60 % atteint à 1747 articles lus). Avec trois articles d'intérêt en requête, BibliZap trouvait 87,1 % des articles d'intérêt (20 % atteint à 23 articles lus, 60 % atteint à 377 articles lus). Pour 44 % des cas où la requête PubMed n'atteignait pas 100 % de sensibilité, BibliZap permettait de compléter la recherche d'articles pour atteindre une sensibilité de 100 %. Conclusion La recherche d'articles scientifiques par analyse de réseaux semble prometteuses pour trouver rapidement des articles d'intérêts. Elle semble également pertinente dans le cadre des revues systématiques en complément des requêtes textuelles. BibliZap pourrait devenir dans le futur un outil incontournable à la fois dans le cadre de recherche bibliographique de routine, et dans le cadre de revues systématiques de la littérature.

@article{rochoy_collaboration_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Collaboration entre certificats-absurdes.fr et des {Conseils} départementaux de l'{Ordre} des {Médecins} pour limiter les demandes abusives de certificats médicaux},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000351},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202225},
	abstract = {Introduction
Le nombre de généralistes installés diminue et la population augmente et vieillit. Pour maintenir un accès aux soins suffisant, le temps médical doit donc être préservé, notamment en diminuant la charge administrative qui pèse sur les médecins. En moyenne, les médecins généralistes estiment passer 1h30 à 2h par semaine sur des certificats médicaux injustifiés. En mars 2023, le Collège de médecine générale a diffusé le site certificats-absurdes.fr pour mettre en lumière cette situation. Afin de renforcer cette initiative, nous avons mené une initiative en collaboration avec plusieurs Conseils départementaux de l'Ordre des Médecins (CDOM) visant à faire des rappels ciblés et personnalisés de la loi en vigueur sur les certificats médicaux, sur demande de médecins généralistes attachés à ces CDOM participant. L'objectif de notre travail de recherche était de décrire le motif des certificats médicaux sur une période de 100 jours et d'identifier les principaux demandeurs de certificats abusifs.
Méthodes
Nous avons réalisé une étude descriptive multicentrique sur tous les courriers de réclamation concernant des certificats médicaux reçus par les CDOM du Nord, des Ardennes, de l'Ariège, du Bas-Rhin, du Calvados, de l'Eure, du Gard, du Morbihan et du Territoire de Belfort. Les CDOM ont reçu les signalements de médecins concernant des demandes jugées abusives. Lorsque les demandes étaient illégales ou injustifiées, nous avons rédigé un courrier qui a été signé et envoyé par les CDOM aux organismes demandeurs.
Résultats
Les Conseils ont reçu un total de 203 réclamations, en majorité du département du Nord (76,4 \%), adressées par 103 médecins (53 femmes et 50 hommes). Le plus grand nombre concernait le domaine des contrats (assurance et prévoyance) représentant 71 réclamations (35 \%). Le milieu scolaire et périscolaire suivait avec 61 demandes (30 \%). Sur l'ensemble des demandes de certificat, 164 (80,8 \%) se sont avérées injustifiées ou illégales, et ont fait l'objet d'un courrier suivi d'échanges. Avec certitude, nous éviterons ainsi 3000 demandes par an dans le Nord. Nous espérons éviter entre 5000 et 10 000 demandes au terme de la démarche.
Conclusion
Cette étude inédite a permis de montrer que les médecins généralistes reçoivent un nombre considérable de demandes de certificats médicaux sans fondement légal, en particulier des assurances.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Rochoy, M. and Modson Tavaze, I. and Calafiore, M. and Platel, J-P. and Baran, J. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Certificats médicaux, Médecine générale, Temps médical},
	pages = {202225},
}

Introduction Le nombre de généralistes installés diminue et la population augmente et vieillit. Pour maintenir un accès aux soins suffisant, le temps médical doit donc être préservé, notamment en diminuant la charge administrative qui pèse sur les médecins. En moyenne, les médecins généralistes estiment passer 1h30 à 2h par semaine sur des certificats médicaux injustifiés. En mars 2023, le Collège de médecine générale a diffusé le site certificats-absurdes.fr pour mettre en lumière cette situation. Afin de renforcer cette initiative, nous avons mené une initiative en collaboration avec plusieurs Conseils départementaux de l'Ordre des Médecins (CDOM) visant à faire des rappels ciblés et personnalisés de la loi en vigueur sur les certificats médicaux, sur demande de médecins généralistes attachés à ces CDOM participant. L'objectif de notre travail de recherche était de décrire le motif des certificats médicaux sur une période de 100 jours et d'identifier les principaux demandeurs de certificats abusifs. Méthodes Nous avons réalisé une étude descriptive multicentrique sur tous les courriers de réclamation concernant des certificats médicaux reçus par les CDOM du Nord, des Ardennes, de l'Ariège, du Bas-Rhin, du Calvados, de l'Eure, du Gard, du Morbihan et du Territoire de Belfort. Les CDOM ont reçu les signalements de médecins concernant des demandes jugées abusives. Lorsque les demandes étaient illégales ou injustifiées, nous avons rédigé un courrier qui a été signé et envoyé par les CDOM aux organismes demandeurs. Résultats Les Conseils ont reçu un total de 203 réclamations, en majorité du département du Nord (76,4 %), adressées par 103 médecins (53 femmes et 50 hommes). Le plus grand nombre concernait le domaine des contrats (assurance et prévoyance) représentant 71 réclamations (35 %). Le milieu scolaire et périscolaire suivait avec 61 demandes (30 %). Sur l'ensemble des demandes de certificat, 164 (80,8 %) se sont avérées injustifiées ou illégales, et ont fait l'objet d'un courrier suivi d'échanges. Avec certitude, nous éviterons ainsi 3000 demandes par an dans le Nord. Nous espérons éviter entre 5000 et 10 000 demandes au terme de la démarche. Conclusion Cette étude inédite a permis de montrer que les médecins généralistes reçoivent un nombre considérable de demandes de certificats médicaux sans fondement légal, en particulier des assurances.

@article{lamer_difficultes_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Difficultés et barrières rencontrées avec les entrepôts de données de santé : recommandations d'une enquête auprès d'experts en réutilisation des données},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	shorttitle = {Difficultés et barrières rencontrées avec les entrepôts de données de santé},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000533},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202243},
	abstract = {Introduction
Au cours des 20 dernières années, les hôpitaux ont adopté et mis en place des entrepôts de données de santé (EDS) pour faciliter la réutilisation à des fins de recherche des données informatisées issues des logiciels administratifs et de soins. Cependant, la mise en place de ces EDS rencontre un ensemble de barrière éthiques, législatives, techniques, humaines et organisationnelles. Ce travail présente un aperçu des difficultés et des obstacles rencontrés dans les projets d'EDS et propose un ensemble de recommandations pour ce type de projet.
Méthodes
Nous avons organisé un atelier lors de la conférence « Medical Informatics in Europe 2023 » et avons invité des experts de la mise en place des EDS. Ces experts ont décrit leur EDS et les difficultés et obstacles rencontrés à chaque étape : (i) le lancement du projet de l'EDS, (ii) la mise en place de l'EDS et (iii) l'utilisation de l'EDS en routine. Ces difficultés ont été classées selon le « framework Systems Engineering Initiative for Patient Safety 2.0 framework » (SEIPS 2.0). Les experts ont également été invités à proposer des solutions qu'ils ont pu mettre en place pour surmonter les obstacles précédemment signalés.
Résultats
Après synthèse et consensus, 26 obstacles ont été identifiés, dont 10 concernaient les tâches, 5 les outils et les technologies, 4 les personnes, 4 l'organisation et 3 l'environnement externe. Une attention particulière doit être accordée à cinq barrières qui sont présentes tout au long du projet. De plus, le financement initial semble également constituer un obstacle majeur, les EDS étant souvent créés sans ressources dédiées. Pour relever ces défis, un ensemble de 15 recommandations pratiques est proposé, couvrant des aspects essentiels tels que la gouvernance, l'implication des participants au projet, la collaboration interdisciplinaire et l'utilisation d'expertises externes à l’établissement.
Conclusion
Ces recommandations constituent une ressource précieuse pour les établissements de santé souhaitant mettre en place et optimiser des EDS. Elles offrent un guide pour exploiter les données cliniques à des fins de recherche, d'amélioration de la qualité et d'amélioration des soins.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Lamer, A. and Popoff, B. and Delange, B. and Doutreligne, M. and Chazard, E. and Marcilly, R. and Priou, S. and Quindroit, P.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Barrières, Entrepôt de données, Recommandations, Réutilisation des données},
	pages = {202243},
}

Introduction Au cours des 20 dernières années, les hôpitaux ont adopté et mis en place des entrepôts de données de santé (EDS) pour faciliter la réutilisation à des fins de recherche des données informatisées issues des logiciels administratifs et de soins. Cependant, la mise en place de ces EDS rencontre un ensemble de barrière éthiques, législatives, techniques, humaines et organisationnelles. Ce travail présente un aperçu des difficultés et des obstacles rencontrés dans les projets d'EDS et propose un ensemble de recommandations pour ce type de projet. Méthodes Nous avons organisé un atelier lors de la conférence « Medical Informatics in Europe 2023 » et avons invité des experts de la mise en place des EDS. Ces experts ont décrit leur EDS et les difficultés et obstacles rencontrés à chaque étape : (i) le lancement du projet de l'EDS, (ii) la mise en place de l'EDS et (iii) l'utilisation de l'EDS en routine. Ces difficultés ont été classées selon le « framework Systems Engineering Initiative for Patient Safety 2.0 framework » (SEIPS 2.0). Les experts ont également été invités à proposer des solutions qu'ils ont pu mettre en place pour surmonter les obstacles précédemment signalés. Résultats Après synthèse et consensus, 26 obstacles ont été identifiés, dont 10 concernaient les tâches, 5 les outils et les technologies, 4 les personnes, 4 l'organisation et 3 l'environnement externe. Une attention particulière doit être accordée à cinq barrières qui sont présentes tout au long du projet. De plus, le financement initial semble également constituer un obstacle majeur, les EDS étant souvent créés sans ressources dédiées. Pour relever ces défis, un ensemble de 15 recommandations pratiques est proposé, couvrant des aspects essentiels tels que la gouvernance, l'implication des participants au projet, la collaboration interdisciplinaire et l'utilisation d'expertises externes à l’établissement. Conclusion Ces recommandations constituent une ressource précieuse pour les établissements de santé souhaitant mettre en place et optimiser des EDS. Elles offrent un guide pour exploiter les données cliniques à des fins de recherche, d'amélioration de la qualité et d'amélioration des soins.

@article{quindroit_analyse_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Analyse rétrospective des pratiques de soins infirmiers à domicile pour les patients atteints d'affections longue durée en en {France} en 2022},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324001757},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202365},
	abstract = {Introduction
Les affections longues durées (ALD) englobent un large spectre de maladies et de troubles chroniques qui impactent la vie de millions d'individus et exercent une pression substantielle sur les systèmes de santé et les ressources disponibles. L'objectif de cette étude est de décrire les activités des infirmiers à domicile français qui prodiguent des soins aux patients atteints d'ALD.
Méthodes
Nous avons extrait l'ensemble des actes infirmiers réalisés à domicile entre le 1er janvier 2022 et le 31 décembre 2022 pour des patients atteints d'ALD. Ces actes ont été catégorisées en fonction de leurs spécificités, telles que la réalisation d'actes médicaux infirmiers (AMI), d'actes infirmiers de soins (AIS) ou d'une démarche infirmiers (DI). Nous avons identifié les cinq ALD les plus fréquentes, et les actes infirmiers dont bénéficiaient ces patients.
Résultats
Un total de 15 821 917 patients a été identifié avec au moins une ALD en France en 2022. D'autre part, 17 098 901 patients ont bénéficié de soins infirmiers à domicile la même année. Parmi ceux-ci, 5 828 890 présentaient au moins une ALD (34,09 \%). Au sein de cette population, les hommes représentaient 47,18 \% des patients et l’âge médian (Q1;Q3) étaient de 71 [59 ; 80] ans. Les cinq ALD les plus fréquentes étaient le diabète (1 683 479 patients, 21,17 \%), les tumeurs malignes (1 465 674 patients, 18,42 \%), les insuffisances cardiaques sévères, troubles du rythme cardiaque sévères, maladies valvulaires cardiaques sévères, malformations cardiaques congénitales sévères (800 423 patients, 10,07 \%), les maladies coronariennes (731 817 patients, 9,20 \%), et les troubles psychiatriques (650 180 patients, 8,18 \%); 28,31 \% des patients présentaient plus d'une ALD. Ces patients ont bénéficié de 546 876 818 actes de soins infirmiers, comprenant les AMI (n=427 135 798, 78,10 \%), les AIS (n=119 079 980, 21,77 \%), et les DI (n=661 040, 0,13 \%). Les patients atteints des cinq ALD les plus fréquentes bénéficiaient de 450 683 169 actes infirmiers, soit 62,67 \% de ces actes
Conclusion
Les infirmiers à domicile jouent un rôle crucial dans la prise en soins des patients atteints d'ALD, offrant des soins essentiels aux patients atteints de maladies chroniques. Cette étude souligne l'importance des infirmiers dans la prévention des maladies chroniques et pour des stratégies de soins personnalisées et plus efficaces.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Quindroit, P. and Teston, A. and Milleville, N. and Chazard, E. and Saint-Dizier, C. and Lamer, A.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Affections longues durées, SNDS, Soins infirmiers à domicile},
	pages = {202365},
}

Introduction Les affections longues durées (ALD) englobent un large spectre de maladies et de troubles chroniques qui impactent la vie de millions d'individus et exercent une pression substantielle sur les systèmes de santé et les ressources disponibles. L'objectif de cette étude est de décrire les activités des infirmiers à domicile français qui prodiguent des soins aux patients atteints d'ALD. Méthodes Nous avons extrait l'ensemble des actes infirmiers réalisés à domicile entre le 1er janvier 2022 et le 31 décembre 2022 pour des patients atteints d'ALD. Ces actes ont été catégorisées en fonction de leurs spécificités, telles que la réalisation d'actes médicaux infirmiers (AMI), d'actes infirmiers de soins (AIS) ou d'une démarche infirmiers (DI). Nous avons identifié les cinq ALD les plus fréquentes, et les actes infirmiers dont bénéficiaient ces patients. Résultats Un total de 15 821 917 patients a été identifié avec au moins une ALD en France en 2022. D'autre part, 17 098 901 patients ont bénéficié de soins infirmiers à domicile la même année. Parmi ceux-ci, 5 828 890 présentaient au moins une ALD (34,09 %). Au sein de cette population, les hommes représentaient 47,18 % des patients et l’âge médian (Q1;Q3) étaient de 71 [59 ; 80] ans. Les cinq ALD les plus fréquentes étaient le diabète (1 683 479 patients, 21,17 %), les tumeurs malignes (1 465 674 patients, 18,42 %), les insuffisances cardiaques sévères, troubles du rythme cardiaque sévères, maladies valvulaires cardiaques sévères, malformations cardiaques congénitales sévères (800 423 patients, 10,07 %), les maladies coronariennes (731 817 patients, 9,20 %), et les troubles psychiatriques (650 180 patients, 8,18 %); 28,31 % des patients présentaient plus d'une ALD. Ces patients ont bénéficié de 546 876 818 actes de soins infirmiers, comprenant les AMI (n=427 135 798, 78,10 %), les AIS (n=119 079 980, 21,77 %), et les DI (n=661 040, 0,13 %). Les patients atteints des cinq ALD les plus fréquentes bénéficiaient de 450 683 169 actes infirmiers, soit 62,67 % de ces actes Conclusion Les infirmiers à domicile jouent un rôle crucial dans la prise en soins des patients atteints d'ALD, offrant des soins essentiels aux patients atteints de maladies chroniques. Cette étude souligne l'importance des infirmiers dans la prévention des maladies chroniques et pour des stratégies de soins personnalisées et plus efficaces.

@article{tivol_contraception_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Contraception définitive chez la femme jeune : une demande croissante et des regrets très fréquents dans la base nationale du {PMSI}},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	shorttitle = {Contraception définitive chez la femme jeune},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324001162},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202306},
	abstract = {Introduction
La ligature des trompes de Fallope permet chez la femme une contraception définitive. Cette pratique semble concerner deux sous-populations types : des multipares et, plus récemment, de jeunes nullipares pour lesquelles l'acte s'inscrit dans une démarche militante. La littérature scientifique montre que cette deuxième sous-population est susceptible de regretter par la suite sa demande. Notre objectif est de décrire l’évolution de cette pratique, et d'objectiver le regret à travers l'incidence d'actes permettant l'accès potentiel à une fécondité secondaire par le biais de la fécondation in vitro (FIV) ou de l'anastomose tubo-tubaire.
Méthodes
Nous avons analysé la base nationale du PMSI de 2013 à 2022. Nous avons inclus les séjours de femmes de 18 à 60 ans avec acte de ligature des trompes. Nous avons ensuite recherché dans tous les établissements la réalisation d'actes d'anastomose tubo-tubaire ou d'actes en relation avec une FIV. Ces événements sont analysés en survie.
Résultats
Le nombre total d'actes réalisés annuellement décroît fortement, de 43 449 en 2013 à 18 634 en 2022 (-57,1 \%). L’âge moyen est de 39,9 ans (SD=4,4) mais décroît de 40,9 ans en 2013 à 38,2 ans en 2022 (p=0). Par exemple, de 2013 à 2022, le nombre de patientes de 18 à 24 ans augmente significativement, de 41 à 152 (0,09 \% à 0,82 \%, p=0), et le nombre de patientes de 25 à 29 ans également, de 327 à 759 (0,75 \% à 4,07 \%, p=0). Les réversions sont des FIV (81,0 \%) et des anastomoses tubo-tubaires (19,0 \%). L’âge de la patiente est un facteur majeur (p=0). Par exemple, chez les 18-24 ans, la proportion cumulée de réversion est 4,7 \% à 1 an, 6,5 \% à 2 ans et 7,3 \% à 3 ans (hazard ratio=125 [86,7 ; 181] par rapport aux 40 ans et plus). Chez les 25-29 ans, la proportion cumulée de réversion est de 3,0 \% à 1 an, 3,7 \% à 2 ans et 4,5 \% à 3 ans (hazard ratio=76,5 [60,7 ; 96,3]).
Conclusion
Bien que l'activité totale de contraception féminine définitive décroisse, la demande augmente chez les jeunes femmes. Les tranches d’âge correspondantes sont associées à une très forte proportion d'hospitalisation pour réversion. Nous n'avons ici quantifié que les hospitalisations, mais le regret réel est peut-être plus important. Certains profils devraient être mieux identifiés, afin de les alerter sur le caractère définitif de l'intervention, et le caractère peut-être éphémère de leur demande.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Tivol, C. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {FIV, Femme jeune, Ligature tubaire, Regret},
	pages = {202306},
}

Introduction La ligature des trompes de Fallope permet chez la femme une contraception définitive. Cette pratique semble concerner deux sous-populations types : des multipares et, plus récemment, de jeunes nullipares pour lesquelles l'acte s'inscrit dans une démarche militante. La littérature scientifique montre que cette deuxième sous-population est susceptible de regretter par la suite sa demande. Notre objectif est de décrire l’évolution de cette pratique, et d'objectiver le regret à travers l'incidence d'actes permettant l'accès potentiel à une fécondité secondaire par le biais de la fécondation in vitro (FIV) ou de l'anastomose tubo-tubaire. Méthodes Nous avons analysé la base nationale du PMSI de 2013 à 2022. Nous avons inclus les séjours de femmes de 18 à 60 ans avec acte de ligature des trompes. Nous avons ensuite recherché dans tous les établissements la réalisation d'actes d'anastomose tubo-tubaire ou d'actes en relation avec une FIV. Ces événements sont analysés en survie. Résultats Le nombre total d'actes réalisés annuellement décroît fortement, de 43 449 en 2013 à 18 634 en 2022 (-57,1 %). L’âge moyen est de 39,9 ans (SD=4,4) mais décroît de 40,9 ans en 2013 à 38,2 ans en 2022 (p=0). Par exemple, de 2013 à 2022, le nombre de patientes de 18 à 24 ans augmente significativement, de 41 à 152 (0,09 % à 0,82 %, p=0), et le nombre de patientes de 25 à 29 ans également, de 327 à 759 (0,75 % à 4,07 %, p=0). Les réversions sont des FIV (81,0 %) et des anastomoses tubo-tubaires (19,0 %). L’âge de la patiente est un facteur majeur (p=0). Par exemple, chez les 18-24 ans, la proportion cumulée de réversion est 4,7 % à 1 an, 6,5 % à 2 ans et 7,3 % à 3 ans (hazard ratio=125 [86,7 ; 181] par rapport aux 40 ans et plus). Chez les 25-29 ans, la proportion cumulée de réversion est de 3,0 % à 1 an, 3,7 % à 2 ans et 4,5 % à 3 ans (hazard ratio=76,5 [60,7 ; 96,3]). Conclusion Bien que l'activité totale de contraception féminine définitive décroisse, la demande augmente chez les jeunes femmes. Les tranches d’âge correspondantes sont associées à une très forte proportion d'hospitalisation pour réversion. Nous n'avons ici quantifié que les hospitalisations, mais le regret réel est peut-être plus important. Certains profils devraient être mieux identifiés, afin de les alerter sur le caractère définitif de l'intervention, et le caractère peut-être éphémère de leur demande.

@article{chazard_generation_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Génération de bases de données fictives pour libérer la recherche en santé},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S295043332400048X},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202238},
	abstract = {Introduction
La réutilisation de données est un enjeu majeur en santé. Les recherches appliquées comme méthodologique devraient pouvoir accéder à des données de santé. En protégeant les citoyens, la législation française freine cependant ces recherches, et empêche l'application des principes FAIR. Notre objectif est de générer des jeux de données fictives très réalistes, permettant aux recherches appliquées d'obtenir les mêmes résultats que sur des données réelles, et aux recherches méthodologiques d'être compatibles avec les données de santé.
Méthodes
La SFR Technologies de santé et médicament a obtenu le financement du CPER Tec'Santé, dont la plateforme e-Santé est spécifiquement dédiée à la génération et la diffusion de bases de données de santé fictives mais très réalistes.
Résultats
Nous présenterons ici les méthodes actuellement développées pour générer de telles données, en prenant l'exemple d'un jeu de données intra-hospitalières (PMSI, médicament prescrits, résultats d'analyses de biologie médicale). Nous présenterons les méthodes et résultats préliminaires d'évaluation sur trois axes : - Qualité : un expert peut-il distinguer les données réelles des données simulées ? - Utilisabilité : les résultats d'analyse statistique obtenus sur données simulées sont-ils identiques à ceux sur données réelles ? - Sécurité ressentie : un « hacker » qui analyse les données simulées peut-il croire identifier des personnes réelles ?
Conclusion
La génération de jeux de données synthétiques, ou populations jumelles numériques, ou « twin datasets », devrait lever deux familles de verrous. Premièrement, elle pourrait permettre à des chercheurs du monde entier de mieux étudier les phénomènes de santé des Français (et pas seulement des USA), que ces chercheurs soient des professionnels désirant éprouver des concepts avant d'accéder aux données réelles, ou des étudiants. Deuxièmement, elle devrait permettre à des chercheurs méthodologistes de mieux comprendre les données de santé, et mettre au point des méthodes applicables aux données de santé, plus complexes que dans d'autres champs (importance des variables catégorielles, taille des terminologies, données manquantes, hétérogénéité, complexité, etc.).},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Chazard, E. and Lenain, R. and Ficheur, G. and Beuscart, J-B.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Données synthétiques, Jumeaux numériques, Tigital twin},
	pages = {202238},
}

Introduction La réutilisation de données est un enjeu majeur en santé. Les recherches appliquées comme méthodologique devraient pouvoir accéder à des données de santé. En protégeant les citoyens, la législation française freine cependant ces recherches, et empêche l'application des principes FAIR. Notre objectif est de générer des jeux de données fictives très réalistes, permettant aux recherches appliquées d'obtenir les mêmes résultats que sur des données réelles, et aux recherches méthodologiques d'être compatibles avec les données de santé. Méthodes La SFR Technologies de santé et médicament a obtenu le financement du CPER Tec'Santé, dont la plateforme e-Santé est spécifiquement dédiée à la génération et la diffusion de bases de données de santé fictives mais très réalistes. Résultats Nous présenterons ici les méthodes actuellement développées pour générer de telles données, en prenant l'exemple d'un jeu de données intra-hospitalières (PMSI, médicament prescrits, résultats d'analyses de biologie médicale). Nous présenterons les méthodes et résultats préliminaires d'évaluation sur trois axes : - Qualité : un expert peut-il distinguer les données réelles des données simulées ? - Utilisabilité : les résultats d'analyse statistique obtenus sur données simulées sont-ils identiques à ceux sur données réelles ? - Sécurité ressentie : un « hacker » qui analyse les données simulées peut-il croire identifier des personnes réelles ? Conclusion La génération de jeux de données synthétiques, ou populations jumelles numériques, ou « twin datasets », devrait lever deux familles de verrous. Premièrement, elle pourrait permettre à des chercheurs du monde entier de mieux étudier les phénomènes de santé des Français (et pas seulement des USA), que ces chercheurs soient des professionnels désirant éprouver des concepts avant d'accéder aux données réelles, ou des étudiants. Deuxièmement, elle devrait permettre à des chercheurs méthodologistes de mieux comprendre les données de santé, et mettre au point des méthodes applicables aux données de santé, plus complexes que dans d'autres champs (importance des variables catégorielles, taille des terminologies, données manquantes, hétérogénéité, complexité, etc.).

@article{lamer__2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {« {Data} {Lake}, {Data} {Warehouse}, {Datamart} and {Feature} {Store} » - {Contributions} au {Pipeline} de réutilisation des données},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000557},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202245},
	abstract = {Introduction
Les hôpitaux ont progressivement adopté les entrepôts de données de santé pour faciliter la réutilisation des données à des fins de recherche. Cependant, la réutilisation des données ne se limite pas à l'alimentation et à l'interrogation d'un entrepôt de données. L'objectif de ce travail est de présenter les différents composants du pipeline de réutilisation des données, et comment ils se complètent et interagissent entre eux.
Méthodes
Trois « data scientists » et un médecin ont comparé leurs expériences afin de proposer un pipeline intégrant les composants essentiels ou optionnels afin de faciliter la réutilisation des données pour la recherche en santé.
Résultats
Le « data lake » est un premier élément possible du pipeline. Il stocke à la fois les données sources et les métadonnées dans un format brut et détaillé et permet l'exploration et la manipulation des données pour répondre à des besoins analytiques spécifiques. L'entrepôt de données se présente comme le composant le plus répandu, recevant les données brutes directement des logiciels ou du « data lake ». Il est alimenté par le processus ETL (« Extract-Transform-Load ») qui nettoie les données brutes, puis les intègre dans un modèle de données unique, indépendant des logiciels. L'entrepôt de données fonctionne comme un référentiel unifié, centralisé et normalisé de données historiques détaillées. Pour favoriser la collaboration entre les institutions, l'entrepôt de données peut adopter un modèle de données commun et standardiser la structure des données et les terminologies. À ce stade, les données sont encore stockées dans des tables multidimensionnelles avec un format orienté ligne. À la suite, les datamarts transforment les données complexes en informations exploitables adaptées à des questions spécifiques. Ce processus est souvent désigné sous le terme de « feature extraction ». Un dernier composant, le « feature store », est essentiel pour présenter les « features » au format colonne et limiter les requêtes à des sélections de colonnes et d'enregistrements afin de les simplifier.
Conclusion
Bien que les entrepôts de données soient cruciaux, les « data lakes », « datamarts » et « feature stores » jouent des rôles essentiels et complémentaires dans la facilitation de la réutilisation des données pour la recherche en santé.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Lamer, A. and Saint-Dizier, C. and Paris, N. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Entrepôt de données, Extraction de caractéristiques, Réutilisation des données},
	pages = {202245},
}

Introduction Les hôpitaux ont progressivement adopté les entrepôts de données de santé pour faciliter la réutilisation des données à des fins de recherche. Cependant, la réutilisation des données ne se limite pas à l'alimentation et à l'interrogation d'un entrepôt de données. L'objectif de ce travail est de présenter les différents composants du pipeline de réutilisation des données, et comment ils se complètent et interagissent entre eux. Méthodes Trois « data scientists » et un médecin ont comparé leurs expériences afin de proposer un pipeline intégrant les composants essentiels ou optionnels afin de faciliter la réutilisation des données pour la recherche en santé. Résultats Le « data lake » est un premier élément possible du pipeline. Il stocke à la fois les données sources et les métadonnées dans un format brut et détaillé et permet l'exploration et la manipulation des données pour répondre à des besoins analytiques spécifiques. L'entrepôt de données se présente comme le composant le plus répandu, recevant les données brutes directement des logiciels ou du « data lake ». Il est alimenté par le processus ETL (« Extract-Transform-Load ») qui nettoie les données brutes, puis les intègre dans un modèle de données unique, indépendant des logiciels. L'entrepôt de données fonctionne comme un référentiel unifié, centralisé et normalisé de données historiques détaillées. Pour favoriser la collaboration entre les institutions, l'entrepôt de données peut adopter un modèle de données commun et standardiser la structure des données et les terminologies. À ce stade, les données sont encore stockées dans des tables multidimensionnelles avec un format orienté ligne. À la suite, les datamarts transforment les données complexes en informations exploitables adaptées à des questions spécifiques. Ce processus est souvent désigné sous le terme de « feature extraction ». Un dernier composant, le « feature store », est essentiel pour présenter les « features » au format colonne et limiter les requêtes à des sélections de colonnes et d'enregistrements afin de les simplifier. Conclusion Bien que les entrepôts de données soient cruciaux, les « data lakes », « datamarts » et « feature stores » jouent des rôles essentiels et complémentaires dans la facilitation de la réutilisation des données pour la recherche en santé.

@article{lamer_augmentation_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Augmentation persistante de la consommation de psychotropes chez les jeunes femmes suite à la pandémie de {COVID}-19},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000922},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202282},
	abstract = {Introduction
En France, tout comme dans de nombreux autres pays, la pandémie de COVID-19 a été associée à une augmentation des troubles mentaux, notamment l'anxiété, la dépression, le stress post-traumatique et les pensées suicidaires. Plusieurs études ont signalé une hausse de l'utilisation d'anxiolytiques, d'antidépresseurs et d'hypnotiques en France après la période de confinement. L'objectif de cette étude était d'explorer si les accroissements préalablement constatés dans la consommation de médicaments psychotropes ont persisté en 2022 en France.
Méthodes
Nous avons mené une étude rétrospective à partir du Système national des données de santé. Nous avons inclus les délivrances hebdomadaires de psychotropes du 1er janvier 2015 au 31 décembre 2022. Le nombre d'individus recevant au moins une boîte par semaine a été considéré comme une série temporelle. A partir d'une régression de Poisson, nous avons calculé la pente avant le confinement, l'impact du confinement, ainsi que la variation de pente après le confinement pour différentes tranches d'âge et par genre.
Résultats
Les patients âgés de 12 à 18 ans ont enregistré le changement de dynamique le plus important traduisant une augmentation à long terme de consommation d'antidépresseurs, d'anxiolytiques et d'hypnotiques. Ils sont suivis par les 19-25 ans pour les antidépresseurs et les anxiolytiques. Les femmes ont été davantage touchées que les hommes par l'augmentation du nombre de délivrances d'antidépresseurs et d'anxiolytiques dans ces deux classes d’âge.
Conclusion
Les résultats de cette étude soulignent l'impact significatif à long terme de la pandémie de COVID-19 sur la santé mentale, en mettant en évidence une augmentation marquée de la consommation de psychotropes, notamment chez les jeunes. Cette augmentation inquiétante, particulièrement chez les adolescents et les jeunes adultes, appelle à des actions ciblées en matière de santé mentale et à une réponse proactive de la santé publique pour répondre aux besoins croissants de ces populations vulnérables. Des mesures préventives et des interventions adaptées devraient être envisagées pour atténuer les effets à long terme de cette crise sanitaire sur la santé mentale de la population.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Lamer, A. and Saint-Dizier, C. and Ayed, E. and Levaillant, M. and Hamel, J-F. and Chazard, E. and Bubrovszky, M. and Horn, M.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Antidépresseurs, COVID-19, Psychiatrie, Psychotropes, Santé mentale},
	pages = {202282},
}

Introduction En France, tout comme dans de nombreux autres pays, la pandémie de COVID-19 a été associée à une augmentation des troubles mentaux, notamment l'anxiété, la dépression, le stress post-traumatique et les pensées suicidaires. Plusieurs études ont signalé une hausse de l'utilisation d'anxiolytiques, d'antidépresseurs et d'hypnotiques en France après la période de confinement. L'objectif de cette étude était d'explorer si les accroissements préalablement constatés dans la consommation de médicaments psychotropes ont persisté en 2022 en France. Méthodes Nous avons mené une étude rétrospective à partir du Système national des données de santé. Nous avons inclus les délivrances hebdomadaires de psychotropes du 1er janvier 2015 au 31 décembre 2022. Le nombre d'individus recevant au moins une boîte par semaine a été considéré comme une série temporelle. A partir d'une régression de Poisson, nous avons calculé la pente avant le confinement, l'impact du confinement, ainsi que la variation de pente après le confinement pour différentes tranches d'âge et par genre. Résultats Les patients âgés de 12 à 18 ans ont enregistré le changement de dynamique le plus important traduisant une augmentation à long terme de consommation d'antidépresseurs, d'anxiolytiques et d'hypnotiques. Ils sont suivis par les 19-25 ans pour les antidépresseurs et les anxiolytiques. Les femmes ont été davantage touchées que les hommes par l'augmentation du nombre de délivrances d'antidépresseurs et d'anxiolytiques dans ces deux classes d’âge. Conclusion Les résultats de cette étude soulignent l'impact significatif à long terme de la pandémie de COVID-19 sur la santé mentale, en mettant en évidence une augmentation marquée de la consommation de psychotropes, notamment chez les jeunes. Cette augmentation inquiétante, particulièrement chez les adolescents et les jeunes adultes, appelle à des actions ciblées en matière de santé mentale et à une réponse proactive de la santé publique pour répondre aux besoins croissants de ces populations vulnérables. Des mesures préventives et des interventions adaptées devraient être envisagées pour atténuer les effets à long terme de cette crise sanitaire sur la santé mentale de la population.

@article{devloies_formation_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Formation médicale des ingénieurs concevant des dispositifs médicaux : conception d'un référentiel de formation avec le logiciel {Protégé}},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	shorttitle = {Formation médicale des ingénieurs concevant des dispositifs médicaux},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000375},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202227},
	abstract = {Introduction
Les dispositifs médicaux (DM) sont omniprésents dans la pratique médicale et sont utilisés à des fins multiples : diagnostique, pronostique, thérapeutique et dans la prévention. La plupart des DM sont conçus par des ingénieurs biomédicaux dont le cursus contient peu de formation en sciences médicales. Notre objectif est de créer un référentiel de formation médicale pour les ingénieurs concevant les DM.
Méthodes
Dans le but d’établir une liste de dispositifs médicaux pertinents à traiter, nous avons analysé les montants de remboursement de la liste des produits et prestations (LPP) et de la liste des actes techniques d'imagerie de la classification commune des actes médicaux (CCAM) établies par la sécurité sociale. Nous avons obtenu une liste de 45 catégories de DM incluant 69 DM. Pour chaque DM, nous avons imaginé une démarche inductive basée sur le programme du 2éme cycle des études médicales et notre avis d'expert. Le raisonnement est le suivant : on part d'un dispositif médical. On identifie un groupe de pathologies pour lesquelles il est utilisé. Ensuite on définit les éléments de physiologie se rapportant aux pathologies citées. Pour finir, on développe les éléments anatomiques utiles aux notions de physiologie. Afin de rendre le référentiel accessible, nous avons choisi de le concevoir sous forme d'ontologie que nous avons implémentée à l'aide du logiciel Protégé.
Résultats
Nous avons construit une ontologie en langage OWL comprenant un total de 69 DM, 61 pathologies, 42 notions de physiologie et 61 éléments anatomiques. Tous ces éléments sont reliés entre eux par 930 « axioms ». Elle se compose à 80 \% de termes MeSH. Extraite en langage XML, l'ontologie représente 4111 lignes de codes pour une taille de 199ko.
Conclusion
Nous avons élaboré un référentiel de formation médicale pour les ingénieurs sous forme d'ontologie avec le logiciel Protégé. Ne se voulant pas exhaustif, il cherche à couvrir les éléments les plus importants à traiter au regard des montants de remboursement des DM en France et permet à son utilisateur de prioriser les éléments à enseigner afin d’élaborer un plan de formation.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Devloies, P. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Dispositifs médicaux, Formation médicale, Ingénieurs biomédicaux, Protégé},
	pages = {202227},
}

Introduction Les dispositifs médicaux (DM) sont omniprésents dans la pratique médicale et sont utilisés à des fins multiples : diagnostique, pronostique, thérapeutique et dans la prévention. La plupart des DM sont conçus par des ingénieurs biomédicaux dont le cursus contient peu de formation en sciences médicales. Notre objectif est de créer un référentiel de formation médicale pour les ingénieurs concevant les DM. Méthodes Dans le but d’établir une liste de dispositifs médicaux pertinents à traiter, nous avons analysé les montants de remboursement de la liste des produits et prestations (LPP) et de la liste des actes techniques d'imagerie de la classification commune des actes médicaux (CCAM) établies par la sécurité sociale. Nous avons obtenu une liste de 45 catégories de DM incluant 69 DM. Pour chaque DM, nous avons imaginé une démarche inductive basée sur le programme du 2éme cycle des études médicales et notre avis d'expert. Le raisonnement est le suivant : on part d'un dispositif médical. On identifie un groupe de pathologies pour lesquelles il est utilisé. Ensuite on définit les éléments de physiologie se rapportant aux pathologies citées. Pour finir, on développe les éléments anatomiques utiles aux notions de physiologie. Afin de rendre le référentiel accessible, nous avons choisi de le concevoir sous forme d'ontologie que nous avons implémentée à l'aide du logiciel Protégé. Résultats Nous avons construit une ontologie en langage OWL comprenant un total de 69 DM, 61 pathologies, 42 notions de physiologie et 61 éléments anatomiques. Tous ces éléments sont reliés entre eux par 930 « axioms ». Elle se compose à 80 % de termes MeSH. Extraite en langage XML, l'ontologie représente 4111 lignes de codes pour une taille de 199ko. Conclusion Nous avons élaboré un référentiel de formation médicale pour les ingénieurs sous forme d'ontologie avec le logiciel Protégé. Ne se voulant pas exhaustif, il cherche à couvrir les éléments les plus importants à traiter au regard des montants de remboursement des DM en France et permet à son utilisateur de prioriser les éléments à enseigner afin d’élaborer un plan de formation.

@article{gerard_hyperkaliemies_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Hyperkaliémies au cours d'un séjour à l'hôpital : travaux exploratoires préalables à leur prévention par une approche associant avis expert et intelligence artificielle},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	shorttitle = {Hyperkaliémies au cours d'un séjour à l'hôpital},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000570},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202247},
	abstract = {Introduction
L'hyperkaliémie est associée à une augmentation importante du taux de mortalité. Des logiciels, appelés systèmes d'aide à la décision médicale (CDSS) existent et permettent d'alerter sur les risques d’évènements indésirables mais, la multiplication des alertes (« over-alerting ») engendre une perte de pertinence de ces alertes. Les données collectées au cours des séjours hospitaliers constituent une base de données de santé et peuvent être utilisées pour analyser les évènements indésirables médicamenteux de façon rétrospective par des méthodes de « data-mining » dans le but de définir des règles d'alerte pour prévenir ces évènements.
Méthodes
Les données de 15 000 séjours hospitaliers ont été simulées dans le cadre du CPER Tec'Santé, sur la base de séjours hospitaliers réels. Des caractéristiques potentiellement associées avec une hyperkaliémie ont été sélectionnées dans les séjours à partir des résultats de biologie, des codes ATC des médicaments, de la classification CIM-10 des diagnostics et des codes actes de la CCAM. Trois méthodes d'analyses statistiques ont été comparées : des analyses bivariées de comparaisons de moyennes ou de proportions, un modèle de régression logistique pas-à-pas descendant et un modèle de « Classification and Regression Tree » (CART).
Résultats
Ces travaux exploratoires ont permis de mettre en évidence des caractéristiques potentiellement associées à l'hyperkaliémie. Ainsi, 22 caractéristiques ont été mises en évidence par régression logistique. L'utilisation de CART a permis de calculer la probabilité d'apparition des évènements parmi les 15 000 séjours dont 1,49 \% présentent un évènement d'hyperkaliémie; ainsi que la possibilité de déterminer des règles de prévention des hyperkaliémies chez les patients remplissant certaines conditions, par exemple : si administration de médicaments de l'hyperkaliémie et de l'hyperphosphatémie et absence administration de l'angiotensine ii et hyponatrémie et durée de séjour supérieure ou égale à 1,5 jour alors la proportion d'hyperkaliémie est de 50,7 \% (parmi 69 cas).
Conclusion
Les modèles de CART permettent de définir des règles de détection des évènements indésirables à partir de réutilisation des données de santé qui pourrait être implémentées dans des logiciels d'aide à la décision. Cependant, ces travaux doivent être confirmés sur des données réelles.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Gérard, E. and Lenain, R. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Classification and regression tree, Clinical Decision Support System, Data-reuse},
	pages = {202247},
}

Introduction L'hyperkaliémie est associée à une augmentation importante du taux de mortalité. Des logiciels, appelés systèmes d'aide à la décision médicale (CDSS) existent et permettent d'alerter sur les risques d’évènements indésirables mais, la multiplication des alertes (« over-alerting ») engendre une perte de pertinence de ces alertes. Les données collectées au cours des séjours hospitaliers constituent une base de données de santé et peuvent être utilisées pour analyser les évènements indésirables médicamenteux de façon rétrospective par des méthodes de « data-mining » dans le but de définir des règles d'alerte pour prévenir ces évènements. Méthodes Les données de 15 000 séjours hospitaliers ont été simulées dans le cadre du CPER Tec'Santé, sur la base de séjours hospitaliers réels. Des caractéristiques potentiellement associées avec une hyperkaliémie ont été sélectionnées dans les séjours à partir des résultats de biologie, des codes ATC des médicaments, de la classification CIM-10 des diagnostics et des codes actes de la CCAM. Trois méthodes d'analyses statistiques ont été comparées : des analyses bivariées de comparaisons de moyennes ou de proportions, un modèle de régression logistique pas-à-pas descendant et un modèle de « Classification and Regression Tree » (CART). Résultats Ces travaux exploratoires ont permis de mettre en évidence des caractéristiques potentiellement associées à l'hyperkaliémie. Ainsi, 22 caractéristiques ont été mises en évidence par régression logistique. L'utilisation de CART a permis de calculer la probabilité d'apparition des évènements parmi les 15 000 séjours dont 1,49 % présentent un évènement d'hyperkaliémie; ainsi que la possibilité de déterminer des règles de prévention des hyperkaliémies chez les patients remplissant certaines conditions, par exemple : si administration de médicaments de l'hyperkaliémie et de l'hyperphosphatémie et absence administration de l'angiotensine ii et hyponatrémie et durée de séjour supérieure ou égale à 1,5 jour alors la proportion d'hyperkaliémie est de 50,7 % (parmi 69 cas). Conclusion Les modèles de CART permettent de définir des règles de détection des évènements indésirables à partir de réutilisation des données de santé qui pourrait être implémentées dans des logiciels d'aide à la décision. Cependant, ces travaux doivent être confirmés sur des données réelles.

@article{demesmaeker_facteurs_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Facteurs de risque de récidive et de suicide dans les six mois après une tentative de suicide dans la cohorte {ALGOS} : une analyse par arbre de survie},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	shorttitle = {Facteurs de risque de récidive et de suicide dans les six mois après une tentative de suicide dans la cohorte {ALGOS}},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324001289},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202318},
	abstract = {Introduction
La compréhension de l'interaction entre les facteurs de risque de tentative de suicide (TS) et de suicide est cruciale pour le développement de plans de prévention efficace. L'objectif de cette étude est de fournir aux cliniciens un modèle prédictif simple du risque de TS et de suicide dans les 6 mois après une TS.
Méthodes
Une cohorte prospective de 972 sujets, a été incluse du 26 janvier 2010 au 28 février 2013, dans 23 services d'urgences en France, dans les sept jours suivant une TS. Nous avons réalisé une analyse par arbre de survie avec toutes les variables sociodémographiques et cliniques disponibles à l'inclusion (méthode de TS, diagnostic psychiatrique via quatre items du MINI et échelle d'intentionnalité suicidaire de Beck). Les résultats de l'arbre de décision ont ensuite été utilisés pour définir un algorithme prédictif simple pour les cliniciens.
Résultats
La cohorte était composée de 63,6 \% de femmes et la moyenne d'âge était de 38 ans. Les résultats de l'arbre de survie ont mis en évidence trois sous-groupes de patients présentant un risque accru de récidive de TS ou de décès par suicide dans les six mois après la TS : 1) les patients présentant un trouble de l'usage de l'alcool (TUA) et une TS antérieure avec une consommation aiguë d'alcool (rapport de risque [RR]=2,92 ; IC 95 \%, 2,08 à 4,10), 2) les patients sans TUA, ayant fait 1 ou 2 TS et souffrant de troubles anxieux (RR=0,98 ; IC 95 \%, 0,69 à 1,39), et 3) les patients sans TUA et ayant des antécédents de plus de 2 TS au cours des trois dernières années (RR=2,11 ; IC à 95 \%, 1,25 à 3,54). Le groupe de bon pronostic comprenait tous les autres patients.
Conclusion
En utilisant une méthode data-driven, cette étude a identifié quatre facteurs cliniques qui interagissent ensemble pour réduire ou augmenter le risque de récidive. Ces combinaisons de facteurs de risque permettent une meilleure évaluation du risque d'un sujet dans la pratique clinique.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Demesmaeker, A. and Chazard, E. and Vaiva, G. and Amad, A.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Epidémiologie, Suicide, Tentative de suicide},
	pages = {202318},
}

Introduction La compréhension de l'interaction entre les facteurs de risque de tentative de suicide (TS) et de suicide est cruciale pour le développement de plans de prévention efficace. L'objectif de cette étude est de fournir aux cliniciens un modèle prédictif simple du risque de TS et de suicide dans les 6 mois après une TS. Méthodes Une cohorte prospective de 972 sujets, a été incluse du 26 janvier 2010 au 28 février 2013, dans 23 services d'urgences en France, dans les sept jours suivant une TS. Nous avons réalisé une analyse par arbre de survie avec toutes les variables sociodémographiques et cliniques disponibles à l'inclusion (méthode de TS, diagnostic psychiatrique via quatre items du MINI et échelle d'intentionnalité suicidaire de Beck). Les résultats de l'arbre de décision ont ensuite été utilisés pour définir un algorithme prédictif simple pour les cliniciens. Résultats La cohorte était composée de 63,6 % de femmes et la moyenne d'âge était de 38 ans. Les résultats de l'arbre de survie ont mis en évidence trois sous-groupes de patients présentant un risque accru de récidive de TS ou de décès par suicide dans les six mois après la TS : 1) les patients présentant un trouble de l'usage de l'alcool (TUA) et une TS antérieure avec une consommation aiguë d'alcool (rapport de risque [RR]=2,92 ; IC 95 %, 2,08 à 4,10), 2) les patients sans TUA, ayant fait 1 ou 2 TS et souffrant de troubles anxieux (RR=0,98 ; IC 95 %, 0,69 à 1,39), et 3) les patients sans TUA et ayant des antécédents de plus de 2 TS au cours des trois dernières années (RR=2,11 ; IC à 95 %, 1,25 à 3,54). Le groupe de bon pronostic comprenait tous les autres patients. Conclusion En utilisant une méthode data-driven, cette étude a identifié quatre facteurs cliniques qui interagissent ensemble pour réduire ou augmenter le risque de récidive. Ces combinaisons de facteurs de risque permettent une meilleure évaluation du risque d'un sujet dans la pratique clinique.

@article{leblanc_utilisation_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Utilisation du thésaurus {MeSH} associé à des mots du texte par rapport à l'utilisation de mots du texte seuls - {Une} analyse comparative des requêtes {PubMed} issues de revues systématiques},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000491},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202239},
	abstract = {Introduction
L'augmentation prononcée du nombre de publications renforce les connaissances scientifiques et médicales mais rend plus complexe la synthèse des résultats de la recherche scientifique. Le thésaurus MeSH a été créé au milieu du XXe siècle dans le but de systématiser l'indexation et de faciliter la récupération des articles scientifiques. Malgré l'avènement des moteurs de recherche par termes libres, peu d'études ont remis en question la pertinence du thésaurus MeSH, et aucune ne l'a fait de manière systématique. L'objectif de notre étude était de mesurer l'apport du thésaurus MeSH dans les requêtes PubMed construites pour des revues systématiques (RS) de la littérature.
Méthodes
Nous avons sélectionné l'ensemble des RS publiées dans quatre journaux prestigieux entre 2012 et 2021 et pour lesquelles une requête PubMed a été fournie. Chaque requête originale (V1) a été transformée pour obtenir une version contenant uniquement des mots du texte (V2) et une version contenant uniquement des termes MeSH (V3). Les trois requêtes ont été comparées en termes de sensibilité et de valeur prédictive positive (VPP).
Résultats
Au total, 70 RS ont été incluses. Trois requêtes V1 (4,3 \%) ne contenaient que des termes MeSH, 8 (11,4 \%) ne contenaient que des mots du texte, et 59 (84,3 \%) contenaient à la fois des termes MeSH et des mots du texte. La suppression des termes MeSH a diminué la sensibilité médiane (50,0 \% pour V1 à 42,4 \% pour V2) et a augmenté la VPP médiane (1,3 \% pour V1 à 1,6 \% pour V2), elle n'a eu aucun effet sur le nombre d'articles pertinents récupérés pour 39 des 70 revues (56 \%). En revanche, la suppression des mots du texte a diminué la sensibilité médiane (50 \% pour V1 à 16,7 \% pour V3) et a diminué la VPP médiane (1,3 \% pour V1 à 1,0 \% pour V3). En d'autres termes, les requêtes contenant des termes MeSH et des mots du texte fournissaient en moyenne 4 articles pertinents supplémentaires par RS par rapport aux requêtes contenant uniquement des mots du texte, mais il fallait trier 769 articles supplémentaires.
Conclusion
Il apparaît que l'ajout de sensibilité par l'utilisation du thésaurus MeSH est relativement faible et cette augmentation entraîne une perte de VPP significative. Le thésaurus Mesh pourrait ne pas être adapté aux enjeux futurs d'optimisation de la vitesse de réalisation des revues systématiques.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Leblanc, V. and Hamroun, A. and Lenain, R. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {MeSH, Medline, PubMed, Requête, Revues systématiques},
	pages = {202239},
}

Introduction L'augmentation prononcée du nombre de publications renforce les connaissances scientifiques et médicales mais rend plus complexe la synthèse des résultats de la recherche scientifique. Le thésaurus MeSH a été créé au milieu du XXe siècle dans le but de systématiser l'indexation et de faciliter la récupération des articles scientifiques. Malgré l'avènement des moteurs de recherche par termes libres, peu d'études ont remis en question la pertinence du thésaurus MeSH, et aucune ne l'a fait de manière systématique. L'objectif de notre étude était de mesurer l'apport du thésaurus MeSH dans les requêtes PubMed construites pour des revues systématiques (RS) de la littérature. Méthodes Nous avons sélectionné l'ensemble des RS publiées dans quatre journaux prestigieux entre 2012 et 2021 et pour lesquelles une requête PubMed a été fournie. Chaque requête originale (V1) a été transformée pour obtenir une version contenant uniquement des mots du texte (V2) et une version contenant uniquement des termes MeSH (V3). Les trois requêtes ont été comparées en termes de sensibilité et de valeur prédictive positive (VPP). Résultats Au total, 70 RS ont été incluses. Trois requêtes V1 (4,3 %) ne contenaient que des termes MeSH, 8 (11,4 %) ne contenaient que des mots du texte, et 59 (84,3 %) contenaient à la fois des termes MeSH et des mots du texte. La suppression des termes MeSH a diminué la sensibilité médiane (50,0 % pour V1 à 42,4 % pour V2) et a augmenté la VPP médiane (1,3 % pour V1 à 1,6 % pour V2), elle n'a eu aucun effet sur le nombre d'articles pertinents récupérés pour 39 des 70 revues (56 %). En revanche, la suppression des mots du texte a diminué la sensibilité médiane (50 % pour V1 à 16,7 % pour V3) et a diminué la VPP médiane (1,3 % pour V1 à 1,0 % pour V3). En d'autres termes, les requêtes contenant des termes MeSH et des mots du texte fournissaient en moyenne 4 articles pertinents supplémentaires par RS par rapport aux requêtes contenant uniquement des mots du texte, mais il fallait trier 769 articles supplémentaires. Conclusion Il apparaît que l'ajout de sensibilité par l'utilisation du thésaurus MeSH est relativement faible et cette augmentation entraîne une perte de VPP significative. Le thésaurus Mesh pourrait ne pas être adapté aux enjeux futurs d'optimisation de la vitesse de réalisation des revues systématiques.

@article{teston_description_2024,
	series = {Congrès É{MOIS} 2024},
	title = {Description des patients atteints d'affections longues durées en {France} en 2022},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324000442},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202234},
	abstract = {Introduction
Les affections de longue durée (ALD) représentent un défi majeur dans le domaine de la santé publique. Ces affections englobent un large spectre de maladies chroniques et impactent la vie de millions de français, mais exercent également une pression sur le système de santé. L'objectif de cette étude est de décrire les caractéristiques des patients atteints d'une ALD en 2022 en France.
Méthodes
Nous avons extrait du Système national des données de santé, les patients présentant au moins une journée d'une ALD en 2022. Nous avons décrit les ALDs les plus fréquentes et qui touchaient les patients les plus jeunes, les patients les plus âgés, le plus d'hommes, et le plus de femmes.
Résultats
En 2022, 15 821 917 patients étaient atteints d'une ALDs, parmi lesquels 4 759 952 patients (30,1 \%) étaient atteints de deux ALDs différentes ou plus. Les patients étaient pour 49,07 \% des hommes et avaient un âge médian (Q1; Q3) de 69 (55; 81) ans. Les trois ALDs les plus fréquentes étaient le diabète (N=4 200 754 patients, 20,3 \%), les tumeurs malignes (N=3 299 014, 15,9 \%), et les troubles psychiatriques (N=2 064 650, 10,0 \%). Les trois ALDs qui concernaient les patients les plus jeunes étaient la scoliose structurale évolutive, la mucoviscidose et les hémoglobinopathies avec des âges médians (Q1; Q3) de 23 (17; 58), 25 (15; 36) et 26 (13; 45) ans, respectivement. A l'inverse, les ALDs qui concernaient les patients les plus âgés étaient la maladie d'Alzheimer, l'hypertension sévère et la maladie de Parkinson avec des âges médians (Q1; Q3) de 89 (82; 94), 85 (75; 93) et 80 (73; 87) ans, respectivement. Les ALDs qui concernaient le plus souvent les hommes étaient la bilharziose compliquée, les maladies coronaires et le virus de l'immuno-déficience humaine avec 73,0 \%, 70,5 \% et 64,5 \% d'hommes, respectivement. Les ALDs qui concernaient le plus souvent les femmes étaient la scoliose structurale évolutive, la périarthrite noueuse, le lupus érythémateux et la sclérodermie, et la polyarthrite rhumatoïde évolutive avec 80,9 \%, 78,0 \%, et 73,3 \% de femmes, respectivement.
Conclusion
Cette étude met en évidence la complexité des ALDs en France, révélant leur diversité et leurs spécificités selon l'âge et le genre. Ces données offrent des pistes essentielles pour orienter les politiques de santé et adapter les stratégies de prise en charge des patients atteints d'ALDs.},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Teston, A. and Saint-Dizier, C. and Chazard, E. and Quindroit, P. and Lamer, A.},
	month = mar,
	year = {2024},
	keywords = {Affection de longue durée, Prévalence, SNDS},
	pages = {202234},
}

Introduction Les affections de longue durée (ALD) représentent un défi majeur dans le domaine de la santé publique. Ces affections englobent un large spectre de maladies chroniques et impactent la vie de millions de français, mais exercent également une pression sur le système de santé. L'objectif de cette étude est de décrire les caractéristiques des patients atteints d'une ALD en 2022 en France. Méthodes Nous avons extrait du Système national des données de santé, les patients présentant au moins une journée d'une ALD en 2022. Nous avons décrit les ALDs les plus fréquentes et qui touchaient les patients les plus jeunes, les patients les plus âgés, le plus d'hommes, et le plus de femmes. Résultats En 2022, 15 821 917 patients étaient atteints d'une ALDs, parmi lesquels 4 759 952 patients (30,1 %) étaient atteints de deux ALDs différentes ou plus. Les patients étaient pour 49,07 % des hommes et avaient un âge médian (Q1; Q3) de 69 (55; 81) ans. Les trois ALDs les plus fréquentes étaient le diabète (N=4 200 754 patients, 20,3 %), les tumeurs malignes (N=3 299 014, 15,9 %), et les troubles psychiatriques (N=2 064 650, 10,0 %). Les trois ALDs qui concernaient les patients les plus jeunes étaient la scoliose structurale évolutive, la mucoviscidose et les hémoglobinopathies avec des âges médians (Q1; Q3) de 23 (17; 58), 25 (15; 36) et 26 (13; 45) ans, respectivement. A l'inverse, les ALDs qui concernaient les patients les plus âgés étaient la maladie d'Alzheimer, l'hypertension sévère et la maladie de Parkinson avec des âges médians (Q1; Q3) de 89 (82; 94), 85 (75; 93) et 80 (73; 87) ans, respectivement. Les ALDs qui concernaient le plus souvent les hommes étaient la bilharziose compliquée, les maladies coronaires et le virus de l'immuno-déficience humaine avec 73,0 %, 70,5 % et 64,5 % d'hommes, respectivement. Les ALDs qui concernaient le plus souvent les femmes étaient la scoliose structurale évolutive, la périarthrite noueuse, le lupus érythémateux et la sclérodermie, et la polyarthrite rhumatoïde évolutive avec 80,9 %, 78,0 %, et 73,3 % de femmes, respectivement. Conclusion Cette étude met en évidence la complexité des ALDs en France, révélant leur diversité et leurs spécificités selon l'âge et le genre. Ces données offrent des pistes essentielles pour orienter les politiques de santé et adapter les stratégies de prise en charge des patients atteints d'ALDs.

@article{chazard_congres_2024,
	series = {Congrès national {EMOIS} 2024},
	title = {Congrès {EMOIS} – {Lille}, 4 et 5 avril 2024},
	volume = {72},
	issn = {2950-4333},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950433324001897},
	doi = {10.1016/j.jeph.2024.202379},
	urldate = {2024-02-14},
	journal = {Journal of Epidemiology and Population Health},
	author = {Chazard, Emmanuel and Bannay, Aurélie and Jay, Nicolas and Gérard, Erwin},
	month = mar,
	year = {2024},
	pages = {202379},
}

@article{jauffret_association_2024,
	title = {Association between sarcopenia and risk of major adverse cardiac and cerebrovascular events-{UK} {Biobank} database},
	volume = {72},
	issn = {1532-5415},
	doi = {10.1111/jgs.18664},
	abstract = {BACKGROUND: Few studies on the risk of incident major adverse cardiac and cerebrovascular events (MACCEs) in sarcopenia have been reported. The objective was to assess the association between presarcopenia and sarcopenia and a higher risk of MACCEs.
METHODS: This study on the UK Biobank prospective cohort, used data collected between 2006 and 2021. Community-dwelling Caucasian participants aged 37 to 73 years were included if values for Handgrip Strength (HGS) and Skeletal Muscle Index (SMI) were available and if no history of MACCEs was reported. Exposure was assessed using the European Working Group on Sarcopenia in Older People 2 (EWGSOP2) criteria. Muscle strength was measured using HGS, and muscle mass using the SMI. Presarcopenia was defined through the two definitions available in the literature, as low HGS with normal SMI and as normal HGS with low SMI, whereas sarcopenia was defined as low HGS with low SMI. The main outcome was to determine whether presarcopenia and/or sarcopenia were predictors of MACCEs (composite events).
RESULTS: A total of 406,411 included participants (women: 55.7\%) were included. At baseline, there were 18,257 (4.7\%) presarcopenics-subgroup n°1 (low HGS only), 7940 (2.1\%) presarcopenics-subgroup n°2 (low SMI only), and 1124 (0.3\%) sarcopenics. Over a median follow-up of 12.1 years (IQR: [11.4; 12.8]), 28,300 participants (7.0\%) were diagnosed with at least one event. Compared to NonSarc, presarcopenic (subgroups n°1 and n°2) and sarcopenic status were significantly associated with a higher risk of MACCEs (respectively fully adjusted HRs: HR = 1.25 [95\% CI: 1.19; 1.31], HR = 1.33 [95\% CI: 1.23; 1.45] and HR = 1.62 [95\% CI: 1.34; 1.95]).
CONCLUSIONS: In a community-dwelling population, the risk of MACCEs was higher in both presarcopenic and sarcopenic participants.},
	language = {eng},
	number = {3},
	journal = {Journal of the American Geriatrics Society},
	author = {Jauffret, Charlotte and Périchon, Renaud and Lamer, Antoine and Cortet, Bernard and Chazard, Emmanuel and Paccou, Julien},
	month = mar,
	year = {2024},
	pmid = {37945290},
	keywords = {Aged, Biological Specimen Banks, Female, Hand Strength, Humans, Muscle, Skeletal, Prospective Studies, Sarcopenia, UK Biobank, major cardiac and cerebrovascular event, presarcopenia, sarcopenia},
	pages = {693--706},
}

BACKGROUND: Few studies on the risk of incident major adverse cardiac and cerebrovascular events (MACCEs) in sarcopenia have been reported. The objective was to assess the association between presarcopenia and sarcopenia and a higher risk of MACCEs. METHODS: This study on the UK Biobank prospective cohort, used data collected between 2006 and 2021. Community-dwelling Caucasian participants aged 37 to 73 years were included if values for Handgrip Strength (HGS) and Skeletal Muscle Index (SMI) were available and if no history of MACCEs was reported. Exposure was assessed using the European Working Group on Sarcopenia in Older People 2 (EWGSOP2) criteria. Muscle strength was measured using HGS, and muscle mass using the SMI. Presarcopenia was defined through the two definitions available in the literature, as low HGS with normal SMI and as normal HGS with low SMI, whereas sarcopenia was defined as low HGS with low SMI. The main outcome was to determine whether presarcopenia and/or sarcopenia were predictors of MACCEs (composite events). RESULTS: A total of 406,411 included participants (women: 55.7%) were included. At baseline, there were 18,257 (4.7%) presarcopenics-subgroup n°1 (low HGS only), 7940 (2.1%) presarcopenics-subgroup n°2 (low SMI only), and 1124 (0.3%) sarcopenics. Over a median follow-up of 12.1 years (IQR: [11.4; 12.8]), 28,300 participants (7.0%) were diagnosed with at least one event. Compared to NonSarc, presarcopenic (subgroups n°1 and n°2) and sarcopenic status were significantly associated with a higher risk of MACCEs (respectively fully adjusted HRs: HR = 1.25 [95% CI: 1.19; 1.31], HR = 1.33 [95% CI: 1.23; 1.45] and HR = 1.62 [95% CI: 1.34; 1.95]). CONCLUSIONS: In a community-dwelling population, the risk of MACCEs was higher in both presarcopenic and sarcopenic participants.

@article{rochoy_pattern_2024,
	title = {Pattern of encounters to emergency departments for suicidal attempts in {France}: {Identification} of high-risk days, months and holiday periods},
	issn = {0013-7006},
	shorttitle = {Pattern of encounters to emergency departments for suicidal attempts in {France}},
	doi = {10.1016/j.encep.2023.11.018},
	abstract = {INTRODUCTION: Seasonal change in patterns of suicidal attempts is not well known in France and may differ from other western countries. We aimed to determine the peak times (days, months and holiday periods) of suicidal attempts in France.
METHODS: We carried out a multicentre retrospective epidemiological study, using data from the Organization for Coordinated Monitoring of Emergencies (OSCOUR®) network. We aggregated daily data from January 1, 2010, to December 31, 2019. Variations in suicidal attempts on specific days were investigated by comparing their frequencies (ad hoc Z-scores).
RESULTS: 114,805,488 ED encounters were recorded including 233,242 ED encounters regarding suicidal attempts. Men accounted for 45.7\%. A significantly higher frequency of ED encounters for suicidal acts were found on Sundays in the months of May-June for both sexes and on New Year's Day for all genders and age groups. An increased risk was also noted on July 14th (National Day) and June 22nd (Summer Solstice). A protective effect was noted on the day after Valentine's Day, on Christmas Day and Christmas time (in particular December 24 and 26).
CONCLUSION: Sundays, June, New Year's Day were at increased risk of suicidal attempts in France requiring a strengthening of prevention.},
	language = {eng},
	journal = {L'Encephale},
	author = {Rochoy, Michaël and Pontais, Isabelle and Caserio-Schönemann, Céline and Chan-Chee, Christine and Gainet, Luce and Gobert, Yann and Baran, Jan and Dodin, Vincent and Defebvre, Luc and Collins, Claire and Chazard, Emmanuel and Berkhout, Christophe and Balayé, Pierre},
	month = feb,
	year = {2024},
	pmid = {38316568},
	keywords = {Clinical governance, Epidemiology, Gouvernance clinique, Suicide, Épidémiologie},
	pages = {S0013--7006(24)00008--3},
}

INTRODUCTION: Seasonal change in patterns of suicidal attempts is not well known in France and may differ from other western countries. We aimed to determine the peak times (days, months and holiday periods) of suicidal attempts in France. METHODS: We carried out a multicentre retrospective epidemiological study, using data from the Organization for Coordinated Monitoring of Emergencies (OSCOUR®) network. We aggregated daily data from January 1, 2010, to December 31, 2019. Variations in suicidal attempts on specific days were investigated by comparing their frequencies (ad hoc Z-scores). RESULTS: 114,805,488 ED encounters were recorded including 233,242 ED encounters regarding suicidal attempts. Men accounted for 45.7%. A significantly higher frequency of ED encounters for suicidal acts were found on Sundays in the months of May-June for both sexes and on New Year's Day for all genders and age groups. An increased risk was also noted on July 14th (National Day) and June 22nd (Summer Solstice). A protective effect was noted on the day after Valentine's Day, on Christmas Day and Christmas time (in particular December 24 and 26). CONCLUSION: Sundays, June, New Year's Day were at increased risk of suicidal attempts in France requiring a strengthening of prevention.

@article{deneuville_intervention_2024,
	title = {Intervention de {Sauvé}-{Kapandji} pour la prise en charge de l’arthrose radio-ulnaire distale post-traumatique : résultats à long terme et analyse des facteurs de risque de reprise chirurgicale},
	volume = {110},
	issn = {1877-0517},
	shorttitle = {Intervention de {Sauvé}-{Kapandji} pour la prise en charge de l’arthrose radio-ulnaire distale post-traumatique},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877051723000266},
	doi = {10.1016/j.rcot.2023.01.020},
	abstract = {Résumé
Introduction
L’intervention de Sauvé Kapandji (iSK) est une chirurgie fréquente pour la prise en charge des séquelles post-traumatiques de l’articulation radio ulnaire distale (RUD). Les séries évaluant les résultats à long terme et le risque de complications sont rares. L’objectif principal était de décrire les résultats cliniques et radiographiques à long terme après iSK réalisée dans un contexte post-traumatique. Les objectifs secondaires étaient de relever les complications post-opératoires, les reprises chirurgicales et leurs facteurs de risque de survenue. Notre hypothèse était que bien que l’iSK apportait de bons résultats cliniques, il existait des facteurs de risque de complications à identifier.
Patients et méthodes
Cette étude rétrospective monocentrique incluait tous les patients pour lesquels une iSK était réalisée en contexte post traumatique de 2008 à 2018. La douleur, la satisfaction, les amplitudes articulaires et les mesures radiographiques pré et postopératoires étaient relevées. Toutes les complications étaient recherchées et décrites, ainsi que les reprises chirurgicales. Plusieurs variables étaient analysées pour identifier les facteurs de risque de reprise opératoire après iSK : âge, sexe, mécanisme traumatique initial, traitement orthopédique ou chirurgical initial et type de chirurgie, délai de reprise chirurgicale par iSK après le traumatisme initial.
Résultats
Trente-sept patients étaient inclus. Au recul médian de 9,5 ans (min 7,3–max 11,5), 22 patients (60 \%) avaient une EVA à 0. Les amplitudes articulaires étaient significativement améliorées pour l’ensemble des patients (p{\textless}0,001). Dix-sept (46 \%) patients présentaient une complication, dont 5 (13,4 \%) cas d’ossifications, 4 (10,8 \%) cas de gêne due au matériel et 4 (10,8 \%) instabilités douloureuses du moignon ulnaire proximal. Treize (35 \%) patients nécessitaient une reprise chirurgicale. Deux facteurs de reprise chirurgicale après iSK étaient retrouvés : un délai entre traitement initial et iSK inférieur à 7,2 mois et un âge inférieur à 53,5 ans ; la combinaison des deux facteurs ayant une sensibilité 97,5 et une spécificité de 56,7.
Conclusion
L’iSK en contexte post traumatique améliorait significativement les amplitudes articulaires et permettait un contrôle des douleurs à un long recul. Une reprise chirurgicale semblait plus fréquente chez les patients de moins de 53,5 ans et lorsque l’iSK était réalisée moins de 7,2 mois après le traumatisme initial.
Niveau de preuve
IV, étude rétrospective.},
	number = {1},
	urldate = {2024-09-16},
	journal = {Revue de Chirurgie Orthopédique et Traumatologique},
	author = {Deneuville, Marine and Germon, Charlotte and Sturbois-Nachef, Nadine and Chazard, Emmanuel and Chantelot, Christophe and Saab, Marc},
	month = feb,
	year = {2024},
	keywords = {Arthrose radio-ulnaire distale, Articulation radio-ulnaire distale, Poignet, Sauvé-Kapandji},
	pages = {33--40},
}

Résumé Introduction L’intervention de Sauvé Kapandji (iSK) est une chirurgie fréquente pour la prise en charge des séquelles post-traumatiques de l’articulation radio ulnaire distale (RUD). Les séries évaluant les résultats à long terme et le risque de complications sont rares. L’objectif principal était de décrire les résultats cliniques et radiographiques à long terme après iSK réalisée dans un contexte post-traumatique. Les objectifs secondaires étaient de relever les complications post-opératoires, les reprises chirurgicales et leurs facteurs de risque de survenue. Notre hypothèse était que bien que l’iSK apportait de bons résultats cliniques, il existait des facteurs de risque de complications à identifier. Patients et méthodes Cette étude rétrospective monocentrique incluait tous les patients pour lesquels une iSK était réalisée en contexte post traumatique de 2008 à 2018. La douleur, la satisfaction, les amplitudes articulaires et les mesures radiographiques pré et postopératoires étaient relevées. Toutes les complications étaient recherchées et décrites, ainsi que les reprises chirurgicales. Plusieurs variables étaient analysées pour identifier les facteurs de risque de reprise opératoire après iSK : âge, sexe, mécanisme traumatique initial, traitement orthopédique ou chirurgical initial et type de chirurgie, délai de reprise chirurgicale par iSK après le traumatisme initial. Résultats Trente-sept patients étaient inclus. Au recul médian de 9,5 ans (min 7,3–max 11,5), 22 patients (60 %) avaient une EVA à 0. Les amplitudes articulaires étaient significativement améliorées pour l’ensemble des patients (p\textless0,001). Dix-sept (46 %) patients présentaient une complication, dont 5 (13,4 %) cas d’ossifications, 4 (10,8 %) cas de gêne due au matériel et 4 (10,8 %) instabilités douloureuses du moignon ulnaire proximal. Treize (35 %) patients nécessitaient une reprise chirurgicale. Deux facteurs de reprise chirurgicale après iSK étaient retrouvés : un délai entre traitement initial et iSK inférieur à 7,2 mois et un âge inférieur à 53,5 ans ; la combinaison des deux facteurs ayant une sensibilité 97,5 et une spécificité de 56,7. Conclusion L’iSK en contexte post traumatique améliorait significativement les amplitudes articulaires et permettait un contrôle des douleurs à un long recul. Une reprise chirurgicale semblait plus fréquente chez les patients de moins de 53,5 ans et lorsque l’iSK était réalisée moins de 7,2 mois après le traumatisme initial. Niveau de preuve IV, étude rétrospective.

@article{fitoussi_prise_2023,
	title = {Prise en charge de l’arthrose fémorotibiale médiale : données épidémiologiques et étude de survie des prothèses unicompartimentales versus ostéotomies tibiales de valgisation en {France}. Étude à partir des données {PMSI} à propos de 108 007 cas},
	volume = {109},
	issn = {1877-0517},
	shorttitle = {Prise en charge de l’arthrose fémorotibiale médiale},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877051723002812},
	doi = {10.1016/j.rcot.2023.09.013},
	abstract = {Résumé
Introduction
Les prothèses unicompartimentales (PUC) et les ostéotomies tibiales de valgisation (OTV) sont deux options chirurgicales pour le traitement de l’arthrose fémorotibiale médiale isolée en cas de genu varum. Ne disposant ni d’un registre sur les ostéotomies ni sur les arthroplasties de genou l’accessibilité aux données épidémiologiques est difficile en France justifiant ce travail rétrospectif ayant pour objectifs : d’estimer la survie des PUC et des OTV sans reprise chirurgicale avec pose d’une prothèse totale de genou (PTG) ; d’établir des facteurs de risque de reprise chirurgicale pour chacun des groupes.
Hypothèse
La survie à moyen terme des OTV serait meilleure que celle des PUC chez les patients de moins de 70 ans.
Matériels et méthodes
À partir de la base nationale du PMSI, entre 2011 et 2020, tous les sujets âgés hospitalisés en France pour réalisation d’une OTV ou d’une PUC ont été inclus. Soit 108 007 patients dont 43 537 OTV (29 330 hommes, 14 207 femmes) âgés en moyenne de 49,7 ans (IC95 \%=49,6–49,8) et 64 470 PUC (31 181 hommes, 33 289 femmes) âgés en moyenne de 60,5 ans (IC95 \%=60,5–60,6).
Résultats
La survie sans reprise chirurgicale par PTG était de 75,8 \% (IC95 \%=75,2–76,4) pour les PUC et de 80,6 \% (IC95 \%=80,0–81,3) pour les OTV (p{\textless}0,00001). Concernant les PUC, les facteurs de risque de reprise étaient : une faible activité chirurgicale annuelle de l’institution où était effectué le geste (HR=1,50 ; IC95 \%=1,41–1,59) (moins de 17 PUC par an), une obésité (HR=1,25 ; IC95 \%=1,18–1,32), et un âge inférieur à 60 ans, avec une classe d’âge 50–59 ans plus à risque (HR=2,41 ; IC95 \%=1,83–3,16 chez les 50–59 ans). Concernant les OTV, les facteurs de risque de reprise étaient : une obésité (HR=1,42 ; IC95 \%=1,31–1,53), une polyarthrite rhumatoïde (HR=2,75 ; IC95 \%=1,37–5,51), une chondrocalcinose articulaire (HR=2,01 ; IC95 \%=1,18–3,39), et un âge supérieur à 60 ans (HR=8,81 ; IC95 \%=7,23–19,73 chez les 60–69 ans). Le sexe masculin était un facteur protecteur de reprise pour les deux interventions : HR=0,75 (IC95 \%=0,72–0,79) pour les PUC et HR=0,73 (IC95 \%=0,69–0,77) pour les OTV. On observait une augmentation du nombre annuel de PUC, correspondant à la tendance à l’augmentation du nombre annuel d’arthroplasties en France, et une diminution du nombre d’OTV au fil du temps jusqu’à 2019.
Conclusion
Les OTV étaient associées à une meilleure survie à moyen terme que le groupe PUC en France chez les moins de 70 ans. Pour autant, une diminution de leur indication est constatée au profit des PUC alors que leurs facteurs de risques d’échec restent différents, laissant à penser que cette chirurgie conservatrice doit garder sa place selon le stade arthrosique.
Niveau de preuve
III ; étude rétrospective comparative.},
	number = {8},
	urldate = {2024-09-16},
	journal = {Revue de Chirurgie Orthopédique et Traumatologique},
	author = {Fitoussi, Allison and Dartus, Julien and Erivan, Roger and Pasquier, Gilles and Migaud, Henri and Putman, Sophie and Chazard, Emmanuel},
	month = dec,
	year = {2023},
	keywords = {Big data, Ostéotomie tibiale de valgisation, Prothèse unicompartimentale, Reprise chirurgicale, Survie},
	pages = {1206--1211},
}

Résumé Introduction Les prothèses unicompartimentales (PUC) et les ostéotomies tibiales de valgisation (OTV) sont deux options chirurgicales pour le traitement de l’arthrose fémorotibiale médiale isolée en cas de genu varum. Ne disposant ni d’un registre sur les ostéotomies ni sur les arthroplasties de genou l’accessibilité aux données épidémiologiques est difficile en France justifiant ce travail rétrospectif ayant pour objectifs : d’estimer la survie des PUC et des OTV sans reprise chirurgicale avec pose d’une prothèse totale de genou (PTG) ; d’établir des facteurs de risque de reprise chirurgicale pour chacun des groupes. Hypothèse La survie à moyen terme des OTV serait meilleure que celle des PUC chez les patients de moins de 70 ans. Matériels et méthodes À partir de la base nationale du PMSI, entre 2011 et 2020, tous les sujets âgés hospitalisés en France pour réalisation d’une OTV ou d’une PUC ont été inclus. Soit 108 007 patients dont 43 537 OTV (29 330 hommes, 14 207 femmes) âgés en moyenne de 49,7 ans (IC95 %=49,6–49,8) et 64 470 PUC (31 181 hommes, 33 289 femmes) âgés en moyenne de 60,5 ans (IC95 %=60,5–60,6). Résultats La survie sans reprise chirurgicale par PTG était de 75,8 % (IC95 %=75,2–76,4) pour les PUC et de 80,6 % (IC95 %=80,0–81,3) pour les OTV (p\textless0,00001). Concernant les PUC, les facteurs de risque de reprise étaient : une faible activité chirurgicale annuelle de l’institution où était effectué le geste (HR=1,50 ; IC95 %=1,41–1,59) (moins de 17 PUC par an), une obésité (HR=1,25 ; IC95 %=1,18–1,32), et un âge inférieur à 60 ans, avec une classe d’âge 50–59 ans plus à risque (HR=2,41 ; IC95 %=1,83–3,16 chez les 50–59 ans). Concernant les OTV, les facteurs de risque de reprise étaient : une obésité (HR=1,42 ; IC95 %=1,31–1,53), une polyarthrite rhumatoïde (HR=2,75 ; IC95 %=1,37–5,51), une chondrocalcinose articulaire (HR=2,01 ; IC95 %=1,18–3,39), et un âge supérieur à 60 ans (HR=8,81 ; IC95 %=7,23–19,73 chez les 60–69 ans). Le sexe masculin était un facteur protecteur de reprise pour les deux interventions : HR=0,75 (IC95 %=0,72–0,79) pour les PUC et HR=0,73 (IC95 %=0,69–0,77) pour les OTV. On observait une augmentation du nombre annuel de PUC, correspondant à la tendance à l’augmentation du nombre annuel d’arthroplasties en France, et une diminution du nombre d’OTV au fil du temps jusqu’à 2019. Conclusion Les OTV étaient associées à une meilleure survie à moyen terme que le groupe PUC en France chez les moins de 70 ans. Pour autant, une diminution de leur indication est constatée au profit des PUC alors que leurs facteurs de risques d’échec restent différents, laissant à penser que cette chirurgie conservatrice doit garder sa place selon le stade arthrosique. Niveau de preuve III ; étude rétrospective comparative.

@article{thelliez_p-214_2023,
	series = {Livre des résumés - {XXXIe} {Congrès} de la {Société} {Française} de {Transfusion} {Sanguine} ({SFTS}) - {Toulouse}, du 29 novembre au 1er décembre 2023},
	title = {P-214 {Evaluation} de la migration des plastifiants dans les composants sanguins},
	volume = {30},
	issn = {1246-7820},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1246782023003592},
	doi = {10.1016/j.tracli.2023.09.258},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Transfusion Clinique et Biologique},
	author = {Thelliez, Aurélie and Sumian, Chryslain and Chazard, Emmanuel and Reichenberg, Stefan and Lecoeur, Marie and Decaudin, Bertrand},
	month = nov,
	year = {2023},
	pages = {S142},
}

@article{lemaitre_410p_2023,
	series = {Abstract {Book} of the {ESMO} {Congress} 2023, 20 - 24 {October} 2023.},
	title = {{410P} {Patients} treated with pertuzumab followed by {T}-{DM1} for breast cancer in {France} from 2014 to 2021: {A} survival analysis of 10,408 patients from the {French} {National} {Hospital} discharge summary database ({PMSI})},
	volume = {34},
	issn = {0923-7534},
	shorttitle = {{410P} {Patients} treated with pertuzumab followed by {T}-{DM1} for breast cancer in {France} from 2014 to 2021},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0923753423014230},
	doi = {10.1016/j.annonc.2023.09.587},
	urldate = {2024-06-07},
	journal = {Annals of Oncology},
	author = {Lemaitre, J. and Chazard, E. and Cren, P-Y. and Lebellec, L. and Penel, N. and Cheymol, C.},
	month = oct,
	year = {2023},
	pages = {S355},
}

@article{fitoussi_management_2023,
	title = {Management of medial femorotibial osteoarthritis:{Epidemiology}, and survival of unicompartmental knee arthroplasty versus valgus high tibial osteotomy in {France}. {Study} of 108,007 cases from the {French} {National} {Hospitals} {Database}},
	issn = {1877-0568},
	shorttitle = {Management of medial femorotibial osteoarthritis},
	doi = {10.1016/j.otsr.2023.103692},
	abstract = {INTRODUCTION: Unicompartmental knee arthroplasty (UKA) and valgus high tibial osteotomy (HTO) are two options for isolated medial femorotibial osteoarthritis in genu varum. In the absence of registries for osteotomies and for arthroplasty in the knee, epidemiological data are hard to obtain in France. We therefore performed a retrospective study, with the aims of 1) estimating UKA and HTO survival without revision by total knee arthroplasty (TKA), and 2) assessing risk factors for revision according to treatment group.
HYPOTHESIS: Medium-term survival is better with HTO than UKA in under-70 year-olds.
MATERIALS AND METHOD: All elderly patients undergoing HTO or UKA in the French National Hospitals Database for the period 2011-2020 were included: i.e., 108,007 patients; 43,537 HTO (29,330 male, 14,207 female; mean age 49.7 years, 95\% CI 49.6-49.8) and 64,470 UKA (31,181 male, 33,289 female; mean age 60.5 years, 95\% CI 60.5-60.6).
RESULTS: Survival free of revision by TKA was 75.8\% (95\% CI =75.2-76.4) for UKA and 80.6\% (95\% CI =80.0-81.3) for HTO (p{\textless} 0.00001). In UKA, revision risk factors comprised: low annual center volume ({\textless}17 UKAs per year) (HR=1.50; 95\% CI=1.41-1.59), obesity (HR=1.25; 95\% CI=1.18-1.32), and age {\textless}60 years, with maximum risk for 50-59 years (HR=2.41; 95\% CI=1.83-3.16 in 50-59 year-olds). In HTO, revision risk factors comprised: obesity (HR=1.42; 95\% CI=1.31-1.53), rheumatoid arthritis (HR=2.75; 95\% CI=1.37-5.51), joint chondrocalcinosis (HR=2.01; 95\% CI=1.18-3.39), and age {\textgreater}60 years (HR=8.81; 95\% CI=7.23-19.73 in 60-69 year-olds). Maler gender was a protective factor against revision in both groups: UKA, HR= 0.75 (95\% CI=0.72-0.79); HTO, HR=0.73 (95\% CI=0.69-0.77). The number of UKAs increased over the years, matching the increase in arthroplasty in France, with a decrease in HTOs until 2019.
CONCLUSION: HTO showed better medium-term survival than UKA in under-70 year-olds in France. Even so, indications decreased in favor of UKA, although the respective risk factors differ. These findings suggest that conservative surgery still has a role, depending on osteoarthritis stage.
LEVEL OF EVIDENCE: III; retrospective comparative study.},
	language = {eng},
	journal = {Orthopaedics \& traumatology, surgery \& research: OTSR},
	author = {Fitoussi, Allison and Dartus, Julien and Erivan, Roger and Pasquier, Gilles and Migaud, Henri and Putman, Sophie and Chazard, Emmanuel},
	month = sep,
	year = {2023},
	pmid = {37776952},
	keywords = {Big data, Surgical revision, Survival, Unicompartmental knee arthroplasty, Valgus high tibial osteotomy, big data, surgical revision, survival, unicompartmental knee arthroplasty, valgus high tibial osteotomy},
	pages = {103692},
}

INTRODUCTION: Unicompartmental knee arthroplasty (UKA) and valgus high tibial osteotomy (HTO) are two options for isolated medial femorotibial osteoarthritis in genu varum. In the absence of registries for osteotomies and for arthroplasty in the knee, epidemiological data are hard to obtain in France. We therefore performed a retrospective study, with the aims of 1) estimating UKA and HTO survival without revision by total knee arthroplasty (TKA), and 2) assessing risk factors for revision according to treatment group. HYPOTHESIS: Medium-term survival is better with HTO than UKA in under-70 year-olds. MATERIALS AND METHOD: All elderly patients undergoing HTO or UKA in the French National Hospitals Database for the period 2011-2020 were included: i.e., 108,007 patients; 43,537 HTO (29,330 male, 14,207 female; mean age 49.7 years, 95% CI 49.6-49.8) and 64,470 UKA (31,181 male, 33,289 female; mean age 60.5 years, 95% CI 60.5-60.6). RESULTS: Survival free of revision by TKA was 75.8% (95% CI =75.2-76.4) for UKA and 80.6% (95% CI =80.0-81.3) for HTO (p\textless 0.00001). In UKA, revision risk factors comprised: low annual center volume (\textless17 UKAs per year) (HR=1.50; 95% CI=1.41-1.59), obesity (HR=1.25; 95% CI=1.18-1.32), and age \textless60 years, with maximum risk for 50-59 years (HR=2.41; 95% CI=1.83-3.16 in 50-59 year-olds). In HTO, revision risk factors comprised: obesity (HR=1.42; 95% CI=1.31-1.53), rheumatoid arthritis (HR=2.75; 95% CI=1.37-5.51), joint chondrocalcinosis (HR=2.01; 95% CI=1.18-3.39), and age \textgreater60 years (HR=8.81; 95% CI=7.23-19.73 in 60-69 year-olds). Maler gender was a protective factor against revision in both groups: UKA, HR= 0.75 (95% CI=0.72-0.79); HTO, HR=0.73 (95% CI=0.69-0.77). The number of UKAs increased over the years, matching the increase in arthroplasty in France, with a decrease in HTOs until 2019. CONCLUSION: HTO showed better medium-term survival than UKA in under-70 year-olds in France. Even so, indications decreased in favor of UKA, although the respective risk factors differ. These findings suggest that conservative surgery still has a role, depending on osteoarthritis stage. LEVEL OF EVIDENCE: III; retrospective comparative study.

@article{demesmaeker_suicide_2023,
	title = {Suicide and {All}-{Cause} {Mortality} {Within} 1 {Year} {After} a {Suicide} {Attempt} in the {VigilanS} {Cohort}},
	volume = {84},
	issn = {1555-2101},
	doi = {10.4088/JCP.22m14520},
	abstract = {Objective: Obtaining better knowledge on the outcomes of patients who attempt suicide is crucial for suicide prevention. The aim of our study was to determine the causes of death 1 year after a suicide attempt (SA) in the VigilanS program, mortality rates, and risk factors associated with any cause of death and suicide. Methods: A prospective cohort of 7,406 people who had attempted suicide between January 1, 2017, and December 31, 2018, was included in the study. The vital status of each participant was sought, and the cause of death was established through a phone call to their general practitioner or psychiatrist. Second, the relationship between sociodemographic and clinical factors and death by suicide within 1 year of an SA was assessed using a multivariable Cox model. Results: At 1 year, 125 (1.7\%) participants had died, 77 of whom died by suicide. Half of the deaths occurred within the first 4 months after an SA. Hanging (20.3\%; 24/125) and self-poisoning (19.5\%; 23/125) were the methods the most often used for suicide. We demonstrated that male sex (HR = 1.79 [1.13-2.82], P = .01) and being 45 years of age or older (between 45 and 64 years old, HR = 2.08 [1.21-3.56], P {\textless} .01; 65 years or older, HR = 5.36 [2.72-10.54], P {\textless} .01) were associated with a higher risk of death by suicide 1 year after an SA and that being younger than 25 years was associated with a lower risk (HR = 0.22 [0.07-0.76], P = .02). Conclusions: One out of 100 people who attempted suicide died by suicide within 1 year after an SA. Greater vigilance is required in the first months following an SA, especially for males older than 45 years. Trial Registration: ClinicalTrials.gov identifier: NCT03134885.},
	language = {eng},
	number = {6},
	journal = {The Journal of Clinical Psychiatry},
	author = {Demesmaeker, Alice and Amad, Ali and Chazard, Emmanuel and Demarty, Anne-Laure and Schlienger, Honorine and Lehmann, Emma and Debien, Christophe and Jardon, Vincent and Bounebache, Karim and Rey, Gregoire and Vaiva, Guillaume},
	month = sep,
	year = {2023},
	pmid = {37707316},
	keywords = {Humans, Male, Middle Aged, Prospective Studies, Risk Factors, Suicide Prevention, Suicide, Attempted, Wakefulness},
	pages = {22m14520},
}

Objective: Obtaining better knowledge on the outcomes of patients who attempt suicide is crucial for suicide prevention. The aim of our study was to determine the causes of death 1 year after a suicide attempt (SA) in the VigilanS program, mortality rates, and risk factors associated with any cause of death and suicide. Methods: A prospective cohort of 7,406 people who had attempted suicide between January 1, 2017, and December 31, 2018, was included in the study. The vital status of each participant was sought, and the cause of death was established through a phone call to their general practitioner or psychiatrist. Second, the relationship between sociodemographic and clinical factors and death by suicide within 1 year of an SA was assessed using a multivariable Cox model. Results: At 1 year, 125 (1.7%) participants had died, 77 of whom died by suicide. Half of the deaths occurred within the first 4 months after an SA. Hanging (20.3%; 24/125) and self-poisoning (19.5%; 23/125) were the methods the most often used for suicide. We demonstrated that male sex (HR = 1.79 [1.13-2.82], P = .01) and being 45 years of age or older (between 45 and 64 years old, HR = 2.08 [1.21-3.56], P \textless .01; 65 years or older, HR = 5.36 [2.72-10.54], P \textless .01) were associated with a higher risk of death by suicide 1 year after an SA and that being younger than 25 years was associated with a lower risk (HR = 0.22 [0.07-0.76], P = .02). Conclusions: One out of 100 people who attempted suicide died by suicide within 1 year after an SA. Greater vigilance is required in the first months following an SA, especially for males older than 45 years. Trial Registration: ClinicalTrials.gov identifier: NCT03134885.

@article{jauffret_association_2023,
	title = {Association {Between} {Sarcopenia} and {Fracture} {Risk} in a {Population} {From} the {UK} {Biobank} {Database}},
	issn = {1523-4681},
	doi = {10.1002/jbmr.4884},
	abstract = {Studies on the fracture risk in presarcopenic and sarcopenic patients report contradictory results. The objective was to assess whether presarcopenia and sarcopenia are associated with an increase in fracture risk. We conducted a retrospective study using the UK Biobank cohort and the European Working Group on Sarcopenia in Older People 2 (EWGSOP2) criteria. Muscle strength was evaluated using hand-grip strength (HGS) and muscle mass using the skeletal muscle index (SMI; from bioimpedance analysis). Presarcopenia was defined through the two definitions available in the literature, as low HGS with normal SMI and as normal HGS with low SMI, and sarcopenia as low HGS and low SMI. Fracture events were recorded as "fracture" (location compatible with an osteoporotic origin) and "major osteoporotic fracture" (MOF), as listed in the FRAX tool. Associations were assessed using Cox proportional hazards models, adjusted for sarcopenia and osteoporosis risk factors. Adjusted hazard ratios (HRa ) and their 95\% confidence intervals (CI) were reported. A total of 387,025 participants (women 54.4\%; median age 58.0 years; interquartile range [IQR] 51.0-63.0 years) were included. At baseline, there were 18,257 (4.7\%) presarcopenic participants-subgroup 1 (low HGS only), 7940 (2.1\%) presarcopenic participants-subgroup 2 (low SMI only), and 1124 (0.3\%) sarcopenic participants. Over a median follow-up of 12.0 years (IQR 11.4-12.6 years), 18,300 (4.7\%) participants were diagnosed with at least one incident fracture. Presarcopenic (subgroups 1 and 2) and sarcopenic status were significantly associated with a higher risk of fracture (respectively adjusted HRs: HR = 1.26 [1.19-1.33], HR = 1.20 [1.11-1.30], HR = 1.30 [1.08-1.56]) and with a higher risk of MOF (respectively adjusted HRs: HR = 1.30 [1.21-1.40], HR = 1.19 [1.08-1.72], HR = 1.18 [0.93-1.49]). In a middle-aged population, the fracture and MOF risks were higher in both presarcopenic and sarcopenic participants compared with nonsarcopenic participants. © 2023 The Authors. Journal of Bone and Mineral Research published by Wiley Periodicals LLC on behalf of American Society for Bone and Mineral Research (ASBMR).},
	language = {eng},
	journal = {Journal of Bone and Mineral Research: The Official Journal of the American Society for Bone and Mineral Research},
	author = {Jauffret, Charlotte and Périchon, Renaud and Lamer, Antoine and Cortet, Bernard and Chazard, Emmanuel and Paccou, Julien},
	month = jul,
	year = {2023},
	pmid = {37458535},
	keywords = {FRACTURES, MUSCLE MASS, MUSCLE STRENGTH, SARCOPENIA, UK BIOBANK},
}

Studies on the fracture risk in presarcopenic and sarcopenic patients report contradictory results. The objective was to assess whether presarcopenia and sarcopenia are associated with an increase in fracture risk. We conducted a retrospective study using the UK Biobank cohort and the European Working Group on Sarcopenia in Older People 2 (EWGSOP2) criteria. Muscle strength was evaluated using hand-grip strength (HGS) and muscle mass using the skeletal muscle index (SMI; from bioimpedance analysis). Presarcopenia was defined through the two definitions available in the literature, as low HGS with normal SMI and as normal HGS with low SMI, and sarcopenia as low HGS and low SMI. Fracture events were recorded as "fracture" (location compatible with an osteoporotic origin) and "major osteoporotic fracture" (MOF), as listed in the FRAX tool. Associations were assessed using Cox proportional hazards models, adjusted for sarcopenia and osteoporosis risk factors. Adjusted hazard ratios (HRa ) and their 95% confidence intervals (CI) were reported. A total of 387,025 participants (women 54.4%; median age 58.0 years; interquartile range [IQR] 51.0-63.0 years) were included. At baseline, there were 18,257 (4.7%) presarcopenic participants-subgroup 1 (low HGS only), 7940 (2.1%) presarcopenic participants-subgroup 2 (low SMI only), and 1124 (0.3%) sarcopenic participants. Over a median follow-up of 12.0 years (IQR 11.4-12.6 years), 18,300 (4.7%) participants were diagnosed with at least one incident fracture. Presarcopenic (subgroups 1 and 2) and sarcopenic status were significantly associated with a higher risk of fracture (respectively adjusted HRs: HR = 1.26 [1.19-1.33], HR = 1.20 [1.11-1.30], HR = 1.30 [1.08-1.56]) and with a higher risk of MOF (respectively adjusted HRs: HR = 1.30 [1.21-1.40], HR = 1.19 [1.08-1.72], HR = 1.18 [0.93-1.49]). In a middle-aged population, the fracture and MOF risks were higher in both presarcopenic and sarcopenic participants compared with nonsarcopenic participants. © 2023 The Authors. Journal of Bone and Mineral Research published by Wiley Periodicals LLC on behalf of American Society for Bone and Mineral Research (ASBMR).

@article{thelliez_migration_2023,
	title = {Migration of di(2-ethylhexyl) phthalate, diisononylcyclohexane-1,2-dicarboxylate and di(2-ethylhexyl) terephthalate from transfusion medical devices in labile blood products: {A} comparative study},
	issn = {1423-0410},
	shorttitle = {Migration of di(2-ethylhexyl) phthalate, diisononylcyclohexane-1,2-dicarboxylate and di(2-ethylhexyl) terephthalate from transfusion medical devices in labile blood products},
	doi = {10.1111/vox.13446},
	abstract = {BACKGROUND AND OBJECTIVES: Polyvinyl chloride (PVC) plasticized with di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) is a widely used material for medical transfusion devices. Not covalently bound to PVC, DEHP can migrate into blood products during storage. Recognized as an endocrine disruptor and raising concerns about its potential carcinogenicity and reprotoxicity, DEHP is gradually being withdrawn from the medical device market. Therefore, the use of alternative plasticizers, such as diisononylcyclohexane-1,2-dicarboxylate (DINCH) and di(2-ethylhexyl) terephthalate (DEHT), as potential candidates for the replacement of DEHP in medical transfusion devices has been investigated. The purpose of this study was to evaluate the quantity of PVC-plasticizers in the blood components according to their preparation, storage conditions and in function of the plasticizer.
MATERIALS AND METHODS: Whole blood was collected, and labile blood products (LBPs) were prepared by the buffy-coat method with a PVC blood bag plasticized either with DEHP, DINCH or DEHT. DINCH and DEHT equivalent concentrations were quantified in LBPs by liquid chromatography-tandem mass spectrometry or coupled with UV and compared to DEHP equivalent concentrations.
RESULTS: The plasticizer equivalent concentration to which a patient is exposed during a transfusion depends on the preparation of LBPs as well as their storage conditions, that is, temperature and storage time. At day 1, for all LBPs, the migration of DEHP is 5.0 and 8.5 times greater than DINCH and DEHT, respectively. At the end of the 49 days storage period, the DEHP equivalent concentration in red blood cells concentrate is statistically higher when compared to DINCH and DEHT, with maximal values of 1.85, 1.13 and 0.86 μg/dm2 /mL, respectively.
CONCLUSION: In addition to lower toxicity, transfused patients using PVC-DEHT or PVC-DINCH blood bags are less exposed to plasticizers than using PVC-DEHP bags with a ranging exposure reduction from 38.9\% to 87.3\%, due to lower leachability into blood components.},
	language = {eng},
	journal = {Vox Sanguinis},
	author = {Thelliez, Aurélie and Sumian, Chryslain and Chazard, Emmanuel and Reichenberg, Stefan and Lecoeur, Marie and Decaudin, Bertrand},
	month = may,
	year = {2023},
	pmid = {37246454},
	keywords = {2-dicarboxylate, di(2-ethylhexyl) phthalate, di(2-ethylhexyl) terephthalate, diisononylcyclohexane-1, diisononylcyclohexane-1,2-dicarboxylate, labile blood product, metabolites, plasticizer migration},
}

BACKGROUND AND OBJECTIVES: Polyvinyl chloride (PVC) plasticized with di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) is a widely used material for medical transfusion devices. Not covalently bound to PVC, DEHP can migrate into blood products during storage. Recognized as an endocrine disruptor and raising concerns about its potential carcinogenicity and reprotoxicity, DEHP is gradually being withdrawn from the medical device market. Therefore, the use of alternative plasticizers, such as diisononylcyclohexane-1,2-dicarboxylate (DINCH) and di(2-ethylhexyl) terephthalate (DEHT), as potential candidates for the replacement of DEHP in medical transfusion devices has been investigated. The purpose of this study was to evaluate the quantity of PVC-plasticizers in the blood components according to their preparation, storage conditions and in function of the plasticizer. MATERIALS AND METHODS: Whole blood was collected, and labile blood products (LBPs) were prepared by the buffy-coat method with a PVC blood bag plasticized either with DEHP, DINCH or DEHT. DINCH and DEHT equivalent concentrations were quantified in LBPs by liquid chromatography-tandem mass spectrometry or coupled with UV and compared to DEHP equivalent concentrations. RESULTS: The plasticizer equivalent concentration to which a patient is exposed during a transfusion depends on the preparation of LBPs as well as their storage conditions, that is, temperature and storage time. At day 1, for all LBPs, the migration of DEHP is 5.0 and 8.5 times greater than DINCH and DEHT, respectively. At the end of the 49 days storage period, the DEHP equivalent concentration in red blood cells concentrate is statistically higher when compared to DINCH and DEHT, with maximal values of 1.85, 1.13 and 0.86 μg/dm2 /mL, respectively. CONCLUSION: In addition to lower toxicity, transfused patients using PVC-DEHT or PVC-DINCH blood bags are less exposed to plasticizers than using PVC-DEHP bags with a ranging exposure reduction from 38.9% to 87.3%, due to lower leachability into blood components.

@article{lamer_description_2023,
	series = {Congrès national {Emois} 2023},
	title = {Description standardisée du processus d'extraction de caractéristiques afin d'améliorer la réutilisation des données},
	volume = {71},
	issn = {0398-7620},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762023000433},
	doi = {10.1016/j.respe.2023.101465},
	abstract = {Introduction
Malgré les nombreuses possibilités qu'offre la réutilisation des données, sa mise en œuvre présente de nombreuses difficultés, et les données brutes ne peuvent pas être réutilisées directement. Les informations ne sont pas toujours directement disponibles dans la base de données source et doivent être calculées a posteriori. L'objectif principal de cette étude est de présenter une description standardisée des étapes et des transformations nécessaires lors du processus d'extraction de caractéristiques.
Méthodes
Cette étude a comporté les deux étapes suivantes: (1) la collecte de cas d'étude pertinents liés à l'extraction de caractéristiques; (2) la description normalisée des données brutes, des étapes et des transformations, qui étaient communes aux cas d'étude.
Résultats
Nous avons interrogé 10 chercheurs de trois hôpitaux universitaires français et de la Haute Autorité de santé, qui ont participé à huit études rétrospectives et observationnelles. Sur la base de ces études, deux états (piste et caractéristique) et deux transformations (la définition de pistes et l'agrégation de pistes) ont émergé. La "piste" est un signal ou une période d'intérêt dépendant du temps, défini par une unité statistique, une valeur et deux jalons (un événement de début et un événement de fin). La "caractéristique" est une information de haut niveau indépendante du temps, de dimension identique à l'unité statistique de l'étude, définie par un label et une valeur. La dimension temporelle est devenue implicite dans la valeur ou le nom de la variable.
Discussion/Conclusion
Nous proposons une description standardisée du processus d'extraction de caractéristiques. Ce processus combine les deux étapes de définition et d'agrégation des pistes. En divisant l'extraction de caractéristiques en ces deux étapes, la difficulté a été gérée lors de la définition des pistes. La standardisation des pistes nécessite une grande expertise au niveau des données, mais permet l'application d'un nombre infini de transformations complexes. Au contraire, l'agrégation des pistes est une opération très simple avec un nombre fini de possibilités. Une description complète de ces étapes pourrait améliorer la reproductibilité des études rétrospectives.
Mots-clés
Réutilisation de données ; Base de données ; Entrepôt de données ; OMOP ; Caractéristique
Déclaration de liens d'intérêts
Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.},
	urldate = {2023-11-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Lamer, A. and Fruchart, M. and Paris, N. and Popoff, B. and Payen, A. and Balcaen, T. and Gacquer, W. and Cuggia, M. and Doutreligne, M. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2023},
	pages = {101465},
}

Introduction Malgré les nombreuses possibilités qu'offre la réutilisation des données, sa mise en œuvre présente de nombreuses difficultés, et les données brutes ne peuvent pas être réutilisées directement. Les informations ne sont pas toujours directement disponibles dans la base de données source et doivent être calculées a posteriori. L'objectif principal de cette étude est de présenter une description standardisée des étapes et des transformations nécessaires lors du processus d'extraction de caractéristiques. Méthodes Cette étude a comporté les deux étapes suivantes: (1) la collecte de cas d'étude pertinents liés à l'extraction de caractéristiques; (2) la description normalisée des données brutes, des étapes et des transformations, qui étaient communes aux cas d'étude. Résultats Nous avons interrogé 10 chercheurs de trois hôpitaux universitaires français et de la Haute Autorité de santé, qui ont participé à huit études rétrospectives et observationnelles. Sur la base de ces études, deux états (piste et caractéristique) et deux transformations (la définition de pistes et l'agrégation de pistes) ont émergé. La "piste" est un signal ou une période d'intérêt dépendant du temps, défini par une unité statistique, une valeur et deux jalons (un événement de début et un événement de fin). La "caractéristique" est une information de haut niveau indépendante du temps, de dimension identique à l'unité statistique de l'étude, définie par un label et une valeur. La dimension temporelle est devenue implicite dans la valeur ou le nom de la variable. Discussion/Conclusion Nous proposons une description standardisée du processus d'extraction de caractéristiques. Ce processus combine les deux étapes de définition et d'agrégation des pistes. En divisant l'extraction de caractéristiques en ces deux étapes, la difficulté a été gérée lors de la définition des pistes. La standardisation des pistes nécessite une grande expertise au niveau des données, mais permet l'application d'un nombre infini de transformations complexes. Au contraire, l'agrégation des pistes est une opération très simple avec un nombre fini de possibilités. Une description complète de ces étapes pourrait améliorer la reproductibilité des études rétrospectives. Mots-clés Réutilisation de données ; Base de données ; Entrepôt de données ; OMOP ; Caractéristique Déclaration de liens d'intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.

@article{cren_association_2023,
	series = {Congrès national {Emois} 2023},
	title = {Association entre les séjours hospitaliers avec infection et la survie globale des patients traités par ipilimumab : analyse de 1585 patients du {PMSI}},
	volume = {71},
	issn = {0398-7620},
	shorttitle = {Association entre les séjours hospitaliers avec infection et la survie globale des patients traités par ipilimumab},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762023000470},
	doi = {10.1016/j.respe.2023.101469},
	abstract = {Introduction
Le microbiote intestinal joue un rôle clé dans la régulation du système immunitaire. La perturbation de la composition du microbiote intestinal par des antibiotiques pourrait affecter l'efficacité des inhibiteurs de point de contrôle immunitaire. Dans une étude portant sur des patients traités par ipilimumab, nous avons cherché à évaluer la relation entre l'administration d'antibiotiques à l'hôpital et la survie globale.
Méthodes
Les patients ayant été traités par ipilimumab entre janvier 2012 et novembre 2014 ont été sélectionnés à partir de la base de données nationale française du Programme de médicalisation des systèmes d'information. L'exposition aux antibiotiques était définie comme la présence d'un séjour hospitalier avec une infection bactérienne systémique documentée dans les deux mois précédant ou le mois suivant l'initiation de la toute première cure d'ipilimumab du patient. Le critère de jugement principal était la survie globale.
Résultats
Nous avons étudié 43 124 séjours hospitaliers impliquant 1585 patients pris en charge dans 97 centres en France. Tous les patients avaient reçu une monothérapie par ipilimumab pour un mélanome avancé ; 117 des 1585 patients (7,4 \%) ont été exposés à une antibiothérapie systémique à l'hôpital pendant la période d'exposition définie. La survie globale médiane était plus courte chez les patients présentant une infection (6,3 mois, contre 15,4 mois chez les patients sans infection; hazard ratio (HR)=1,88, intervalle de confiance à 95\% [1,46; 2,43], p=10−6). Dans l'analyse multivariée, l'infection était toujours associée de manière significative à une diminution de la survie globale (HR=1,68, [1,30; 2,18], p=10−5).
Discussion/Conclusion
Chez les patients traités par ipilimumab pour un mélanome avancé, l'infection et l'administration d'antibiotiques à l'hôpital autour de la toute première cure d'ipilimumab semblent être associées à une diminution significative de l'efficacité de cet inhibiteur de point de contrôle immunitaire.
Mots-clés
Mélanome ; Ipilimumab ; Microbiote intestinal ; PMSI ; Réutilisation de données ; Données massives
Déclaration de liens d'intérêts
Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.},
	urldate = {2023-11-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Cren, P-Y. and Bertrand, N. and Deley, M-C. Le and Génin, M. and Mortier, L. and Odou, P. and Penel, N. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2023},
	pages = {101469},
}

Introduction Le microbiote intestinal joue un rôle clé dans la régulation du système immunitaire. La perturbation de la composition du microbiote intestinal par des antibiotiques pourrait affecter l'efficacité des inhibiteurs de point de contrôle immunitaire. Dans une étude portant sur des patients traités par ipilimumab, nous avons cherché à évaluer la relation entre l'administration d'antibiotiques à l'hôpital et la survie globale. Méthodes Les patients ayant été traités par ipilimumab entre janvier 2012 et novembre 2014 ont été sélectionnés à partir de la base de données nationale française du Programme de médicalisation des systèmes d'information. L'exposition aux antibiotiques était définie comme la présence d'un séjour hospitalier avec une infection bactérienne systémique documentée dans les deux mois précédant ou le mois suivant l'initiation de la toute première cure d'ipilimumab du patient. Le critère de jugement principal était la survie globale. Résultats Nous avons étudié 43 124 séjours hospitaliers impliquant 1585 patients pris en charge dans 97 centres en France. Tous les patients avaient reçu une monothérapie par ipilimumab pour un mélanome avancé ; 117 des 1585 patients (7,4 %) ont été exposés à une antibiothérapie systémique à l'hôpital pendant la période d'exposition définie. La survie globale médiane était plus courte chez les patients présentant une infection (6,3 mois, contre 15,4 mois chez les patients sans infection; hazard ratio (HR)=1,88, intervalle de confiance à 95% [1,46; 2,43], p=10−6). Dans l'analyse multivariée, l'infection était toujours associée de manière significative à une diminution de la survie globale (HR=1,68, [1,30; 2,18], p=10−5). Discussion/Conclusion Chez les patients traités par ipilimumab pour un mélanome avancé, l'infection et l'administration d'antibiotiques à l'hôpital autour de la toute première cure d'ipilimumab semblent être associées à une diminution significative de l'efficacité de cet inhibiteur de point de contrôle immunitaire. Mots-clés Mélanome ; Ipilimumab ; Microbiote intestinal ; PMSI ; Réutilisation de données ; Données massives Déclaration de liens d'intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.

@article{choteau_extraction_2023,
	series = {Congrès national {Emois} 2023},
	title = {Extraction de caractéristiques pour la réutilisation de données: comment les variables seront-elles transformées et analysées ?},
	volume = {71},
	issn = {0398-7620},
	shorttitle = {Extraction de caractéristiques pour la réutilisation de données},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762023000445},
	doi = {10.1016/j.respe.2023.101466},
	abstract = {Introduction
La réutilisation de données (recherche sur des données) permet généralement de constituer des cohortes historiques. Elle s'appuie sur une étape d'extraction de caractéristiques, qui simplifie les données avant l'analyse statistique. Quelles variables sont généralement utilisées ? Comment sont-elles transformées ? Nous analyserons des cohortes historiques traditionnelles (recherche sur des personnes).
Méthodes
Revue de la littérature: analyse de toutes les cohortes historiques publiées dans les quatre plus grands journaux généralistes en 2019 (pré-COVID), analyse des variables utilisées et de leurs transformations.
Résultats
Les journaux sont: JAMA, BMJ, Lancet et NEJM. Ils ont publié 22 cohortes historiques sur des personnes en 2019, impliquant 660 variables, dont 570 explicatives (86,4 \%) et 90 à expliquer (13,6 \%). Onze articles (50,0 \%) utilisent un modèle de Cox. Les variables rencontrées décrivent le sexe (86,4 \% des articles), l'âge (81,8 \%), d'autres informations démographiques (100 \%), des maladies chroniques (86,4 \%) ou aiguës (50,1 \%), des caractéristiques de l'hôpital (18,2 \%), d'autres informations liées au soin (72,7 \%), des résultats de biologie (36,4 \%), des médicaments (50 \%), le décès (63,6 \%). Nativement, elles sont binaires (62,6 \%), quantitatives (21,3 \%), qualitatives (12,6 \%), ou purement temporelles (2,6 \%). Les variables sont transformées pendant l'analyse. Les variables explicatives sont majoritairement temps-dépendantes (465 soit 70,5 \%), mais presque toutes considérées comme constantes lors de l'analyse (438 soit 94,1 \% d'entre elles). En outre, 65 des 660 variables (9,8 \%) changent de nature, principalement des variables quantitatives qui sont discrétisées (43 des 147 variables quantitatives, soit 29,3 \%).
Discussion/Conclusion
Ces résultats nous orientent pour concevoir un cadre méthodologique de réutilisation de données. Leçon 1: conserver le caractère quantitatif des variables explicatives n'est pas une priorité, ce qui s'explique par les hypothèses non-vérifiées (linéarité, log-linéarité) et le besoin de seuils de décision. Leçon 2: les chercheurs gèrent bien les variables à expliquer temps-dépendantes (survie), mais pas les variables explicatives temps-dépendantes. Il faut donc développer des méthodes simples d'extraction de caractéristiques permettant de préserver le temps. Rappelons que, au fond, presque toutes les variables sont temps-dépendantes.
Mots-clés
Extraction de caractéristiques ; Revue de la littérature ; Réutilisation de données ; Cohorte historique
Déclaration de liens d'intérêts
Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.},
	urldate = {2023-11-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Choteau, T. and Lamer, A. and Balayé, P. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2023},
	pages = {101466},
}

Introduction La réutilisation de données (recherche sur des données) permet généralement de constituer des cohortes historiques. Elle s'appuie sur une étape d'extraction de caractéristiques, qui simplifie les données avant l'analyse statistique. Quelles variables sont généralement utilisées ? Comment sont-elles transformées ? Nous analyserons des cohortes historiques traditionnelles (recherche sur des personnes). Méthodes Revue de la littérature: analyse de toutes les cohortes historiques publiées dans les quatre plus grands journaux généralistes en 2019 (pré-COVID), analyse des variables utilisées et de leurs transformations. Résultats Les journaux sont: JAMA, BMJ, Lancet et NEJM. Ils ont publié 22 cohortes historiques sur des personnes en 2019, impliquant 660 variables, dont 570 explicatives (86,4 %) et 90 à expliquer (13,6 %). Onze articles (50,0 %) utilisent un modèle de Cox. Les variables rencontrées décrivent le sexe (86,4 % des articles), l'âge (81,8 %), d'autres informations démographiques (100 %), des maladies chroniques (86,4 %) ou aiguës (50,1 %), des caractéristiques de l'hôpital (18,2 %), d'autres informations liées au soin (72,7 %), des résultats de biologie (36,4 %), des médicaments (50 %), le décès (63,6 %). Nativement, elles sont binaires (62,6 %), quantitatives (21,3 %), qualitatives (12,6 %), ou purement temporelles (2,6 %). Les variables sont transformées pendant l'analyse. Les variables explicatives sont majoritairement temps-dépendantes (465 soit 70,5 %), mais presque toutes considérées comme constantes lors de l'analyse (438 soit 94,1 % d'entre elles). En outre, 65 des 660 variables (9,8 %) changent de nature, principalement des variables quantitatives qui sont discrétisées (43 des 147 variables quantitatives, soit 29,3 %). Discussion/Conclusion Ces résultats nous orientent pour concevoir un cadre méthodologique de réutilisation de données. Leçon 1: conserver le caractère quantitatif des variables explicatives n'est pas une priorité, ce qui s'explique par les hypothèses non-vérifiées (linéarité, log-linéarité) et le besoin de seuils de décision. Leçon 2: les chercheurs gèrent bien les variables à expliquer temps-dépendantes (survie), mais pas les variables explicatives temps-dépendantes. Il faut donc développer des méthodes simples d'extraction de caractéristiques permettant de préserver le temps. Rappelons que, au fond, presque toutes les variables sont temps-dépendantes. Mots-clés Extraction de caractéristiques ; Revue de la littérature ; Réutilisation de données ; Cohorte historique Déclaration de liens d'intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.

@article{balaye_dans_2023,
	series = {Congrès national {Emois} 2023},
	title = {Dans votre étude de survie dans le {PMSI}, combien vous manque-t-il de décès hors {PMSI} ?},
	volume = {71},
	issn = {0398-7620},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762023000391},
	doi = {10.1016/j.respe.2023.101461},
	abstract = {Introduction
La base nationale du PMSI permet de bâtir de véritables cohortes historiques. Le suivi des réhospitalisations dans tous les établissements de France et tous les champs (MCO, HAD, SSR, Psychiatrie) permet d'étudier la survie des patients. Les chercheurs qui accèdent au SNDS peuvent, à l'aide des données de l'Assurance maladie et du CepiDC, identifier des décès supplémentaires hors PMSI. Les autres chercheurs, qui n'accèdent qu'au PMSI, se contentent généralement d'écrire que, à leur connaissance, la plupart des patients décèdent en établissement. Est-ce vrai ? Quelle est la proportion de décès hors du PMSI, en fonction des âges et des pathologies étudiées ? Notre objectif est de fournir aux chercheurs un outil simple pour estimer le nombre de décès qu'il leur manque.
Méthodes
Nous utilisons les données du CepiDC de 2017 (avant la pandémie), disponibles sur la plateforme du Système national des données de santé (SNDS). Nous préparons un calculateur permettant, en renseignant l'âge et la cause de décès (chapitre de la CIM10) de patients ou groupes de patients dont le décès a été observé dans le PMSI, d'estimer le nombre de décès hors du PMSI.
Résultats
L'outil est disponible gratuitement, sans inscription et sans traçage sur la page http://deceshorspmsi.chazard.org .La proportion de décès hors PMSI est globalement de 3,13\%. Elle varie notablement en fonction du motif de décès, allant de 0,0 \% pour "Grossesse, accouchement et puerpéralité" à 86,7 \% pour "Certaines affections dont l'origine se situe dans la période périnatale (...)". Elle varie également en fonction de l'âge, allant de 2,11 \% pour les décès entre 70 et 74 ans, à 57,8 \% pour les décès entre 0 et 4 ans.
Discussion/Conclusion
Cet outil, simple d'utilisation, permettra aux chercheurs accédant uniquement à la Base Nationale du PMSI de facilement estimer le nombre de décès qu'il leur manque, en fonction des âges et catégories diagnostiques des décès observés dans le PMSI dans leur cohorte. L'exactitude de ces données n'est pas garantie, mais l'ordre de grandeur sera utile.
Mots-clés
Décès ; PMSI ; CepiDC
Déclaration de liens d'intérêts
Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.},
	urldate = {2023-11-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Balayé, P. and Lamer, A. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2023},
	pages = {101461},
}

Introduction La base nationale du PMSI permet de bâtir de véritables cohortes historiques. Le suivi des réhospitalisations dans tous les établissements de France et tous les champs (MCO, HAD, SSR, Psychiatrie) permet d'étudier la survie des patients. Les chercheurs qui accèdent au SNDS peuvent, à l'aide des données de l'Assurance maladie et du CepiDC, identifier des décès supplémentaires hors PMSI. Les autres chercheurs, qui n'accèdent qu'au PMSI, se contentent généralement d'écrire que, à leur connaissance, la plupart des patients décèdent en établissement. Est-ce vrai ? Quelle est la proportion de décès hors du PMSI, en fonction des âges et des pathologies étudiées ? Notre objectif est de fournir aux chercheurs un outil simple pour estimer le nombre de décès qu'il leur manque. Méthodes Nous utilisons les données du CepiDC de 2017 (avant la pandémie), disponibles sur la plateforme du Système national des données de santé (SNDS). Nous préparons un calculateur permettant, en renseignant l'âge et la cause de décès (chapitre de la CIM10) de patients ou groupes de patients dont le décès a été observé dans le PMSI, d'estimer le nombre de décès hors du PMSI. Résultats L'outil est disponible gratuitement, sans inscription et sans traçage sur la page http://deceshorspmsi.chazard.org .La proportion de décès hors PMSI est globalement de 3,13%. Elle varie notablement en fonction du motif de décès, allant de 0,0 % pour "Grossesse, accouchement et puerpéralité" à 86,7 % pour "Certaines affections dont l'origine se situe dans la période périnatale (...)". Elle varie également en fonction de l'âge, allant de 2,11 % pour les décès entre 70 et 74 ans, à 57,8 % pour les décès entre 0 et 4 ans. Discussion/Conclusion Cet outil, simple d'utilisation, permettra aux chercheurs accédant uniquement à la Base Nationale du PMSI de facilement estimer le nombre de décès qu'il leur manque, en fonction des âges et catégories diagnostiques des décès observés dans le PMSI dans leur cohorte. L'exactitude de ces données n'est pas garantie, mais l'ordre de grandeur sera utile. Mots-clés Décès ; PMSI ; CepiDC Déclaration de liens d'intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.

@article{lacroix_toute_2023,
	series = {Congrès national {Emois} 2023},
	title = {De toute évidence les femmes meurent moins de cardiopathie ischémique que les hommes},
	volume = {71},
	issn = {0398-7620},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762023000524},
	doi = {10.1016/j.respe.2023.101474},
	abstract = {Introduction
Il devient courant d'affirmer que les femmes meurent plus que les hommes de maladie cardiovasculaire, y compris en introduction d'articles scientifiques. Objectif: utiliser des données ouvertes de mortalité pour illustrer comment un calcul simpliste peut induire en erreur.
Méthodes
Nous utilisons les données 2016 du CepiDC en France métropolitaine, en séparant les cardiopathies ischémiques (CI) de toutes les autres causes. Pour tous les morts de l'année 2016, ces données fournissent le sexe, l'âge au décès, et la cause. Méthode 1 (morts réels): à la manière d'une étude rétrospective, nous calculons le sex ratio des morts par CI (en ignorant les autres causes), par classe d'âge. Méthode 2 (cohorte virtuelle): nous simulons des naissances une année donnée. Supposant que ces personnes mourraient au même âge que les morts de 2016, nous simulons leurs décès par CI ou pour d'autres causes, année après année. Pour chaque classe d'âge, nous calculons le risque relatif entre le sexe masculin et le décès par CI.
Résultats
Méthode 1: le sex ratio vaut successivement 2,36 (25-34 ans), 5,60 (35-44 ans), 4,85 (45-54 ans), 5,03 (55-64 ans), 3,76 (65-74 ans), 1,87 (75-84 ans), 0,90 (85-94 ans), 0,41 (95-104 ans), et 0,40 (après 105 ans). Méthode 2: le risque relatif vaut successivement 2,39 (25-34 ans), 5,69 (35-44 ans), 4,98 (45-54 ans), 5,32 (55-64 ans), 4,33 (65-74 ans), 2,52 (75-84 ans), 1,59 (85-94 ans), 1,31 (95-104 ans), et 1,29 (après 105 ans).
Discussion/Conclusion
La méthode 1 peut faire croire que les femmes meurent plus de CI que les hommes au-delà de 85 ans. Elle ne prend pas en compte les risques concurrents (ex: cancers), ni le fait que les hommes vivent moins longtemps (notamment à cause de la mortalité par CI). Elle reste une approximation acceptable de la méthode 2 en-dessous de 45 ans. La méthode 2 est plus fidèle à la réalité: à tout âge, les hommes meurent plus que les femmes de CI.
Mots-clés
CepiDC ; Mortalité ; Cardiopathie ischémique ; Sex ratio ; Risque relatif
Déclaration de liens d'intérêts
Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.},
	urldate = {2023-11-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Lacroix, D-F. and Beuscart, J-B. and Hubert, H. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2023},
	pages = {101474},
}

Introduction Il devient courant d'affirmer que les femmes meurent plus que les hommes de maladie cardiovasculaire, y compris en introduction d'articles scientifiques. Objectif: utiliser des données ouvertes de mortalité pour illustrer comment un calcul simpliste peut induire en erreur. Méthodes Nous utilisons les données 2016 du CepiDC en France métropolitaine, en séparant les cardiopathies ischémiques (CI) de toutes les autres causes. Pour tous les morts de l'année 2016, ces données fournissent le sexe, l'âge au décès, et la cause. Méthode 1 (morts réels): à la manière d'une étude rétrospective, nous calculons le sex ratio des morts par CI (en ignorant les autres causes), par classe d'âge. Méthode 2 (cohorte virtuelle): nous simulons des naissances une année donnée. Supposant que ces personnes mourraient au même âge que les morts de 2016, nous simulons leurs décès par CI ou pour d'autres causes, année après année. Pour chaque classe d'âge, nous calculons le risque relatif entre le sexe masculin et le décès par CI. Résultats Méthode 1: le sex ratio vaut successivement 2,36 (25-34 ans), 5,60 (35-44 ans), 4,85 (45-54 ans), 5,03 (55-64 ans), 3,76 (65-74 ans), 1,87 (75-84 ans), 0,90 (85-94 ans), 0,41 (95-104 ans), et 0,40 (après 105 ans). Méthode 2: le risque relatif vaut successivement 2,39 (25-34 ans), 5,69 (35-44 ans), 4,98 (45-54 ans), 5,32 (55-64 ans), 4,33 (65-74 ans), 2,52 (75-84 ans), 1,59 (85-94 ans), 1,31 (95-104 ans), et 1,29 (après 105 ans). Discussion/Conclusion La méthode 1 peut faire croire que les femmes meurent plus de CI que les hommes au-delà de 85 ans. Elle ne prend pas en compte les risques concurrents (ex: cancers), ni le fait que les hommes vivent moins longtemps (notamment à cause de la mortalité par CI). Elle reste une approximation acceptable de la méthode 2 en-dessous de 45 ans. La méthode 2 est plus fidèle à la réalité: à tout âge, les hommes meurent plus que les femmes de CI. Mots-clés CepiDC ; Mortalité ; Cardiopathie ischémique ; Sex ratio ; Risque relatif Déclaration de liens d'intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.

@article{pierard_rendez-vous_2023,
	series = {Congrès national {Emois} 2023},
	title = {Rendez-vous non-honorés par les patients, ou "lapins": quel est leur impact en ville et à l'hôpital ?},
	volume = {71},
	issn = {0398-7620},
	shorttitle = {Rendez-vous non-honorés par les patients, ou "lapins"},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762023000639},
	doi = {10.1016/j.respe.2023.101485},
	abstract = {Introduction
Alors que les décideurs et commentateurs redoublent de propositions pour réformer l'offre de soins ambulatoires (en cabinet ou établissement), les médecins libéraux et hospitaliers se plaignent de voir leur travail affecté par de trop nombreux rendez-vous (RDV) non-honorés par les patients, ou "lapins". L'objectif principal est d'évaluer leur impact.
Méthodes
Sous l'égide et avec le financement du Conseil de l'Ordre des Médecins du Nord (CDOM59), nous avons tiré au sort 200 médecins payant une cotisation complète au CDOM59, et leur avons envoyé un questionnaire papier anonyme avec enveloppe retour. Des relances téléphoniques systématiques ont été faites.
Résultats
Le taux de réponse est de 84,0 \%. L'âge moyen est 48,4, il y a 50,6 \% d'hommes ; 86 (57,7 \%) travaillent en cabinet. 44 (29,9 \%) réalisent du soin premier en médecine générale ; 150 font des consultations (89,3 \%). Ces médecins réalisent en médiane 60 consultations par semaine (Q1-Q3 [28,5;100]). Ils subissent en moyenne 4 [2;7] lapins par semaine, soit 7,60 \% des consultations, correspondant à 2h01 par semaine, alors que leur délai médian d'obtention d'un rendez-vous est de 20 jours ([5;60]). Le temps libéré est réparti ainsi: 14,9 \% de nouveaux soins, 35,8 \% de soins rallongés, 37,6 \%de temps professionnel hors soin, 11,7 \% de temps personnel ou perdu. Pour les médecins interrogés, le profil type du "lapin" est un patient jeune, inconnu du cabinet, prenant RDV sur internet, non-adressé par un confrère, pour un motif non-grave et aigu, et présentant un problème psychologique ou social ou organisationnel. Les médecins interrogés préconisent en priorité de sensibiliser les patients, de ne plus accueillir les récidivistes (hors urgences), et de les sanctionner financièrement (cotation non-remboursable, déduite des remboursements ultérieurs).
Discussion / conclusion
Résoudre le problème des "lapins" serait aussi efficace que repousser de l'âge de la retraite de 2,4 ans ou supprimer 16,3 jours de congés chaque année, ou rajouter 1h43 de travail chaque semaine pour TOUS les médecins de France. Ce serait un levier très important sur l'offre de soins ambulatoire.
Mots-clés
Rendez-vous non-honoré ; « Lapin » ; Offre de soins
Déclaration de liens d'intérêts
Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.},
	urldate = {2023-11-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Piérard, C. and Vogel, M. and Platel, J-P. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2023},
	pages = {101485},
}

Introduction Alors que les décideurs et commentateurs redoublent de propositions pour réformer l'offre de soins ambulatoires (en cabinet ou établissement), les médecins libéraux et hospitaliers se plaignent de voir leur travail affecté par de trop nombreux rendez-vous (RDV) non-honorés par les patients, ou "lapins". L'objectif principal est d'évaluer leur impact. Méthodes Sous l'égide et avec le financement du Conseil de l'Ordre des Médecins du Nord (CDOM59), nous avons tiré au sort 200 médecins payant une cotisation complète au CDOM59, et leur avons envoyé un questionnaire papier anonyme avec enveloppe retour. Des relances téléphoniques systématiques ont été faites. Résultats Le taux de réponse est de 84,0 %. L'âge moyen est 48,4, il y a 50,6 % d'hommes ; 86 (57,7 %) travaillent en cabinet. 44 (29,9 %) réalisent du soin premier en médecine générale ; 150 font des consultations (89,3 %). Ces médecins réalisent en médiane 60 consultations par semaine (Q1-Q3 [28,5;100]). Ils subissent en moyenne 4 [2;7] lapins par semaine, soit 7,60 % des consultations, correspondant à 2h01 par semaine, alors que leur délai médian d'obtention d'un rendez-vous est de 20 jours ([5;60]). Le temps libéré est réparti ainsi: 14,9 % de nouveaux soins, 35,8 % de soins rallongés, 37,6 %de temps professionnel hors soin, 11,7 % de temps personnel ou perdu. Pour les médecins interrogés, le profil type du "lapin" est un patient jeune, inconnu du cabinet, prenant RDV sur internet, non-adressé par un confrère, pour un motif non-grave et aigu, et présentant un problème psychologique ou social ou organisationnel. Les médecins interrogés préconisent en priorité de sensibiliser les patients, de ne plus accueillir les récidivistes (hors urgences), et de les sanctionner financièrement (cotation non-remboursable, déduite des remboursements ultérieurs). Discussion / conclusion Résoudre le problème des "lapins" serait aussi efficace que repousser de l'âge de la retraite de 2,4 ans ou supprimer 16,3 jours de congés chaque année, ou rajouter 1h43 de travail chaque semaine pour TOUS les médecins de France. Ce serait un levier très important sur l'offre de soins ambulatoire. Mots-clés Rendez-vous non-honoré ; « Lapin » ; Offre de soins Déclaration de liens d'intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts.

@article{chazard_congres_2023,
	title = {Congrès {Emois} – {Nancy}, 16 et 17 mars 2023},
	volume = {71 Suppl 1},
	issn = {0398-7620},
	doi = {10.1016/j.respe.2023.101425},
	language = {fre},
	journal = {Revue D'epidemiologie Et De Sante Publique},
	author = {Chazard, Emmanuel and Bannay, Aurélie and Jay, Nicolas and Chevalier, Stéphanie},
	month = feb,
	year = {2023},
	pmid = {36736041},
	pages = {101425},
}

@article{deneuville_sauve-kapandji_2023,
	title = {The {Sauvé}-{Kapandji} procedure for post-traumatic distal radioulnar arthrosis: long-term results and analysis of risks factors for revision surgery},
	issn = {1877-0568},
	shorttitle = {The {Sauvé}-{Kapandji} procedure for post-traumatic distal radioulnar arthrosis},
	doi = {10.1016/j.otsr.2023.103562},
	abstract = {INTRODUCTION: The Sauvé Kapandji (SKp) procedure is a frequently used surgery for the management of post-traumatic sequelae of the distal radioulnar joint (DRU). Series evaluating long-term outcomes and the risk of complications are rare. The main objective was to describe the long-term clinical and radiographic results after SKp performed in a post-traumatic context. The secondary objectives were to identify postoperative complications, surgical revisions, and their risk factors for occurrence. Our hypothesis was that although SKp confers good clinical results, identifiable risk factors for complications exist.
PATIENTS AND METHODS: This monocentric retrospective study included all patients for whom an SKp was performed in a post-traumatic context from 2008 to 2018. Pain, satisfaction, range of motion and pre- and postoperative radiographic measurements were recorded. All complications were sought and described, as well as surgical revisions. Several variables were analyzed to identify risk factors for revision surgery after SKp: age, sex, initial traumatic mechanism, initial non-surgical or surgical treatment and type of surgery, time until revision surgery with SKp after the initial trauma.
RESULTS: Thirty-seven patients were included. At a median follow-up of 9.5 years (min 7.3 - max 11.5), 22 patients (60\%) had a VAS of 0. Range of motion was significantly improved for all the patients (p{\textless}0.001). Seventeen (46\%) patients had a complication, including 5 (13.4\%) cases of ossification, 4 (10.8\%) cases of discomfort related to the hardware and 4 (10.8\%) painful instability at the proximal ulnar stump. Thirteen (35\%) patients required revision surgery. Two risk factors for revision surgery after SKp were found: time period between initial treatment and SKp of less than 7.2 months and an age of less than 53.5 years; the combination of the two factors having a sensitivity of 97.5 and a specificity of 56.7.
CONCLUSION: SKp in a post-traumatic context significantly improved range of motion and allowed pain control at long follow-up. Revision surgery seemed more frequent in patients under 53.5 years of age and when SKp was performed less than 7.2 months after the initial trauma.
LEVEL OF EVIDENCE: IV, retrospective study.},
	language = {eng},
	journal = {Orthopaedics \& traumatology, surgery \& research: OTSR},
	author = {Deneuville, Marine and Germon, Charlotte and Nachef, Nadine Sturbois and Chazard, Emmanuel and Chantelot, Christophe and Saab, Marc},
	month = jan,
	year = {2023},
	pmid = {36702297},
	keywords = {Distal radioulnar osteoarthritis, Radioulnar joint, Sauve Kapandji procedure, Wrist},
	pages = {103562},
}

INTRODUCTION: The Sauvé Kapandji (SKp) procedure is a frequently used surgery for the management of post-traumatic sequelae of the distal radioulnar joint (DRU). Series evaluating long-term outcomes and the risk of complications are rare. The main objective was to describe the long-term clinical and radiographic results after SKp performed in a post-traumatic context. The secondary objectives were to identify postoperative complications, surgical revisions, and their risk factors for occurrence. Our hypothesis was that although SKp confers good clinical results, identifiable risk factors for complications exist. PATIENTS AND METHODS: This monocentric retrospective study included all patients for whom an SKp was performed in a post-traumatic context from 2008 to 2018. Pain, satisfaction, range of motion and pre- and postoperative radiographic measurements were recorded. All complications were sought and described, as well as surgical revisions. Several variables were analyzed to identify risk factors for revision surgery after SKp: age, sex, initial traumatic mechanism, initial non-surgical or surgical treatment and type of surgery, time until revision surgery with SKp after the initial trauma. RESULTS: Thirty-seven patients were included. At a median follow-up of 9.5 years (min 7.3 - max 11.5), 22 patients (60%) had a VAS of 0. Range of motion was significantly improved for all the patients (p\textless0.001). Seventeen (46%) patients had a complication, including 5 (13.4%) cases of ossification, 4 (10.8%) cases of discomfort related to the hardware and 4 (10.8%) painful instability at the proximal ulnar stump. Thirteen (35%) patients required revision surgery. Two risk factors for revision surgery after SKp were found: time period between initial treatment and SKp of less than 7.2 months and an age of less than 53.5 years; the combination of the two factors having a sensitivity of 97.5 and a specificity of 56.7. CONCLUSION: SKp in a post-traumatic context significantly improved range of motion and allowed pain control at long follow-up. Revision surgery seemed more frequent in patients under 53.5 years of age and when SKp was performed less than 7.2 months after the initial trauma. LEVEL OF EVIDENCE: IV, retrospective study.

@article{demesmaeker_author_2022,
	title = {Author reply to {Letter} to the {Editor} regarding '{Suicide} mortality after a nonfatal suicide attempt. {A} systematic review and meta-analysis'},
	volume = {56},
	issn = {1440-1614},
	doi = {10.1177/00048674221136458},
	language = {eng},
	number = {12},
	journal = {The Australian and New Zealand Journal of Psychiatry},
	author = {Demesmaeker, Alice and Chazard, Emmanuel and Hoang, Aline and Vaiva, Guillaume and Amad, Ali},
	month = dec,
	year = {2022},
	pmid = {36366799},
	keywords = {Humans, Suicide, Attempted},
	pages = {1676--1677},
}

@article{lamer_standardized_2022,
	title = {Standardized {Description} of the {Feature} {Extraction} {Process} to {Transform} {Raw} {Data} {Into} {Meaningful} {Information} for {Enhancing} {Data} {Reuse}: {Consensus} {Study}},
	volume = {10},
	issn = {2291-9694},
	shorttitle = {Standardized {Description} of the {Feature} {Extraction} {Process} to {Transform} {Raw} {Data} {Into} {Meaningful} {Information} for {Enhancing} {Data} {Reuse}},
	doi = {10.2196/38936},
	abstract = {BACKGROUND: Despite the many opportunities data reuse offers, its implementation presents many difficulties, and raw data cannot be reused directly. Information is not always directly available in the source database and needs to be computed afterwards with raw data for defining an algorithm.
OBJECTIVE: The main purpose of this article is to present a standardized description of the steps and transformations required during the feature extraction process when conducting retrospective observational studies. A secondary objective is to identify how the features could be stored in the schema of a data warehouse.
METHODS: This study involved the following 3 main steps: (1) the collection of relevant study cases related to feature extraction and based on the automatic and secondary use of data; (2) the standardized description of raw data, steps, and transformations, which were common to the study cases; and (3) the identification of an appropriate table to store the features in the Observation Medical Outcomes Partnership (OMOP) common data model (CDM).
RESULTS: We interviewed 10 researchers from 3 French university hospitals and a national institution, who were involved in 8 retrospective and observational studies. Based on these studies, 2 states (track and feature) and 2 transformations (track definition and track aggregation) emerged. "Track" is a time-dependent signal or period of interest, defined by a statistical unit, a value, and 2 milestones (a start event and an end event). "Feature" is time-independent high-level information with dimensionality identical to the statistical unit of the study, defined by a label and a value. The time dimension has become implicit in the value or name of the variable. We propose the 2 tables "TRACK" and "FEATURE" to store variables obtained in feature extraction and extend the OMOP CDM.
CONCLUSIONS: We propose a standardized description of the feature extraction process. The process combined the 2 steps of track definition and track aggregation. By dividing the feature extraction into these 2 steps, difficulty was managed during track definition. The standardization of tracks requires great expertise with regard to the data, but allows the application of an infinite number of complex transformations. On the contrary, track aggregation is a very simple operation with a finite number of possibilities. A complete description of these steps could enhance the reproducibility of retrospective studies.},
	language = {eng},
	number = {10},
	journal = {JMIR medical informatics},
	author = {Lamer, Antoine and Fruchart, Mathilde and Paris, Nicolas and Popoff, Benjamin and Payen, Anaïs and Balcaen, Thibaut and Gacquer, William and Bouzillé, Guillaume and Cuggia, Marc and Doutreligne, Matthieu and Chazard, Emmanuel},
	month = oct,
	year = {2022},
	pmid = {36251369},
	pmcid = {PMC9623460},
	keywords = {Observation Medical Outcomes Partnership, algorithm, data reuse, data warehouse, database, feature extraction},
	pages = {e38936},
}

BACKGROUND: Despite the many opportunities data reuse offers, its implementation presents many difficulties, and raw data cannot be reused directly. Information is not always directly available in the source database and needs to be computed afterwards with raw data for defining an algorithm. OBJECTIVE: The main purpose of this article is to present a standardized description of the steps and transformations required during the feature extraction process when conducting retrospective observational studies. A secondary objective is to identify how the features could be stored in the schema of a data warehouse. METHODS: This study involved the following 3 main steps: (1) the collection of relevant study cases related to feature extraction and based on the automatic and secondary use of data; (2) the standardized description of raw data, steps, and transformations, which were common to the study cases; and (3) the identification of an appropriate table to store the features in the Observation Medical Outcomes Partnership (OMOP) common data model (CDM). RESULTS: We interviewed 10 researchers from 3 French university hospitals and a national institution, who were involved in 8 retrospective and observational studies. Based on these studies, 2 states (track and feature) and 2 transformations (track definition and track aggregation) emerged. "Track" is a time-dependent signal or period of interest, defined by a statistical unit, a value, and 2 milestones (a start event and an end event). "Feature" is time-independent high-level information with dimensionality identical to the statistical unit of the study, defined by a label and a value. The time dimension has become implicit in the value or name of the variable. We propose the 2 tables "TRACK" and "FEATURE" to store variables obtained in feature extraction and extend the OMOP CDM. CONCLUSIONS: We propose a standardized description of the feature extraction process. The process combined the 2 steps of track definition and track aggregation. By dividing the feature extraction into these 2 steps, difficulty was managed during track definition. The standardization of tracks requires great expertise with regard to the data, but allows the application of an infinite number of complex transformations. On the contrary, track aggregation is a very simple operation with a finite number of possibilities. A complete description of these steps could enhance the reproducibility of retrospective studies.

@article{lamer_data_2022,
	title = {Data {Management} for {Health} {Data} {Reuse}: {Proposal} of a {Standard} {Workflow} and a {R} {Tutorial} with {Jupyter} {Notebook}},
	volume = {298},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {Data {Management} for {Health} {Data} {Reuse}},
	doi = {10.3233/SHTI220912},
	abstract = {The data collected in the clinical registries or by data reuse require some modifications in order to suit the research needs. Several common operations are frequently applied to select relevant patients across the cohort, combine data from multiple sources, add new variables if needed and create unique tables depending on the research purpose. We carried out a qualitative survey by conducting semi-structured interviews with 7 experts in data reuse and proposed a standard workflow for health data management. We implemented a R tutorial based on a synthetic data set using Jupyter Notebook for a better understanding of the data management workflow.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Lamer, Antoine and Al Massati, Sanae and Saint-Dizier, Chloé and Fares, Emile and Chazard, Emmanuel and Fruchart, Mathilde},
	month = aug,
	year = {2022},
	pmid = {36073461},
	keywords = {Data Management, Data Science, Data management, Data reuse, Education, Humans, Programming, Workflow},
	pages = {82--86},
}

The data collected in the clinical registries or by data reuse require some modifications in order to suit the research needs. Several common operations are frequently applied to select relevant patients across the cohort, combine data from multiple sources, add new variables if needed and create unique tables depending on the research purpose. We carried out a qualitative survey by conducting semi-structured interviews with 7 experts in data reuse and proposed a standard workflow for health data management. We implemented a R tutorial based on a synthetic data set using Jupyter Notebook for a better understanding of the data management workflow.

@article{herbaux_formative_2022,
	title = {Formative {Assessment} of {Diagnostic} {Testing} in {Family} {Medicine} with {Comprehensive} {MCQ} {Followed} by {Certainty}-{Based} {Mark}},
	volume = {10},
	issn = {2227-9032},
	doi = {10.3390/healthcare10081558},
	abstract = {INTRODUCTION: The choice of diagnostic tests in front of a given clinical case is a major part of medical reasoning. Failure to prescribe the right test can lead to serious diagnostic errors. Furthermore, unnecessary medical tests are a waste of money and could possibly generate injuries to patients, especially in family medicine.
METHODS: In an effort to improve the training of our students to the choice of laboratory and imaging studies, we implemented a specific multiple-choice questions (MCQ), called comprehensive MCQ (cMCQ), with a fixed and high number of options matching various basic medical tests, followed by a certainty-based mark (CBM). This tool was used in the assessment of diagnostic test choice in various clinical cases of general practice in 456 sixth-year medical students.
RESULTS: The scores were significantly correlated with the traditional exams (standard MCQ), with matched themes. The proportion of "cMCQ/CBM score" variance explained by "standard MCQ score" was 21.3\%. The cMCQ placed students in a situation closer to practice reality than standard MCQ. In addition to its usefulness as an assessment tool, those tests had a formative value and allowed students to work on their ability to measure their doubt/certainty in order to develop a reflexive approach, required for their future professional practice.
CONCLUSION: cMCQ followed by CBM is a feasible and reliable evaluation method for the assessment of diagnostic testing.},
	language = {eng},
	number = {8},
	journal = {Healthcare (Basel, Switzerland)},
	author = {Herbaux, Charles and Dupré, Aurélie and Rénier, Wendy and Gabellier, Ludovic and Chazard, Emmanuel and Lambert, Philippe and Sobanski, Vincent and Gosset, Didier and Lacroix, Dominique and Truffert, Patrick},
	month = aug,
	year = {2022},
	pmid = {36011215},
	keywords = {diagnostics, education},
	pages = {1558},
}

INTRODUCTION: The choice of diagnostic tests in front of a given clinical case is a major part of medical reasoning. Failure to prescribe the right test can lead to serious diagnostic errors. Furthermore, unnecessary medical tests are a waste of money and could possibly generate injuries to patients, especially in family medicine. METHODS: In an effort to improve the training of our students to the choice of laboratory and imaging studies, we implemented a specific multiple-choice questions (MCQ), called comprehensive MCQ (cMCQ), with a fixed and high number of options matching various basic medical tests, followed by a certainty-based mark (CBM). This tool was used in the assessment of diagnostic test choice in various clinical cases of general practice in 456 sixth-year medical students. RESULTS: The scores were significantly correlated with the traditional exams (standard MCQ), with matched themes. The proportion of "cMCQ/CBM score" variance explained by "standard MCQ score" was 21.3%. The cMCQ placed students in a situation closer to practice reality than standard MCQ. In addition to its usefulness as an assessment tool, those tests had a formative value and allowed students to work on their ability to measure their doubt/certainty in order to develop a reflexive approach, required for their future professional practice. CONCLUSION: cMCQ followed by CBM is a feasible and reliable evaluation method for the assessment of diagnostic testing.

@article{boullenger_type_2022,
	title = {Type 2 diabetics followed up by family physicians: {Treatment} sequences and changes over time in weight and glycated hemoglobin},
	issn = {1878-0210},
	shorttitle = {Type 2 diabetics followed up by family physicians},
	doi = {10.1016/j.pcd.2022.07.002},
	abstract = {INTRODUCTION: The treatment of type 2 diabetes mellitus (T2DM) is based on preventive hygiene and dietary measures (HDM), oral antidiabetic drugs (OADs), and insulin. The objective of the present study was to reuse general practice data from electronic health records and describe changes over time among patients with T2DM in primary care.
METHODS: We analyzed data on patients with T2DM collected by three family physicians in Tourcoing (France) from 2006 to 2018.
RESULTS: 403 patients, 1030 treatment sequences, 39,042 appointments, 2440 glycated hemoglobin (HbA1c) measurements, and 9722 wt measurements were included. On inclusion, the mean age was 57.0, the mean weight was 84.4 kg, the mean body mass index was 30.3 kg/m2, and the median HbA1c level was 6.8 \% (51 mmol/mol). The patients were following appropriate HDM (40.7 \%) and/or were being treated with OADs (54.1 \%) or insulin (5.2 \%). The median length of follow-up was 3.51 years. Overall, bodyweight was stable for two years during HDM and then increased. The HbA1c level decreased and then increased during HDM, was stable on OADs, and then decreased on insulin.
DISCUSSION/CONCLUSION: The present descriptive results may be of value in helping to predict changes over time in bodyweight and HbA1c in T2DM.},
	language = {eng},
	journal = {Primary Care Diabetes},
	author = {Boullenger, Léna and Quindroit, Paul and Legrand, Bertrand and Balcaen, Thibaut and Calafiore, Matthieu and Rochoy, Michaël and Beuscart, Jean-Baptiste and Chazard, Emmanuel},
	month = jul,
	year = {2022},
	pmid = {35864077},
	keywords = {Data reuse, Electronic health records, General practice, Glycated hemoglobin, Type 2 diabetes mellitus},
	pages = {S1751--9918(22)00126--7},
}

INTRODUCTION: The treatment of type 2 diabetes mellitus (T2DM) is based on preventive hygiene and dietary measures (HDM), oral antidiabetic drugs (OADs), and insulin. The objective of the present study was to reuse general practice data from electronic health records and describe changes over time among patients with T2DM in primary care. METHODS: We analyzed data on patients with T2DM collected by three family physicians in Tourcoing (France) from 2006 to 2018. RESULTS: 403 patients, 1030 treatment sequences, 39,042 appointments, 2440 glycated hemoglobin (HbA1c) measurements, and 9722 wt measurements were included. On inclusion, the mean age was 57.0, the mean weight was 84.4 kg, the mean body mass index was 30.3 kg/m2, and the median HbA1c level was 6.8 % (51 mmol/mol). The patients were following appropriate HDM (40.7 %) and/or were being treated with OADs (54.1 %) or insulin (5.2 %). The median length of follow-up was 3.51 years. Overall, bodyweight was stable for two years during HDM and then increased. The HbA1c level decreased and then increased during HDM, was stable on OADs, and then decreased on insulin. DISCUSSION/CONCLUSION: The present descriptive results may be of value in helping to predict changes over time in bodyweight and HbA1c in T2DM.

@article{calafiore_gps_2022,
	title = {{GPs}' interest in integrated care for frail older adults and corresponding consulting and prescribing data: qualitative and quantitative analyses of the {PAERPA} integrated care project},
	issn = {1478-5242},
	shorttitle = {{GPs}' interest in integrated care for frail older adults and corresponding consulting and prescribing data},
	doi = {10.3399/BJGP.2021.0626},
	abstract = {BACKGROUND: Integrated care pathways can help to avoid unnecessary admissions to hospital and improve the overall quality of care for frail older patients. Although these integrated care pathways should be coordinated by GPs their level of commitment may vary.
AIM: To profile GPs who had participated or had declined to participate in the Personnes Agées En Risque de Perte d'Autonomie (PAERPA) integrated care project (ICP) in the Valenciennois-Quercitain area of France between 2014 and 2019.
DESIGN AND SETTING: A combined qualitative and quantitative analysis of GPs who were participating in or had declined to participate in the PAERPA ICP.
METHOD: Both GPs participating in the ICP and GPs who chose not to participate in the ICP were interviewed, and then consultation and prescription profiles for these two groups were compared.
RESULTS: Some GPs were interested in the PAERPA ICP, whereas others were opposed. The 48 qualitative interviews revealed four issues that influenced participation in the PAERPA ICP: 1) awareness of issues in care of older adults and the value of collaborative work; 2) time saving; 3) task delegation; and 4) advantages of coordination. The level of interest in the ICP for frail older adults was indirectly reflected by the data on consulting and prescribing. In GPs who participated in the PAERPA ICP there was a greater proportion of older (aged ≥70 years) patients (P{\textless}0.05), a larger number of consultations per year (P{\textless}0.05), and a larger number of home visits (P{\textless}0.01), relative to GPs who declined to participate.
CONCLUSION: The level of interest in the PAERPA ICP for frail older adults varied widely among GPs. These findings suggest that commitment to an integrated care pathway could be increased by customising the recruitment strategy as a function of the GP's profile.},
	language = {eng},
	journal = {The British Journal of General Practice: The Journal of the Royal College of General Practitioners},
	author = {Calafiore, Matthieu and Chazard, Emmanuel and Averlant, Lorette and Ramez, Claire and Sarrazin, Fanny and Leveque, Nathalie and Dambre, Delphine and Verloop, David and Defebvre, Marguerite-Marie and Di Martino, Carla and Beuscart, Jean-Baptiste},
	month = jul,
	year = {2022},
	pmid = {36192356},
	keywords = {frail older adults, general practice, preventive medicine, primary health care},
	pages = {BJGP.2021.0626},
}

BACKGROUND: Integrated care pathways can help to avoid unnecessary admissions to hospital and improve the overall quality of care for frail older patients. Although these integrated care pathways should be coordinated by GPs their level of commitment may vary. AIM: To profile GPs who had participated or had declined to participate in the Personnes Agées En Risque de Perte d'Autonomie (PAERPA) integrated care project (ICP) in the Valenciennois-Quercitain area of France between 2014 and 2019. DESIGN AND SETTING: A combined qualitative and quantitative analysis of GPs who were participating in or had declined to participate in the PAERPA ICP. METHOD: Both GPs participating in the ICP and GPs who chose not to participate in the ICP were interviewed, and then consultation and prescription profiles for these two groups were compared. RESULTS: Some GPs were interested in the PAERPA ICP, whereas others were opposed. The 48 qualitative interviews revealed four issues that influenced participation in the PAERPA ICP: 1) awareness of issues in care of older adults and the value of collaborative work; 2) time saving; 3) task delegation; and 4) advantages of coordination. The level of interest in the ICP for frail older adults was indirectly reflected by the data on consulting and prescribing. In GPs who participated in the PAERPA ICP there was a greater proportion of older (aged ≥70 years) patients (P\textless0.05), a larger number of consultations per year (P\textless0.05), and a larger number of home visits (P\textless0.01), relative to GPs who declined to participate. CONCLUSION: The level of interest in the PAERPA ICP for frail older adults varied widely among GPs. These findings suggest that commitment to an integrated care pathway could be increased by customising the recruitment strategy as a function of the GP's profile.

@article{dang_impact_2022,
	title = {Impact of artificial intelligence in breast cancer screening with mammography},
	issn = {1880-4233},
	doi = {10.1007/s12282-022-01375-9},
	abstract = {OBJECTIVES: To demonstrate that radiologists, with the help of artificial intelligence (AI), are able to better classify screening mammograms into the correct breast imaging reporting and data system (BI-RADS) category, and as a secondary objective, to explore the impact of AI on cancer detection and mammogram interpretation time.
METHODS: A multi-reader, multi-case study with cross-over design, was performed, including 314 mammograms. Twelve radiologists interpreted the examinations in two sessions delayed by a 4 weeks wash-out period with and without AI support. For each breast of each mammogram, they had to mark the most suspicious lesion (if any) and assign it with a forced BI-RADS category and a level of suspicion or "continuous BI-RADS 100". Cohen's kappa correlation coefficient evaluating the inter-observer agreement for BI-RADS category per breast, and the area under the receiver operating characteristic curve (AUC), were used as metrics and analyzed.
RESULTS: On average, the quadratic kappa coefficient increased significantly when using AI for all readers [κ = 0.549, 95\% CI (0.528-0.571) without AI and κ = 0.626, 95\% CI (0.607-0.6455) with AI]. AUC was significantly improved when using AI (0.74 vs 0.77, p = 0.004). Reading time was not significantly affected for all readers (106 s without AI and vs 102 s with AI; p = 0.754).
CONCLUSIONS: When using AI, radiologists were able to better assign mammograms with the correct BI-RADS category without slowing down the interpretation time.},
	language = {eng},
	journal = {Breast Cancer (Tokyo, Japan)},
	author = {Dang, Lan-Anh and Chazard, Emmanuel and Poncelet, Edouard and Serb, Teodora and Rusu, Aniela and Pauwels, Xavier and Parsy, Clémence and Poclet, Thibault and Cauliez, Hugo and Engelaere, Constance and Ramette, Guillaume and Brienne, Charlotte and Dujardin, Sofiane and Laurent, Nicolas},
	month = jun,
	year = {2022},
	pmid = {35763243},
	keywords = {Artificial intelligence, BI-RADS classification, Breast cancer, Mammography},
}

OBJECTIVES: To demonstrate that radiologists, with the help of artificial intelligence (AI), are able to better classify screening mammograms into the correct breast imaging reporting and data system (BI-RADS) category, and as a secondary objective, to explore the impact of AI on cancer detection and mammogram interpretation time. METHODS: A multi-reader, multi-case study with cross-over design, was performed, including 314 mammograms. Twelve radiologists interpreted the examinations in two sessions delayed by a 4 weeks wash-out period with and without AI support. For each breast of each mammogram, they had to mark the most suspicious lesion (if any) and assign it with a forced BI-RADS category and a level of suspicion or "continuous BI-RADS 100". Cohen's kappa correlation coefficient evaluating the inter-observer agreement for BI-RADS category per breast, and the area under the receiver operating characteristic curve (AUC), were used as metrics and analyzed. RESULTS: On average, the quadratic kappa coefficient increased significantly when using AI for all readers [κ = 0.549, 95% CI (0.528-0.571) without AI and κ = 0.626, 95% CI (0.607-0.6455) with AI]. AUC was significantly improved when using AI (0.74 vs 0.77, p = 0.004). Reading time was not significantly affected for all readers (106 s without AI and vs 102 s with AI; p = 0.754). CONCLUSIONS: When using AI, radiologists were able to better assign mammograms with the correct BI-RADS category without slowing down the interpretation time.

@article{lauriot_dit_prevost_re-materialized_2022,
	title = {"{Re}-{Materialized}" {Medical} {Data}: {Paper}-{Based} {Transmission} of {Structured} {Medical} {Data} {Using} {QR}-{Code}, for {Medical} {Imaging} {Reports}},
	volume = {290},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {"{Re}-{Materialized}" {Medical} {Data}},
	doi = {10.3233/SHTI220063},
	abstract = {Although paper-based transmission of medical information might seem outdated, it has proven efficient, and remains structurally safe from massive data leaks. As part of the ICIPEMIR project for improving medical imaging report, we explored the idea of structured data storage within a medical report, by embedding the data themselves in a QR-Code (and no URL-to-the-data). Three different datasets from ICIPEMIR were serialized, then encoded in a QR-Code. We compared 4 compression algorithms to reduce file size before QR-Encoding. YAML was the most concise format (character sparing), and allowed for embedding of a 2633-character serialized file within a QR-Code. The best compression rate was obtained with gzip, with a compression ratio of 2.32 in 15.7ms. Data were easily extracted and decompressed from a digital QR-Code using a simple command line. YAML file was also successfully recovered from the printed QR-Code with both Android and iOS smartphone. Minimal detected size was 3*3cm.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Lauriot Dit Prevost, Arthur and Bentegeac, Raphaël and Dequesnes, Audrey and Billiau, Adrien and Baudelet, Emmanuel and Legleye, Rémi and Hubaut, Marc-Antoine and Cassagnou, Michel and Puech, Philippe and Besson, Rémi and Chazard, Emmanuel},
	month = jun,
	year = {2022},
	pmid = {35673002},
	keywords = {Data Collection, Data Compression, Health Information Exchange},
	pages = {210--214},
}

Although paper-based transmission of medical information might seem outdated, it has proven efficient, and remains structurally safe from massive data leaks. As part of the ICIPEMIR project for improving medical imaging report, we explored the idea of structured data storage within a medical report, by embedding the data themselves in a QR-Code (and no URL-to-the-data). Three different datasets from ICIPEMIR were serialized, then encoded in a QR-Code. We compared 4 compression algorithms to reduce file size before QR-Encoding. YAML was the most concise format (character sparing), and allowed for embedding of a 2633-character serialized file within a QR-Code. The best compression rate was obtained with gzip, with a compression ratio of 2.32 in 15.7ms. Data were easily extracted and decompressed from a digital QR-Code using a simple command line. YAML file was also successfully recovered from the printed QR-Code with both Android and iOS smartphone. Minimal detected size was 3*3cm.

@article{kerisit_awareness_2022,
	title = {Awareness and {Perception} of {Google}® {Reviews} {Among} {French} {GPs}},
	volume = {290},
	issn = {1879-8365},
	doi = {10.3233/SHTI220296},
	abstract = {The objective of this study was to assess the perception of French general practitioners (GPs) and the impact of the Google® online physician rating system. We questioned the French GPs with a self-administered questionnaire. A total of 412 GPs had answered the complete questionnaire. 83.25\% of respondents did not validate the relevance of the physician rating websites. The most decried limitations were the lack of validity of these opinions and the negative impact on physicians.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Kerisit, Erwan and Legrand, Bertrand and Calafiore, Matthieu and Rochoy, Michaël and Chazard, Emmanuel and Marcilly, Romaric and Lamer, Antoine},
	month = jun,
	year = {2022},
	pmid = {35673234},
	keywords = {General Practitioners, Internet, Physician rating websites},
	pages = {1118--1119},
}

The objective of this study was to assess the perception of French general practitioners (GPs) and the impact of the Google® online physician rating system. We questioned the French GPs with a self-administered questionnaire. A total of 412 GPs had answered the complete questionnaire. 83.25% of respondents did not validate the relevance of the physician rating websites. The most decried limitations were the lack of validity of these opinions and the negative impact on physicians.

@article{tabla_artificial_2022,
	title = {Artificial {Intelligence} and {Clinical} {Decision} {Support} {Systems} or {Automated} {Interpreters}: {What} {Characteristics} {Are} {Expected} by {French} {General} {Practitioners}?},
	volume = {290},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {Artificial {Intelligence} and {Clinical} {Decision} {Support} {Systems} or {Automated} {Interpreters}},
	doi = {10.3233/SHTI220207},
	abstract = {Development of artificial intelligence (AI) modules should rely on technical progress, but also on users' needs. Our objective is to identify criteria that make a hypothetical AI module desirable for general practitioners (GPs). Method: random selection of 200 French GPs, and paper-based questionnaire. Results: the population was representative. GPs expect AI modules to diagnose or eliminate an urgent pathology for which they are not competent and for which specialists are not available. They also demand interoperability, automated electronic health record integration and facilitated information sharing. GPs would like AI modules to make them save time, simplify some procedures and delegate tasks to the secretary. They expect AI modules to allow them to associate the patient with the care, to reassure him or her, and to personalize the care. Interestingly, GPs would also rely on a machine to cut off abusive requests, such as work stoppages or certificates of convenience.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Tabla, Smaïn and Calafiore, Matthieu and Legrand, Bertrand and Descamps, Axel and Andre, Charlotte and Rochoy, Michaël and Chazard, Emmanuel},
	month = jun,
	year = {2022},
	pmid = {35673146},
	keywords = {Artificial intelligence, automated diagnosis, computerized interpreter, usability},
	pages = {887--891},
}

Development of artificial intelligence (AI) modules should rely on technical progress, but also on users' needs. Our objective is to identify criteria that make a hypothetical AI module desirable for general practitioners (GPs). Method: random selection of 200 French GPs, and paper-based questionnaire. Results: the population was representative. GPs expect AI modules to diagnose or eliminate an urgent pathology for which they are not competent and for which specialists are not available. They also demand interoperability, automated electronic health record integration and facilitated information sharing. GPs would like AI modules to make them save time, simplify some procedures and delegate tasks to the secretary. They expect AI modules to allow them to associate the patient with the care, to reassure him or her, and to personalize the care. Interestingly, GPs would also rely on a machine to cut off abusive requests, such as work stoppages or certificates of convenience.

@article{chazard_book_2022,
	title = {"{Book} {Music}" {Representation} for {Temporal} {Data}, as a {Part} of the {Feature} {Extraction} {Process}: {A} {Novel} {Approach} to {Improve} the {Handling} of {Time}-{Dependent} {Data} in {Secondary} {Use} of {Healthcare} {Structured} {Data}},
	volume = {290},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {"{Book} {Music}" {Representation} for {Temporal} {Data}, as a {Part} of the {Feature} {Extraction} {Process}},
	doi = {10.3233/SHTI220141},
	abstract = {Book music is extensively used in street organs. It consists of thick cardboard, containing perforated holes specifying the musical notes. We propose to represent clinical time-dependent data in a tabular form inspired from this principle. The sheet represents a statistical individual, each row represents a binary time-dependent variable, and each hole denotes the "true" value. Data from electronic health records or nationwide medical-administrative databases can then be represented: demographics, patient flow, drugs, laboratory results, diagnoses, and procedures. This data representation is suitable for survival analysis (e.g., Cox model with repeated outcomes and changing covariates) and different types of temporal association rules. Quantitative continuous variables can be discretized, as in clinical studies. The "book music" approach could become an intermediary step in feature extraction from structured data. It would enable to better account for time in analyses, notably for historical cohort analyses based on healthcare data reuse.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Chazard, Emmanuel and Balaye, Pierre and Balcaen, Thibaut and Genin, Michaël and Cuggia, Marc and Bouzille, Guillaume and Lamer, Antoine},
	month = jun,
	year = {2022},
	pmid = {35673080},
	keywords = {Data reuse, feature extraction, survival analyses},
	pages = {567--571},
}

Book music is extensively used in street organs. It consists of thick cardboard, containing perforated holes specifying the musical notes. We propose to represent clinical time-dependent data in a tabular form inspired from this principle. The sheet represents a statistical individual, each row represents a binary time-dependent variable, and each hole denotes the "true" value. Data from electronic health records or nationwide medical-administrative databases can then be represented: demographics, patient flow, drugs, laboratory results, diagnoses, and procedures. This data representation is suitable for survival analysis (e.g., Cox model with repeated outcomes and changing covariates) and different types of temporal association rules. Quantitative continuous variables can be discretized, as in clinical studies. The "book music" approach could become an intermediary step in feature extraction from structured data. It would enable to better account for time in analyses, notably for historical cohort analyses based on healthcare data reuse.

@article{rochoy_doping_2022,
	title = {Doping with aromatase inhibitors and oestrogen receptor modulators in steroid users: {Analysis} of a forum to identify dosages, durations and adverse drug reactions},
	issn = {1958-5578},
	shorttitle = {Doping with aromatase inhibitors and oestrogen receptor modulators in steroid users},
	doi = {10.1016/j.therap.2022.03.004},
	abstract = {INTRODUCTION: Some users of anabolic androgenic steroids (AAS) secretly consume aromatase inhibitors (AI) and selective oestrogen receptor modulators (SERM). Cyber-forums can be potential sources of information. Our aim was to determine the cycles used, and to identify the adverse drug reactions (ADRs) experienced, reported in a bodybuilding forum.
METHOD: We collected discussions on a French forum for AAS users (MESO-Rx®), from January 2013 to 2019 on concerning clomiphene, tamoxifen, anastrozole, exemestane and letrozole were collected. Characteristics of the users, duration of cures, treatments, dosages, point of purchase and occurrence of ADRs were analysed.
RESULTS: Among the 1792 posts published on the forum, 845 concerned SERM and 571 concerned AI, i.e. 2180 drugs used (several cycles included concomitant consumption). Our population was exclusively male, with an average age of 28.2±6.3years, and had been practising weight training for 6.7±5.6years. The SERMs were mainly used to "revive the hypothalamohypophyseal axis" and the AIs to "fight against androgen aromatisation". The median treatment duration was 22 days for SERM, 70days for anastrozole, 84days for exemestane and 30days for letrozole, with a mean dose of 69mg/d for clomiphene, 22mg/d for tamoxifen, 0.4mg/d for anastrozole, 10mg/d for exemestane, 2mg/d for letrozole. The main way of obtaining these drugs was through the internet. 157 ADRs were identified: 95 for SERMs and 62 for AI. The most represented were acne, musculoskeletal, mood and reproductive disorders. Impaired quality of life (according to the patient) was described in 54\% of the SERM posts and 26\% of the AI posts.
CONCLUSIONS: Patient narratives posted on forums can be a useful tool in the context of doping, to better understand practices, motivations and possibly to bring up pharmacovigilance signals.},
	language = {eng},
	journal = {Therapie},
	author = {Rochoy, Michaël and Danel, Antoine and Chazard, Emmanuel and Gautier, Sophie and Berkhout, Christophe},
	month = apr,
	year = {2022},
	pmid = {35660259},
	keywords = {Aromatase inhibitors, Doping, Forums, Oestrogen receptor modulators, Pharmacovigilance},
	pages = {S0040--5957(22)00064--6},
}

INTRODUCTION: Some users of anabolic androgenic steroids (AAS) secretly consume aromatase inhibitors (AI) and selective oestrogen receptor modulators (SERM). Cyber-forums can be potential sources of information. Our aim was to determine the cycles used, and to identify the adverse drug reactions (ADRs) experienced, reported in a bodybuilding forum. METHOD: We collected discussions on a French forum for AAS users (MESO-Rx®), from January 2013 to 2019 on concerning clomiphene, tamoxifen, anastrozole, exemestane and letrozole were collected. Characteristics of the users, duration of cures, treatments, dosages, point of purchase and occurrence of ADRs were analysed. RESULTS: Among the 1792 posts published on the forum, 845 concerned SERM and 571 concerned AI, i.e. 2180 drugs used (several cycles included concomitant consumption). Our population was exclusively male, with an average age of 28.2±6.3years, and had been practising weight training for 6.7±5.6years. The SERMs were mainly used to "revive the hypothalamohypophyseal axis" and the AIs to "fight against androgen aromatisation". The median treatment duration was 22 days for SERM, 70days for anastrozole, 84days for exemestane and 30days for letrozole, with a mean dose of 69mg/d for clomiphene, 22mg/d for tamoxifen, 0.4mg/d for anastrozole, 10mg/d for exemestane, 2mg/d for letrozole. The main way of obtaining these drugs was through the internet. 157 ADRs were identified: 95 for SERMs and 62 for AI. The most represented were acne, musculoskeletal, mood and reproductive disorders. Impaired quality of life (according to the patient) was described in 54% of the SERM posts and 26% of the AI posts. CONCLUSIONS: Patient narratives posted on forums can be a useful tool in the context of doping, to better understand practices, motivations and possibly to bring up pharmacovigilance signals.

@article{chazard_orgue_2022,
	series = {{VIIIe} {Colloque} national {Adelf}-{Emois}},
	title = {L'orgue de barbarie : proposition d'une représentation des données de santé temps-dépendantes, visant à faciliter leur réutilisation},
	volume = {70},
	issn = {0398-7620},
	shorttitle = {L'orgue de barbarie},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762022000694},
	doi = {10.1016/j.respe.2022.01.068},
	abstract = {Introduction
Les données structurées d'entrepôts de santé sont complexes (centaines de tables, variables qualitatives multivaluées, déséquilibrées, manquantes). L'extraction de caractéristique génère des données ressemblant aux données de questionnaires, aisément analysables. Trop souvent, elle écrase la temporalité des données.
Objectif
Proposer une méthodologie d'extraction de caractéristiques sécurisant la gestion du temps.
Méthodes
Analogie entre les partitions d'orgue de barbarie et les données de santé temps-dépendantes. Etude de compatibilité avec les données structurées fréquemment rencontrées (PMSI, médicaments, biologie médicale). Etude de compatibilité avec les méthodes statistiques d'analyse de données temps-dépendantes.
Résultats
Les partitions d'orgue de barbarie sont constituées de pistes représentant des notes, qui peuvent être actives (perforées) ou non. Ces pistes synchronisées défilent et jouent une musique. Pareillement, un patient peut être représentée par des variables temps dépendantes (même le sexe), volontiers binaires. Il s'agit d'événements ponctuel (notes "staccato") ou d'états prolongées (notes tenues). Ce modèle de données est compatible avec les données usuelles de santé : - les mouvements, événements (admission, mutation) ou états (séjour, passage en soins intensifs) - les données démographiques (âge en classes, sexe) - les mesures de biologie médicale, événements (mesure) ou états (hypo/hyper/normo-kaliémie, période sans mesure) - les médicaments, avec ou sans dose (kayexalate, kayexalate {\textgreater} 15) - les codes PMSI, événements (actes CCAM) ou états (diagnostics CIM10). Cette représentation intermédiaire de données serait compatible avec toutes les caractéristiques du modèle de Cox à covariables temps dépendantes, des arbres de survie, et des règles d'association temporelles, hormis l'utilisation directe de variables quantitatives.
Discussion/Conclusion
L'extraction de caractéristiques serait ainsi séparée en : 1 - génération d'une partition d'orgue de barbarie (simplifie la structure des données, abolit l'hétérogénéité, préserve le temps) ; 2 - constitution de données de type questionnaire (simplifie le temps ou le décrit comme une variable). La forme des données étant standardisée par cette approche, la deuxième étape s'appuiera sur des fonctions standardisées (ex : état à un instant, pire état durant une période, temps passé dans un état, délai jusqu'à un événement).},
	language = {fr},
	urldate = {2022-05-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Chazard, E. and Balaye, P. and Balcaen, T. and Genin, M. and Cuggia, M. and Bouzille, G. and Lamer, A.},
	month = mar,
	year = {2022},
	keywords = {Analyses de survie, Extraction de caractéristiques, Réutilisation de données},
	pages = {S8},
}

Introduction Les données structurées d'entrepôts de santé sont complexes (centaines de tables, variables qualitatives multivaluées, déséquilibrées, manquantes). L'extraction de caractéristique génère des données ressemblant aux données de questionnaires, aisément analysables. Trop souvent, elle écrase la temporalité des données. Objectif Proposer une méthodologie d'extraction de caractéristiques sécurisant la gestion du temps. Méthodes Analogie entre les partitions d'orgue de barbarie et les données de santé temps-dépendantes. Etude de compatibilité avec les données structurées fréquemment rencontrées (PMSI, médicaments, biologie médicale). Etude de compatibilité avec les méthodes statistiques d'analyse de données temps-dépendantes. Résultats Les partitions d'orgue de barbarie sont constituées de pistes représentant des notes, qui peuvent être actives (perforées) ou non. Ces pistes synchronisées défilent et jouent une musique. Pareillement, un patient peut être représentée par des variables temps dépendantes (même le sexe), volontiers binaires. Il s'agit d'événements ponctuel (notes "staccato") ou d'états prolongées (notes tenues). Ce modèle de données est compatible avec les données usuelles de santé : - les mouvements, événements (admission, mutation) ou états (séjour, passage en soins intensifs) - les données démographiques (âge en classes, sexe) - les mesures de biologie médicale, événements (mesure) ou états (hypo/hyper/normo-kaliémie, période sans mesure) - les médicaments, avec ou sans dose (kayexalate, kayexalate \textgreater 15) - les codes PMSI, événements (actes CCAM) ou états (diagnostics CIM10). Cette représentation intermédiaire de données serait compatible avec toutes les caractéristiques du modèle de Cox à covariables temps dépendantes, des arbres de survie, et des règles d'association temporelles, hormis l'utilisation directe de variables quantitatives. Discussion/Conclusion L'extraction de caractéristiques serait ainsi séparée en : 1 - génération d'une partition d'orgue de barbarie (simplifie la structure des données, abolit l'hétérogénéité, préserve le temps) ; 2 - constitution de données de type questionnaire (simplifie le temps ou le décrit comme une variable). La forme des données étant standardisée par cette approche, la deuxième étape s'appuiera sur des fonctions standardisées (ex : état à un instant, pire état durant une période, temps passé dans un état, délai jusqu'à un événement).

@article{tabla_intelligence_2022,
	series = {{VIIIe} {Colloque} national {Adelf}-{Emois}},
	title = {Intelligence artificielle et systèmes d'aide à la décision ou d'interprétation automatisée : quelles sont les attentes des médecins généralistes libéraux français ?},
	volume = {70},
	issn = {0398-7620},
	shorttitle = {Intelligence artificielle et systèmes d'aide à la décision ou d'interprétation automatisée},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762022000475},
	doi = {10.1016/j.respe.2022.01.046},
	abstract = {Introduction
L'intelligence artificielle (IA) a déjà de nombreuses applications en médecine générale (MG): interpréteurs automatisés d'ECG, stéthoscopes intelligents, etc. En 2018 déjà, un quart des MG français étaient équipés de modules d'IA. Le développement de nouveaux modules est cependant guidé par la technologie, et non par les besoins, ce qui amène à des produits parfois incohérents. Notre objectif est d'identifier ces besoins.
Méthodes
Nous avons envoyé un questionnaire papier à 200 MG tirés au sort sur le territoire, avec enveloppe retour prétimbrée. Les sondés ont tous été relancés par téléphone à deux semaines.
Résultats
Parmi les sondés, 139 MG (69,5 \%) ont répondu. Treize étant de pauvre qualité, 126 réponses ont été analysées. Caractéristiques des répondants: 66 femmes (52,4 \%), âge moyen 47,8 ans (SD=11,2), 88 en cabinet de groupe (71,0 \%), 90 en ville (71,4 \%). Les MG déclarent désirer des modules qui permettent de (par intérêt décroissant): - poser ou éliminer un diagnostic urgent - poser un diagnostic pour lequel le MG n'est pas compétent, ou aucun spécialiste n'est disponible - enregistrer automatiquement l'information dans le dossier patient, la partager avec un autre professionnel - simplifier un acte, passer plus de temps avec le patient, déléguer des tâches au secrétariat - exercer une médecine personnalisée, prédire un niveau de risque - impliquer et rassurer le patient - couper court à des demandes abusives (certificats de complaisance, arrêts de travail) - former le MG. Les MG rejettent les modules qui déclencheraient automatiquement un appel au 15, décideraient automatiquement, interviendraient dans leur champ de compétence, ou pourraient être utilisés par le patient lui-même en salle d'attente. Les MG sont indifférents aux autres items proposés. De nombreuses caractéristiques dépendent du profil (sexe, âge, lieu d'exercice).
Discussion/Conclusion
Les fabricants développent à ce jour essentiellement des modules permettant de remplacer des spécialistes, pour des maladies chroniques. Ils devraient envisager en priorité de s'intéresser aux urgences, en assistance et non en remplacement des médecins.},
	language = {fr},
	urldate = {2022-05-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Tabla, S. and Calafiore, M. and Legrand, B. and Descamps, A. and André, C. and Rochoy, M. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2022},
	keywords = {Intelligence artificielle, Interpréteur automatisé, Utilisabilité},
	pages = {S51},
}

Introduction L'intelligence artificielle (IA) a déjà de nombreuses applications en médecine générale (MG): interpréteurs automatisés d'ECG, stéthoscopes intelligents, etc. En 2018 déjà, un quart des MG français étaient équipés de modules d'IA. Le développement de nouveaux modules est cependant guidé par la technologie, et non par les besoins, ce qui amène à des produits parfois incohérents. Notre objectif est d'identifier ces besoins. Méthodes Nous avons envoyé un questionnaire papier à 200 MG tirés au sort sur le territoire, avec enveloppe retour prétimbrée. Les sondés ont tous été relancés par téléphone à deux semaines. Résultats Parmi les sondés, 139 MG (69,5 %) ont répondu. Treize étant de pauvre qualité, 126 réponses ont été analysées. Caractéristiques des répondants: 66 femmes (52,4 %), âge moyen 47,8 ans (SD=11,2), 88 en cabinet de groupe (71,0 %), 90 en ville (71,4 %). Les MG déclarent désirer des modules qui permettent de (par intérêt décroissant): - poser ou éliminer un diagnostic urgent - poser un diagnostic pour lequel le MG n'est pas compétent, ou aucun spécialiste n'est disponible - enregistrer automatiquement l'information dans le dossier patient, la partager avec un autre professionnel - simplifier un acte, passer plus de temps avec le patient, déléguer des tâches au secrétariat - exercer une médecine personnalisée, prédire un niveau de risque - impliquer et rassurer le patient - couper court à des demandes abusives (certificats de complaisance, arrêts de travail) - former le MG. Les MG rejettent les modules qui déclencheraient automatiquement un appel au 15, décideraient automatiquement, interviendraient dans leur champ de compétence, ou pourraient être utilisés par le patient lui-même en salle d'attente. Les MG sont indifférents aux autres items proposés. De nombreuses caractéristiques dépendent du profil (sexe, âge, lieu d'exercice). Discussion/Conclusion Les fabricants développent à ce jour essentiellement des modules permettant de remplacer des spécialistes, pour des maladies chroniques. Ils devraient envisager en priorité de s'intéresser aux urgences, en assistance et non en remplacement des médecins.

@article{prevost_amelioration_2022,
	series = {{VIIIe} {Colloque} national {Adelf}-{Emois}},
	title = {Amélioration des compte rendus d'imagerie médicale: exhaustivité, interopérabilité, et support d'information patient},
	volume = {70},
	issn = {0398-7620},
	shorttitle = {Amélioration des compte rendus d'imagerie médicale},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762022000268},
	doi = {10.1016/j.respe.2022.01.025},
	abstract = {Introduction
La production de compte rendus médicaux est une tache chronophage, mais c'est une étape clef de l'information médicale. Des voies d'optimisation pourraient être: qualité du contenu (exhaustivité, structuration), compréhension par les patients (schéma explicatif), rédaction (production semi-automatisée), transmission et stockage (interopérabilité). Nous avons imaginé le projet "ICIPEMIR" (« Improving the completeness, interoperability and patients explanation of medical imaging reports »), afin d'améliorer la production des compte rendus d'imagerie médicale. Nous décrivons ici la partie médicale et académique de ce projet, visant à de déterminer les informations nécessaires à chaque type de compte rendu d'imagerie.
Méthodes
Nous proposons une méthodologie reproductible pour identifier -pour un type d'examen- les champs nécessaires au compte rendu. Ils doivent répondre aux exigences légales, aux recommandations de sociétés savantes du domaine, et à une revue de littérature du domaine. Puis un modèle de donnée est successivement établi à partir de ces champs (UML, JSON Schema, YAML). Basé sur ce modèle de données, un formulaire est généré en utilisant l'outil open source d'e-CRF Goupile. De plus, une représentation graphique est modélisée, en lien avec le modèle de données, de même qu'un modèle de document textuel. Enfin, l'instance YAML est encodée dans un QR-Code pour permettre une transmission (re-)matérialisée des données structurées.
Résultats
Nous avons testé cette méthode pour le compte rendu de scanner dans la lithiase urinaire. Nous avons défini 73 champs, transformés en modèle de données, avec une représentation graphique, et un modèle de document textuel. Le QR-Code a permis la transmission d'un fichier YAML de 2615 caractères, décodé à l'aide d'un smartphone.
Discussion/Conclusion
Bien que la production automatisée de compte rendus médicaux nécessite des modèles de données spécifiques à chaque domaine, ils pourraient être définis itérativement en utilisant une méthodologie reproductible, à travers des travaux académiques dédiés. La suite de nos travaux aura pour but de définir un méta-modèle, et d'homogénéiser ces modèles de données en lien avec les référentiels de terminologies.},
	language = {fr},
	urldate = {2022-05-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Prevost, A. Lauriot Dit and Gaillard, V. and Bouzille, G. and Besson, R. and Sharma, D. and Puech, P. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2022},
	keywords = {Imagerie médicale, Interopérabilité Compte rendu médical, Transmission d'information},
	pages = {S42},
}

Introduction La production de compte rendus médicaux est une tache chronophage, mais c'est une étape clef de l'information médicale. Des voies d'optimisation pourraient être: qualité du contenu (exhaustivité, structuration), compréhension par les patients (schéma explicatif), rédaction (production semi-automatisée), transmission et stockage (interopérabilité). Nous avons imaginé le projet "ICIPEMIR" (« Improving the completeness, interoperability and patients explanation of medical imaging reports »), afin d'améliorer la production des compte rendus d'imagerie médicale. Nous décrivons ici la partie médicale et académique de ce projet, visant à de déterminer les informations nécessaires à chaque type de compte rendu d'imagerie. Méthodes Nous proposons une méthodologie reproductible pour identifier -pour un type d'examen- les champs nécessaires au compte rendu. Ils doivent répondre aux exigences légales, aux recommandations de sociétés savantes du domaine, et à une revue de littérature du domaine. Puis un modèle de donnée est successivement établi à partir de ces champs (UML, JSON Schema, YAML). Basé sur ce modèle de données, un formulaire est généré en utilisant l'outil open source d'e-CRF Goupile. De plus, une représentation graphique est modélisée, en lien avec le modèle de données, de même qu'un modèle de document textuel. Enfin, l'instance YAML est encodée dans un QR-Code pour permettre une transmission (re-)matérialisée des données structurées. Résultats Nous avons testé cette méthode pour le compte rendu de scanner dans la lithiase urinaire. Nous avons défini 73 champs, transformés en modèle de données, avec une représentation graphique, et un modèle de document textuel. Le QR-Code a permis la transmission d'un fichier YAML de 2615 caractères, décodé à l'aide d'un smartphone. Discussion/Conclusion Bien que la production automatisée de compte rendus médicaux nécessite des modèles de données spécifiques à chaque domaine, ils pourraient être définis itérativement en utilisant une méthodologie reproductible, à travers des travaux académiques dédiés. La suite de nos travaux aura pour but de définir un méta-modèle, et d'homogénéiser ces modèles de données en lien avec les référentiels de terminologies.

@article{bannay_apport_2022,
	series = {{VIIIe} {Colloque} national {Adelf}-{Emois}},
	title = {Apport du {PMSI} pour l'appariement de données cliniques hospitalières avec le {SNDS} : cas d'usage en pharmacovigilance sur les patients consommateurs de statines},
	volume = {70},
	issn = {0398-7620},
	shorttitle = {Apport du {PMSI} pour l'appariement de données cliniques hospitalières avec le {SNDS}},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762022000748},
	doi = {10.1016/j.respe.2022.01.073},
	abstract = {Introduction
L'appariement de différentes sources de données de santé est une approche prometteuse dans l'analyse des parcours de soins. Le projet INSHARE voulait proposer un cadre à une plateforme technologique pour faciliter l'intégration, le partage et la réutilisation de données issues de deux sources : i) un entrepôt de données cliniques hospitalières et d'une extraction du Système national des données de santé (SNDS). L'objectif de cette étude était de montrer l'intérêt de la plateforme INSHARE pour l'analyse de données massives en santé à partir d'un cas d'usage en pharmacovigilance chez des sujets consommateurs de statines.
Méthodes
Une méthode d'appariement semi-déterministe entre les données de l'entrepôt de données hospitalières du CHU de Rennes et celles du SNDS a été développée à partir des variables du PMSI entre 2015 et 2017. Un cas d'usage en pharmacovigilance a recruté une cohorte de patients traités par statines. La base de connaissance Thériaque a permis d'identifier les médicaments potentiellement en interaction avec les statines allant des contre-indications aux précautions d'emploi.
Résultats
A partir des 161 532 patients issus du SNDS et des 164 316 patients issus de l'entrepôt eHOP, 159 495 ont pu être appariés (98,74 \% pour le SNDS et 97,07 \% pour eHOP). Parmi les 16 806 patients sous statines, 8293 patients initialement traités en ville poursuivaient ce traitement à l'hôpital, 6382 patients arrêtaient les statines lors de leur hospitalisation et 2132 patients initiaient leur traitement au cours de leur séjour hospitalier. La prévalence des interactions variait entre 22,17 \% en ville et 36,47 \% à l'hôpital (p{\textless}0,001). La lourdeur des prises en charge hospitalières était plus importante chez les patients présentant une interaction durant leur séjour hospitalier.
Discussion/Conclusion
Montrant l'intérêt de la réutilisation et de la complémentarité de données cliniques et médico-administratives, ce travail s'inscrit dans le cadre de la transition entre les systèmes d'information en santé et les systèmes apprenant en santé fondés sur la connaissance issue des données en vie réelle.},
	language = {fr},
	urldate = {2022-05-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Bannay, A. and Bories, M. and Corre, P. Le and Riou, C. and Lemordant, P. and Van Hille, P. and Chazard, E. and Dode, X. and Cuggia, M. and Bouzille, G.},
	month = mar,
	year = {2022},
	keywords = {Appariement, Pharmacovigilance, Réutilisation de données, SNDS},
	pages = {S10},
}

Introduction L'appariement de différentes sources de données de santé est une approche prometteuse dans l'analyse des parcours de soins. Le projet INSHARE voulait proposer un cadre à une plateforme technologique pour faciliter l'intégration, le partage et la réutilisation de données issues de deux sources : i) un entrepôt de données cliniques hospitalières et d'une extraction du Système national des données de santé (SNDS). L'objectif de cette étude était de montrer l'intérêt de la plateforme INSHARE pour l'analyse de données massives en santé à partir d'un cas d'usage en pharmacovigilance chez des sujets consommateurs de statines. Méthodes Une méthode d'appariement semi-déterministe entre les données de l'entrepôt de données hospitalières du CHU de Rennes et celles du SNDS a été développée à partir des variables du PMSI entre 2015 et 2017. Un cas d'usage en pharmacovigilance a recruté une cohorte de patients traités par statines. La base de connaissance Thériaque a permis d'identifier les médicaments potentiellement en interaction avec les statines allant des contre-indications aux précautions d'emploi. Résultats A partir des 161 532 patients issus du SNDS et des 164 316 patients issus de l'entrepôt eHOP, 159 495 ont pu être appariés (98,74 % pour le SNDS et 97,07 % pour eHOP). Parmi les 16 806 patients sous statines, 8293 patients initialement traités en ville poursuivaient ce traitement à l'hôpital, 6382 patients arrêtaient les statines lors de leur hospitalisation et 2132 patients initiaient leur traitement au cours de leur séjour hospitalier. La prévalence des interactions variait entre 22,17 % en ville et 36,47 % à l'hôpital (p\textless0,001). La lourdeur des prises en charge hospitalières était plus importante chez les patients présentant une interaction durant leur séjour hospitalier. Discussion/Conclusion Montrant l'intérêt de la réutilisation et de la complémentarité de données cliniques et médico-administratives, ce travail s'inscrit dans le cadre de la transition entre les systèmes d'information en santé et les systèmes apprenant en santé fondés sur la connaissance issue des données en vie réelle.

@article{prevost_transmission_2022,
	series = {{VIIIe} {Colloque} national {Adelf}-{Emois}},
	title = {Transmission “{Re}-matérialisée” : intégration de données structurées au sein d'un compte rendu d'imagerie médicale, par l'utilisation de {QR}-{Code}},
	volume = {70},
	issn = {0398-7620},
	shorttitle = {Transmission “{Re}-matérialisée”},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762022000736},
	doi = {10.1016/j.respe.2022.01.072},
	abstract = {Introduction
Bien qu'elle puisse sembler obsolète, la transmission d'information médicale via le compte-rendu "papier" a prouvé son efficacité. Ce canal de communication reste à l'abri de fuites de données massives ou de piratage. Dans le cadre de notre projet "ICIPEMIR", visant à améliorer les compte rendus d'imagerie médicale, nous avons cherché à explorer l'idée d'une intégration de données structurées au sein même du compte rendu "papier", en encodant les données dans un QR-Code (et non une URL menant à des données centralisées), en considérant la limite de caractères imposée par le format QR-Code
Méthodes
Trois jeux de données issus du projet ICIPEMIR ont été sérialisés aux formats XML, JSON et YAML. Les fichiers ont été comparés sur le nombre de caractères, puis les données ont été intégrées dans un QR-Code. Afin de réduire la taille des fichiers avant intégration dans le QR-Code, nous avons comparé quatre algorithmes de compression. Les algorithmes de compression décompression étaient comparés sur la vitesse d'exécution et le ratio de compression. La faisabilité de l'utilisation du QR-Code était testée avec un décodage « digital » (analyse du fichier image), et physique (Scan par smartphone du QR-Code imprimé de taille progressivement décroissante).
Résultats
Le format YAML était le plus concis. L'algorithme gzip était le plus performant (ratio de compression 2.32 en 15.7ms). La capacité maximale d'un QR-Code pour un fichier binaire est de 2953 caractères (eg. ISO 8859-1). Le décodage « digital », avec extraction et décompression des données était obtenu sans difficultés par une simple ligne de commande. Le fichier YAML était également aisément récupéré par un smartphone (Android et iOS). La taille de QR-Code minimale permettant la détection était de 3*3 cm.
Discussion/Conclusion
L'utilisation de QR-Code pourrait permettre la transmission de données structurées via le canal de transmission traditionnel des documents "papier". Cette solution pourrait permettre de contourner certaines difficultés techniques de l'interopérabilité physique entre les différents établissements de soin},
	language = {fr},
	urldate = {2022-05-02},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Prevost, A. Lauriot Dit and Bentegeac, R. and Desquesnes, A. and Billiau, A. and Baudelet, E. and Legleye, R. and Puech, P. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2022},
	keywords = {Interopérabilité, QR-Code, Transmission d'information médicale},
	pages = {S9--S10},
}

Introduction Bien qu'elle puisse sembler obsolète, la transmission d'information médicale via le compte-rendu "papier" a prouvé son efficacité. Ce canal de communication reste à l'abri de fuites de données massives ou de piratage. Dans le cadre de notre projet "ICIPEMIR", visant à améliorer les compte rendus d'imagerie médicale, nous avons cherché à explorer l'idée d'une intégration de données structurées au sein même du compte rendu "papier", en encodant les données dans un QR-Code (et non une URL menant à des données centralisées), en considérant la limite de caractères imposée par le format QR-Code Méthodes Trois jeux de données issus du projet ICIPEMIR ont été sérialisés aux formats XML, JSON et YAML. Les fichiers ont été comparés sur le nombre de caractères, puis les données ont été intégrées dans un QR-Code. Afin de réduire la taille des fichiers avant intégration dans le QR-Code, nous avons comparé quatre algorithmes de compression. Les algorithmes de compression décompression étaient comparés sur la vitesse d'exécution et le ratio de compression. La faisabilité de l'utilisation du QR-Code était testée avec un décodage « digital » (analyse du fichier image), et physique (Scan par smartphone du QR-Code imprimé de taille progressivement décroissante). Résultats Le format YAML était le plus concis. L'algorithme gzip était le plus performant (ratio de compression 2.32 en 15.7ms). La capacité maximale d'un QR-Code pour un fichier binaire est de 2953 caractères (eg. ISO 8859-1). Le décodage « digital », avec extraction et décompression des données était obtenu sans difficultés par une simple ligne de commande. Le fichier YAML était également aisément récupéré par un smartphone (Android et iOS). La taille de QR-Code minimale permettant la détection était de 3*3 cm. Discussion/Conclusion L'utilisation de QR-Code pourrait permettre la transmission de données structurées via le canal de transmission traditionnel des documents "papier". Cette solution pourrait permettre de contourner certaines difficultés techniques de l'interopérabilité physique entre les différents établissements de soin

@article{nicot_three-dimensional_2022,
	title = {Three-{Dimensional} {Printing} {Model} {Enhances} {Craniofacial} {Trauma} {Teaching} by {Improving} {Morphologic} and {Biomechanical} {Understanding}: {A} {Randomized} {Controlled} {Study}},
	volume = {149},
	issn = {1529-4242},
	shorttitle = {Three-{Dimensional} {Printing} {Model} {Enhances} {Craniofacial} {Trauma} {Teaching} by {Improving} {Morphologic} and {Biomechanical} {Understanding}},
	doi = {10.1097/PRS.0000000000008869},
	abstract = {BACKGROUND: Teaching about craniofacial traumas is challenging given the complexity of the craniofacial anatomy and the necessity for good spatial representation skills. To solve these problems, three-dimensional printing seems to be an appropriate educative material. In this study, the authors conducted a randomized controlled trial. The authors' main objective was to compare the performance of the undergraduate medical students in an examination based on the teaching support: three-dimensionally printed models versus two-dimensional pictures.
METHODS: All participants were randomly assigned to one of two groups using a random number table: the three-dimensionally-printed support group (three-dimensional group) or the two-dimensionally-displayed support group (two-dimensional group). All participants completed a multiple-choice question evaluation questionnaire on facial traumatology (first, a zygomatic bone fracture; then, a double mandible fracture). Sex and potential confounding factors were evaluated.
RESULTS: Four hundred thirty-two fifth-year undergraduate medical students were enrolled in this study. Two hundred six students were allocated to the three-dimensional group, and 226 were allocated to the two-dimensional group. The three-dimensionally printed model was considered to be a better teaching material compared with two-dimensional support. The global mean score was 2.36 in the three-dimensional group versus 1.99 in the two-dimensional group (p = 0.008). Regarding teaching of biomechanical aspects, three-dimensionally-printed models provide better understanding (p = 0.015). Participants in both groups exhibited similar previous student educational achievements and visuospatial skills.
CONCLUSIONS: This prospective, randomized, controlled educational trial demonstrated that incorporation of three-dimensionally-printed models improves medical students' understanding. This trial reinforces previous studies highlighting academic benefits in using three-dimensionally-printed models mostly in the field of understanding complex structures.},
	language = {eng},
	number = {3},
	journal = {Plastic and Reconstructive Surgery},
	author = {Nicot, Romain and Druelle, Charles and Chazard, Emmanuel and Roland-Billecart, Thomas and Nuytten, Alexandra and Richard, Florence and Dupré, Aurélie and Raoul, Gwénaël and Ferri, Joël and Lacroix, Dominique and Gosset, Didier and Schlund, Matthias and Truffert, Patrick},
	month = mar,
	year = {2022},
	pmid = {35196687},
	pages = {475e--484e},
}

BACKGROUND: Teaching about craniofacial traumas is challenging given the complexity of the craniofacial anatomy and the necessity for good spatial representation skills. To solve these problems, three-dimensional printing seems to be an appropriate educative material. In this study, the authors conducted a randomized controlled trial. The authors' main objective was to compare the performance of the undergraduate medical students in an examination based on the teaching support: three-dimensionally printed models versus two-dimensional pictures. METHODS: All participants were randomly assigned to one of two groups using a random number table: the three-dimensionally-printed support group (three-dimensional group) or the two-dimensionally-displayed support group (two-dimensional group). All participants completed a multiple-choice question evaluation questionnaire on facial traumatology (first, a zygomatic bone fracture; then, a double mandible fracture). Sex and potential confounding factors were evaluated. RESULTS: Four hundred thirty-two fifth-year undergraduate medical students were enrolled in this study. Two hundred six students were allocated to the three-dimensional group, and 226 were allocated to the two-dimensional group. The three-dimensionally printed model was considered to be a better teaching material compared with two-dimensional support. The global mean score was 2.36 in the three-dimensional group versus 1.99 in the two-dimensional group (p = 0.008). Regarding teaching of biomechanical aspects, three-dimensionally-printed models provide better understanding (p = 0.015). Participants in both groups exhibited similar previous student educational achievements and visuospatial skills. CONCLUSIONS: This prospective, randomized, controlled educational trial demonstrated that incorporation of three-dimensionally-printed models improves medical students' understanding. This trial reinforces previous studies highlighting academic benefits in using three-dimensionally-printed models mostly in the field of understanding complex structures.

@article{lukas_knee_2022,
	title = {Knee {Ligament} {Sprains}: {Diagnosing} {Anterior} {Cruciate} {Ligament} {Injuries} by {Patient} {Interview}. {Development} and {Evaluation} of the {Anterior} {Cruciate} {Ligament} {Injury} {Score} ({ACLIS})},
	issn = {1877-0568},
	shorttitle = {Knee {Ligament} {Sprains}},
	doi = {10.1016/j.otsr.2022.103257},
	abstract = {BACKGROUND: Knee ligament sprains are a common reason for emergency-room visits. Initially, the often difficult physical examination provides limited information, creating a risk of missing cruciate-ligament injuries, which can result in substantial functional impairments. No simple tool is available to emergency and primary-care physicians for decisions regarding specialist referral of patients with knee ligament sprains. An easy to use clinical score for the emergency setting would help identify patients at high risk of anterior cruciate ligament (ACL) tears after knee ligament sprains. The primary objective of this study, in two separate cohorts with acute knee injuries, was to develop, then validate a score for assessing the probability of ACL tear and, therefore, the need for specialist referral.
HYPOTHESIS: A score based on patient-interview information with a cut-off associated to good sensitivity and positive predictive value (PPV) for ACL tears can be developed.
MATERIAL AND METHODS: A literature review identified seven items to be used in the score: pivoting and contact activity at the time of injury, perceived cracking sound, sensation of dislocation, joint effusion, suggestive mechanism, inability to resume the activity, and immediate sensation of instability upon walking. To select the most relevant items, we recruited a development cohort of 228 patients (127 males and 101 females) with a mean age of 32±9 years who were seen for knee injuries between November 2017 and November 2018 at three healthcare institutions; 183 (80\%) had ACL tears. The score was then tested in a validation cohort of 121 patients (79 males and 42 females) with a mean age of 28±2.5 years seen at two healthcare institutions between November 2019 and November 2020; 81 (67\%) had ACL tears. In all patients, the diagnosis of ACL tear was confirmed by a specialist examination and magnetic resonance imaging.
RESULTS: Four items proved both sensitive and specific for ACL injury and were combined into the score: an immediate sensation of knee instability, an inability to resume the sports activity, a sensation of dislocation, and injury during a pivoting-contact activity. Patient report of two or more of these four criteria had 96\% sensitivity and 66\% specificity for ACL tear, with a PPV of 91\% and an NPV of 83\%. Results were similar in the validation cohort, confirming that a cut-off of at least two of the four items strongly suggested an ACL tear, with 94\% sensitivity, 56\% specificity, a PPV of 82\% and an NPV of 82\%.
CONCLUSION: The ACLIS score performs well for the emergency-room diagnosis of ACL tear, with 95\% sensitivity, 62\% specificity, an 88\% PPV, and an 82\% NPV. Patients with ACLIS scores of 2 or more probably require specialist referral with or without magnetic resonance imaging. The ACLIS score could be used routinely in emergency departments to decrease the proportion of patients with undiagnosed ACL tears.
LEVEL OF EVIDENCE: III, prospective case-control study of a diagnostic score.},
	language = {eng},
	journal = {Orthopaedics \& traumatology, surgery \& research: OTSR},
	author = {Lukas, Simon and Putman, Sophie and Delay, Cyril and Blairon, Alexandre and Chazard, Emmanuel and Letartre, Romain},
	month = feb,
	year = {2022},
	pmid = {35219887},
	keywords = {Anterior cruciate ligament, Knee, Score, Sprain},
	pages = {103257},
}

BACKGROUND: Knee ligament sprains are a common reason for emergency-room visits. Initially, the often difficult physical examination provides limited information, creating a risk of missing cruciate-ligament injuries, which can result in substantial functional impairments. No simple tool is available to emergency and primary-care physicians for decisions regarding specialist referral of patients with knee ligament sprains. An easy to use clinical score for the emergency setting would help identify patients at high risk of anterior cruciate ligament (ACL) tears after knee ligament sprains. The primary objective of this study, in two separate cohorts with acute knee injuries, was to develop, then validate a score for assessing the probability of ACL tear and, therefore, the need for specialist referral. HYPOTHESIS: A score based on patient-interview information with a cut-off associated to good sensitivity and positive predictive value (PPV) for ACL tears can be developed. MATERIAL AND METHODS: A literature review identified seven items to be used in the score: pivoting and contact activity at the time of injury, perceived cracking sound, sensation of dislocation, joint effusion, suggestive mechanism, inability to resume the activity, and immediate sensation of instability upon walking. To select the most relevant items, we recruited a development cohort of 228 patients (127 males and 101 females) with a mean age of 32±9 years who were seen for knee injuries between November 2017 and November 2018 at three healthcare institutions; 183 (80%) had ACL tears. The score was then tested in a validation cohort of 121 patients (79 males and 42 females) with a mean age of 28±2.5 years seen at two healthcare institutions between November 2019 and November 2020; 81 (67%) had ACL tears. In all patients, the diagnosis of ACL tear was confirmed by a specialist examination and magnetic resonance imaging. RESULTS: Four items proved both sensitive and specific for ACL injury and were combined into the score: an immediate sensation of knee instability, an inability to resume the sports activity, a sensation of dislocation, and injury during a pivoting-contact activity. Patient report of two or more of these four criteria had 96% sensitivity and 66% specificity for ACL tear, with a PPV of 91% and an NPV of 83%. Results were similar in the validation cohort, confirming that a cut-off of at least two of the four items strongly suggested an ACL tear, with 94% sensitivity, 56% specificity, a PPV of 82% and an NPV of 82%. CONCLUSION: The ACLIS score performs well for the emergency-room diagnosis of ACL tear, with 95% sensitivity, 62% specificity, an 88% PPV, and an 82% NPV. Patients with ACLIS scores of 2 or more probably require specialist referral with or without magnetic resonance imaging. The ACLIS score could be used routinely in emergency departments to decrease the proportion of patients with undiagnosed ACL tears. LEVEL OF EVIDENCE: III, prospective case-control study of a diagnostic score.

@book{rouet_algorithmes_2022,
	address = {Paris},
	title = {Algorithmes et décisions publiques},
	isbn = {978-2-271-14166-8},
	url = {https://books.openedition.org/editionscnrs/46122},
	abstract = {Les algorithmes, nourris par des masses de données de plus en plus importantes, sont désormais au cœur de nombreux dispositifs susceptibles d'orienter, voire de prendre des décisions publiques. Le recours aux algorithmes permet d'envisager de réels progrès dans la qualité et l'adaptation des services publics aux besoins des citoyens/usagers, par ailleurs eux-mêmes producteurs de données nécessaires à leur fonctionnement. Tous les secteurs, ou presque, sont déjà concernés : santé, justice, police, sécurité, éducation, etc. Mais à quel prix et avec quels risques ?  Ce volume propose un panorama critique du recours aux algorithmes dans le secteur public, avec des focalisations sur des applications concrètes et une réflexion sur l'évolution de l'État, des administrations et de la communication entre les citoyens et les décideurs publics.  La loi pour une République numérique a instauré en 2016 un droit d'information spécifique pour les citoyens concernés par une décision individuelle fondée sur un algorithme. Il convient aujourd'hui non seulement d'envisager les modalités de mise en application de ce droit, mais aussi d'en considérer les aspects collectifs. Comment, dans ce contexte, maintenir et développer les conditions de liberté de choix et d'action des citoyens ?},
	language = {français},
	urldate = {2022-03-10},
	publisher = {CNRS Éditions},
	author = {Rouet, Gilles and Barraud, Boris and Benbouzid, Bilel and Carmès, Maryse and Carnis, Laurent and Chazard, Emmanuel and Côme, Thierry and Deydier, Jean and Mabi, Clément and Magne, Stéphane and Rouet, Gilles},
	year = {2022},
}

Les algorithmes, nourris par des masses de données de plus en plus importantes, sont désormais au cœur de nombreux dispositifs susceptibles d'orienter, voire de prendre des décisions publiques. Le recours aux algorithmes permet d'envisager de réels progrès dans la qualité et l'adaptation des services publics aux besoins des citoyens/usagers, par ailleurs eux-mêmes producteurs de données nécessaires à leur fonctionnement. Tous les secteurs, ou presque, sont déjà concernés : santé, justice, police, sécurité, éducation, etc. Mais à quel prix et avec quels risques ? Ce volume propose un panorama critique du recours aux algorithmes dans le secteur public, avec des focalisations sur des applications concrètes et une réflexion sur l'évolution de l'État, des administrations et de la communication entre les citoyens et les décideurs publics. La loi pour une République numérique a instauré en 2016 un droit d'information spécifique pour les citoyens concernés par une décision individuelle fondée sur un algorithme. Il convient aujourd'hui non seulement d'envisager les modalités de mise en application de ce droit, mais aussi d'en considérer les aspects collectifs. Comment, dans ce contexte, maintenir et développer les conditions de liberté de choix et d'action des citoyens ?

@article{bannay_leveraging_2021,
	title = {Leveraging {National} {Claims} and {Hospital} {Big} {Data}: {Cohort} {Study} on a {Statin}-{Drug} {Interaction} {Use} {Case}},
	volume = {9},
	issn = {2291-9694},
	shorttitle = {Leveraging {National} {Claims} and {Hospital} {Big} {Data}},
	doi = {10.2196/29286},
	abstract = {BACKGROUND: Linking different sources of medical data is a promising approach to analyze care trajectories. The aim of the INSHARE (Integrating and Sharing Health Big Data for Research) project was to provide the blueprint for a technological platform that facilitates integration, sharing, and reuse of data from 2 sources: the clinical data warehouse (CDW) of the Rennes academic hospital, called eHOP (entrepôt Hôpital), and a data set extracted from the French national claim data warehouse (Système National des Données de Santé [SNDS]).
OBJECTIVE: This study aims to demonstrate how the INSHARE platform can support big data analytic tasks in the health field using a pharmacovigilance use case based on statin consumption and statin-drug interactions.
METHODS: A Spark distributed cluster-computing framework was used for the record linkage procedure and all analyses. A semideterministic record linkage method based on the common variables between the chosen data sources was developed to identify all patients discharged after at least one hospital stay at the Rennes academic hospital between 2015 and 2017. The use-case study focused on a cohort of patients treated with statins prescribed by their general practitioner or during their hospital stay.
RESULTS: The whole process (record linkage procedure and use-case analyses) required 88 minutes. Of the 161,532 and 164,316 patients from the SNDS and eHOP CDW data sets, respectively, 159,495 patients were successfully linked (98.74\% and 97.07\% of patients from SNDS and eHOP CDW, respectively). Of the 16,806 patients with at least one statin delivery, 8293 patients started the consumption before and continued during the hospital stay, 6382 patients stopped statin consumption at hospital admission, and 2131 patients initiated statins in hospital. Statin-drug interactions occurred more frequently during hospitalization than in the community (3800/10,424, 36.45\% and 3253/14,675, 22.17\%, respectively; P{\textless}.001). Only 121 patients had the most severe level of statin-drug interaction. Hospital stay burden (length of stay and in-hospital mortality) was more severe in patients with statin-drug interactions during hospitalization.
CONCLUSIONS: This study demonstrates the added value of combining and reusing clinical and claim data to provide large-scale measures of drug-drug interaction prevalence and care pathways outside hospitals. It builds a path to move the current health care system toward a Learning Health System using knowledge generated from research on real-world health data.},
	language = {eng},
	number = {12},
	journal = {JMIR medical informatics},
	author = {Bannay, Aurélie and Bories, Mathilde and Le Corre, Pascal and Riou, Christine and Lemordant, Pierre and Van Hille, Pascal and Chazard, Emmanuel and Dode, Xavier and Cuggia, Marc and Bouzillé, Guillaume},
	month = dec,
	year = {2021},
	pmid = {34898457},
	keywords = {administrative claims, big data, data linking, data warehousing, drug interactions, health care, statins},
	pages = {e29286},
}

BACKGROUND: Linking different sources of medical data is a promising approach to analyze care trajectories. The aim of the INSHARE (Integrating and Sharing Health Big Data for Research) project was to provide the blueprint for a technological platform that facilitates integration, sharing, and reuse of data from 2 sources: the clinical data warehouse (CDW) of the Rennes academic hospital, called eHOP (entrepôt Hôpital), and a data set extracted from the French national claim data warehouse (Système National des Données de Santé [SNDS]). OBJECTIVE: This study aims to demonstrate how the INSHARE platform can support big data analytic tasks in the health field using a pharmacovigilance use case based on statin consumption and statin-drug interactions. METHODS: A Spark distributed cluster-computing framework was used for the record linkage procedure and all analyses. A semideterministic record linkage method based on the common variables between the chosen data sources was developed to identify all patients discharged after at least one hospital stay at the Rennes academic hospital between 2015 and 2017. The use-case study focused on a cohort of patients treated with statins prescribed by their general practitioner or during their hospital stay. RESULTS: The whole process (record linkage procedure and use-case analyses) required 88 minutes. Of the 161,532 and 164,316 patients from the SNDS and eHOP CDW data sets, respectively, 159,495 patients were successfully linked (98.74% and 97.07% of patients from SNDS and eHOP CDW, respectively). Of the 16,806 patients with at least one statin delivery, 8293 patients started the consumption before and continued during the hospital stay, 6382 patients stopped statin consumption at hospital admission, and 2131 patients initiated statins in hospital. Statin-drug interactions occurred more frequently during hospitalization than in the community (3800/10,424, 36.45% and 3253/14,675, 22.17%, respectively; P\textless.001). Only 121 patients had the most severe level of statin-drug interaction. Hospital stay burden (length of stay and in-hospital mortality) was more severe in patients with statin-drug interactions during hospitalization. CONCLUSIONS: This study demonstrates the added value of combining and reusing clinical and claim data to provide large-scale measures of drug-drug interaction prevalence and care pathways outside hospitals. It builds a path to move the current health care system toward a Learning Health System using knowledge generated from research on real-world health data.

@article{tillard_burden_2021,
	title = {Burden of influenza disease in children under 2 years of age hospitalized between 2011 and 2020 in {France}},
	volume = {0},
	issn = {0163-4453, 1532-2742},
	url = {https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(21)00549-1/fulltext},
	doi = {10.1016/j.jinf.2021.11.006},
	language = {English},
	number = {0},
	urldate = {2021-11-15},
	journal = {Journal of Infection},
	author = {Tillard, Célia and Chazard, Emmanuel and Faure, Karine and Bartolo, Stéphanie and Martinot, Alain and Dubos, François},
	month = nov,
	year = {2021},
	note = {Publisher: Elsevier},
	keywords = {Burden of disease, children, influenza, morbidity, mortality},
}

@article{baert_coronavirus_2021,
	title = {Coronavirus {Disease} 2019 and {Out}-of-{Hospital} {Cardiac} {Arrest}: {No} {Survivors}},
	issn = {1530-0293},
	shorttitle = {Coronavirus {Disease} 2019 and {Out}-of-{Hospital} {Cardiac} {Arrest}},
	doi = {10.1097/CCM.0000000000005374},
	abstract = {OBJECTIVES: To describe and compare survival among patients with out-of-hospital cardiac arrest as a function of their status for coronavirus disease 2019.
DESIGN: We performed an observational study of out-of-hospital cardiac arrest patients between March 2020 and December 2020. Coronavirus disease 2019 status (confirmed, suspected, or negative) was defined according to the World Health Organization's criteria.
SETTING: Information on the patients and their care was extracted from the French national out-of-hospital cardiac arrest registry. The French prehospital emergency medical system has two tiers: the fire department intervenes rapidly to provide basic life support, and mobile ICUs provide advanced life support. The study data (including each patient's coronavirus disease 2019 status) were collected by 95 mobile ICUs throughout France.
PATIENTS: We included 6,624 out-of-hospital cardiac arrest patients: 127 cases with confirmed coronavirus disease 2019, 473 with suspected coronavirus disease 2019, and 6,024 negative for coronavirus disease 2019.
INTERVENTIONS: None.
MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: The "confirmed" and "suspected" groups of coronavirus disease 2019 patients had similar characteristics and were more likely to have suffered an out-of-hospital cardiac arrest with a respiratory cause (confirmed: 53.7\%, suspected coronavirus disease 2019: 56.5\%; p = 0.472) than noncoronavirus disease 2019 patients (14.0\%; p {\textless} 0.001 vs confirmed coronavirus disease 2019 patients). Advanced life support was initiated for 57.5\% of the confirmed coronavirus disease 2019 patients, compared with 64.5\% of the suspected coronavirus disease 2019 patients (p = 0.149) and 70.6\% of the noncoronavirus disease 2019 ones (p = 0.002). The survival rate at 30-day postout-of-hospital cardiac arrest was 0\% in the confirmed coronavirus disease 2019 group, 0.9\% in the suspected coronavirus disease 2019 group (p = 0.583 vs confirmed), and 3.5\% (p = 0.023) in the noncoronavirus disease 2019 group.
CONCLUSIONS: Our results highlighted a zero survival rate in out-of-hospital cardiac arrest patients with confirmed coronavirus disease 2019. This finding raises important questions with regard to the futility of resuscitation for coronavirus disease 2019 patients and the management of the associated risks.},
	language = {eng},
	journal = {Critical Care Medicine},
	author = {Baert, Valentine and Beuscart, Jean-Baptiste and Recher, Morgan and Javaudin, François and Hugenschmitt, Delphine and Bony, Thomas and Revaux, François and Mansouri, Nadia and Larcher, Fanny and Chazard, Emmanuel and Hubert, Hervé and {French National OHCA Registry (RéAC) Study Group}},
	month = oct,
	year = {2021},
	pmid = {34605777},
}

OBJECTIVES: To describe and compare survival among patients with out-of-hospital cardiac arrest as a function of their status for coronavirus disease 2019. DESIGN: We performed an observational study of out-of-hospital cardiac arrest patients between March 2020 and December 2020. Coronavirus disease 2019 status (confirmed, suspected, or negative) was defined according to the World Health Organization's criteria. SETTING: Information on the patients and their care was extracted from the French national out-of-hospital cardiac arrest registry. The French prehospital emergency medical system has two tiers: the fire department intervenes rapidly to provide basic life support, and mobile ICUs provide advanced life support. The study data (including each patient's coronavirus disease 2019 status) were collected by 95 mobile ICUs throughout France. PATIENTS: We included 6,624 out-of-hospital cardiac arrest patients: 127 cases with confirmed coronavirus disease 2019, 473 with suspected coronavirus disease 2019, and 6,024 negative for coronavirus disease 2019. INTERVENTIONS: None. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: The "confirmed" and "suspected" groups of coronavirus disease 2019 patients had similar characteristics and were more likely to have suffered an out-of-hospital cardiac arrest with a respiratory cause (confirmed: 53.7%, suspected coronavirus disease 2019: 56.5%; p = 0.472) than noncoronavirus disease 2019 patients (14.0%; p \textless 0.001 vs confirmed coronavirus disease 2019 patients). Advanced life support was initiated for 57.5% of the confirmed coronavirus disease 2019 patients, compared with 64.5% of the suspected coronavirus disease 2019 patients (p = 0.149) and 70.6% of the noncoronavirus disease 2019 ones (p = 0.002). The survival rate at 30-day postout-of-hospital cardiac arrest was 0% in the confirmed coronavirus disease 2019 group, 0.9% in the suspected coronavirus disease 2019 group (p = 0.583 vs confirmed), and 3.5% (p = 0.023) in the noncoronavirus disease 2019 group. CONCLUSIONS: Our results highlighted a zero survival rate in out-of-hospital cardiac arrest patients with confirmed coronavirus disease 2019. This finding raises important questions with regard to the futility of resuscitation for coronavirus disease 2019 patients and the management of the associated risks.

@article{bertrand_1829p_2021,
	series = {Abstract {Book} of the {ESMO} {Congress} 2021, 16 – 21 {September} 2021},
	title = {{1829P} {In}-hospital survival of metastatic patients admitted into medical intensive care units: {A} {French} nationwide study about 57,717 cases},
	volume = {32},
	issn = {0923-7534},
	shorttitle = {{1829P} {In}-hospital survival of metastatic patients admitted into medical intensive care units},
	url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S092375342102946X},
	doi = {10.1016/j.annonc.2021.08.717},
	language = {en},
	urldate = {2022-05-02},
	journal = {Annals of Oncology},
	author = {Bertrand, N. and Benoit, D. and Escande, A. and Ficheur, G. and Nseir, S. and Moreau, A. S. and Chazard, E.},
	month = sep,
	year = {2021},
	pages = {S1238},
}

@article{demesmaeker_suicide_2021,
	title = {Suicide mortality after a nonfatal suicide attempt: {A} systematic review and meta-analysis},
	issn = {1440-1614},
	shorttitle = {Suicide mortality after a nonfatal suicide attempt},
	doi = {10.1177/00048674211043455},
	abstract = {INTRODUCTION: Deliberate self-harm and suicide attempts share common risk factors but are associated with different epidemiological features. While the rate of suicide after deliberate self-harm has been evaluated in meta-analyses, the specific rate of death by suicide after a previous suicide attempt has never been assessed. The aim of our study was to estimate the incidence of death by suicide after a nonfatal suicide attempt.
METHOD: We developed and followed a standard meta-analysis protocol (systematic review registration-PROSPERO 2021: CRD42021221111). Randomized controlled trials and cohort studies published between 1970 and 2020 focusing on the rate of suicide after suicide attempt were identified in PubMed, PsycInfo and Scopus and qualitatively described. The rates of deaths by suicide at 1, 5 and 10 years after a nonfatal suicide attempt were pooled in a meta-analysis using a random-effects model. Subgroup analysis and meta-regressions were also performed.
RESULTS: Our meta-analysis is based on 41 studies. The suicide rate after a nonfatal suicide attempt was 2.8\% (2.2-3.5) at 1 year, 5.6\% (3.9-7.9) at 5 years and 7.4\% (5.2-10.4) at 10 years. Estimates of the suicide rate vary widely depending on the psychiatric diagnosis, the method used for the suicide attempt, the type of study and the age group considered.
CONCLUSION: The evidence of a high rate of suicide deaths in the year following nonfatal suicide attempts should prompt prevention systems to be particularly vigilant during this period.},
	language = {eng},
	journal = {The Australian and New Zealand Journal of Psychiatry},
	author = {Demesmaeker, Alice and Chazard, Emmanuel and Hoang, Aline and Vaiva, Guillaume and Amad, Ali},
	month = sep,
	year = {2021},
	pmid = {34465221},
	keywords = {Suicide attempt, epidemiology, mortality, suicide},
	pages = {48674211043455},
}

INTRODUCTION: Deliberate self-harm and suicide attempts share common risk factors but are associated with different epidemiological features. While the rate of suicide after deliberate self-harm has been evaluated in meta-analyses, the specific rate of death by suicide after a previous suicide attempt has never been assessed. The aim of our study was to estimate the incidence of death by suicide after a nonfatal suicide attempt. METHOD: We developed and followed a standard meta-analysis protocol (systematic review registration-PROSPERO 2021: CRD42021221111). Randomized controlled trials and cohort studies published between 1970 and 2020 focusing on the rate of suicide after suicide attempt were identified in PubMed, PsycInfo and Scopus and qualitatively described. The rates of deaths by suicide at 1, 5 and 10 years after a nonfatal suicide attempt were pooled in a meta-analysis using a random-effects model. Subgroup analysis and meta-regressions were also performed. RESULTS: Our meta-analysis is based on 41 studies. The suicide rate after a nonfatal suicide attempt was 2.8% (2.2-3.5) at 1 year, 5.6% (3.9-7.9) at 5 years and 7.4% (5.2-10.4) at 10 years. Estimates of the suicide rate vary widely depending on the psychiatric diagnosis, the method used for the suicide attempt, the type of study and the age group considered. CONCLUSION: The evidence of a high rate of suicide deaths in the year following nonfatal suicide attempts should prompt prevention systems to be particularly vigilant during this period.

@article{dubernard_retrograde_2021,
	title = {Retrograde {Extraperitoneal} {Laparoscopic} {Prostatectomy} ({RELP}). {A} {Prospective} {Study} about 1,000 {Consecutive} {Patients}, with {Oncological} and {Functional} {Results}},
	issn = {1735-546X},
	doi = {10.22037/uj.v18i.6233},
	abstract = {PURPOSE: Usual laparoscopic surgery of localized prostate cancer uses antegrade dissection. We describe and evaluate the original RELP (Retrograde Extraperitoneal Laparoscopic Prostatectomy).
MATERIALS AND METHODS: A prospective cohort of 1005 patients with clinical localized cancer prostate were operated from December 1999 to September 2013, in Lyon (France), and followed up to 172 months (median: 60 months). Patients encountered a RELP procedure, a totally extra-peritoneal approach with a retrograde dissection from the apex to the bladder neck, and ascending dissection of the erectile neurovascular bundles, facilitated by the 30° optic telescope. Adjunctive treatments were: immediate radiotherapy (9.2\%), salvage radiotherapy (13.4\%), androgen deprivation therapy (10.8\%), chemotherapy (1.4\%), no treatment (75.8\%). Results The mean age was 63.4, the Gleason score was 4+3 or worse in 24.9\%, there were 2.3\% unifocal tumors. The pathology stages were pT2A (8.71\%), pT2B (2.80\%), pT2C (69.0\%), pT3A (13.1\%), and pT3B (6.41\%). There were 60.8\% negative margins (R0) in total (90.1\% for basal locations, and 75.8\% for apical locations). The mean operating time was 115 minutes for the last 100 patients. The BPFSR (biological progression free survival rate, PSA≤0.10 ng/ml) was 71.9\% at 5 years, and 61.4\% at 10 years. The cancer specific survival rate was 99.4\% at 5 years, and 98.3\% at 10 years. After 12 months, 88.6\% of patients did not require an incontinence pad, and 67.0\% retained the pre-operative quality of their erection.
CONCLUSION: RELP yields good oncologic results and quality of life, as good as robot-assisted surgery.},
	language = {eng},
	journal = {Urology Journal},
	author = {Dubernard, Pierre and Chaffange, Pierre and Pacheco, Philippe and Pricaz, Elie and Vaziri, Nader and Vinet, Maxime and Chalabreysse, Philippe and Rochat, Charles-Henry and Ficheur, Grégoire and Chazard, Emmanuel},
	month = jul,
	year = {2021},
	pmid = {34308534},
	keywords = {Functional Results, Laparoscopy, Oncological Results, Prostatectomy, Prostatic Neoplasms, Retrograde Extraperitoneal Laparoscopic Prostatectomy},
}

PURPOSE: Usual laparoscopic surgery of localized prostate cancer uses antegrade dissection. We describe and evaluate the original RELP (Retrograde Extraperitoneal Laparoscopic Prostatectomy). MATERIALS AND METHODS: A prospective cohort of 1005 patients with clinical localized cancer prostate were operated from December 1999 to September 2013, in Lyon (France), and followed up to 172 months (median: 60 months). Patients encountered a RELP procedure, a totally extra-peritoneal approach with a retrograde dissection from the apex to the bladder neck, and ascending dissection of the erectile neurovascular bundles, facilitated by the 30° optic telescope. Adjunctive treatments were: immediate radiotherapy (9.2%), salvage radiotherapy (13.4%), androgen deprivation therapy (10.8%), chemotherapy (1.4%), no treatment (75.8%). Results The mean age was 63.4, the Gleason score was 4+3 or worse in 24.9%, there were 2.3% unifocal tumors. The pathology stages were pT2A (8.71%), pT2B (2.80%), pT2C (69.0%), pT3A (13.1%), and pT3B (6.41%). There were 60.8% negative margins (R0) in total (90.1% for basal locations, and 75.8% for apical locations). The mean operating time was 115 minutes for the last 100 patients. The BPFSR (biological progression free survival rate, PSA≤0.10 ng/ml) was 71.9% at 5 years, and 61.4% at 10 years. The cancer specific survival rate was 99.4% at 5 years, and 98.3% at 10 years. After 12 months, 88.6% of patients did not require an incontinence pad, and 67.0% retained the pre-operative quality of their erection. CONCLUSION: RELP yields good oncologic results and quality of life, as good as robot-assisted surgery.

@article{duthe_how_2021,
	title = {How to {Identify} {Potential} {Candidates} for {HIV} {Pre}-{Exposure} {Prophylaxis}: {An} {AI} {Algorithm} {Reusing} {Real}-{World} {Hospital} {Data}},
	volume = {281},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {How to {Identify} {Potential} {Candidates} for {HIV} {Pre}-{Exposure} {Prophylaxis}},
	doi = {10.3233/SHTI210265},
	abstract = {HIV Pre-Exposure Prophylaxis (PrEP) is effective in Men who have Sex with Men (MSM), and is reimbursed by the social security in France. Yet, PrEP is underused due to the difficulty to identify people at risk of HIV infection outside the "sexual health" care path. We developed and validated an automated algorithm that re-uses Electronic Health Record (EHR) data available in eHOP, the Clinical Data Warehouse of Rennes University Hospital (France). Using machine learning methods, we developed five models to predict incident HIV infections with 162 variables that might be exploited to predict HIV risk using EHR data. We divided patients aged 18 or more having at least one hospital admission between 2013 and 2019 in two groups: cases (patients with known HIV infection in the study period) and controls (patients without known HIV infection and no PrEP in the study period, but with at least one HIV risk factor). Among the 624,708 admissions, we selected 156 cases (incident HIV infection) and 761 controls. The best performing model for identifying incident HIV infections was the combined model (LASSO, Random Forest, and Generalized Linear Model): AUC = 0.88 (95\% CI: 0.8143-0.9619), specificity = 0.887, and sensitivity = 0.733 using the test dataset. The algorithm seems to efficiently identify patients at risk of HIV infection.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Duthe, Jean-Charles and Bouzille, Guillaume and Sylvestre, Emmanuelle and Chazard, Emmanuel and Arvieux, Cedric and Cuggia, Marc},
	month = may,
	year = {2021},
	pmid = {34042669},
	keywords = {Algorithms, Anti-HIV Agents, France, HIV Infections, HIV prevention, Homosexuality, Male, Hospitals, Humans, Male, Pre-Exposure Prophylaxis, Pre-exposure prophylaxis (PrEP), Sexual and Gender Minorities, clinical informatics, machine learning, predictive analytics, risk reduction practices, sexual health},
	pages = {714--718},
}

HIV Pre-Exposure Prophylaxis (PrEP) is effective in Men who have Sex with Men (MSM), and is reimbursed by the social security in France. Yet, PrEP is underused due to the difficulty to identify people at risk of HIV infection outside the "sexual health" care path. We developed and validated an automated algorithm that re-uses Electronic Health Record (EHR) data available in eHOP, the Clinical Data Warehouse of Rennes University Hospital (France). Using machine learning methods, we developed five models to predict incident HIV infections with 162 variables that might be exploited to predict HIV risk using EHR data. We divided patients aged 18 or more having at least one hospital admission between 2013 and 2019 in two groups: cases (patients with known HIV infection in the study period) and controls (patients without known HIV infection and no PrEP in the study period, but with at least one HIV risk factor). Among the 624,708 admissions, we selected 156 cases (incident HIV infection) and 761 controls. The best performing model for identifying incident HIV infections was the combined model (LASSO, Random Forest, and Generalized Linear Model): AUC = 0.88 (95% CI: 0.8143-0.9619), specificity = 0.887, and sensitivity = 0.733 using the test dataset. The algorithm seems to efficiently identify patients at risk of HIV infection.

@article{lauriot_dit_prevost_icipemir_2021,
	title = {{ICIPEMIR}: {Improving} the {Completeness}, {Interoperability} and {Patient} {Explanations} of {Medical} {Imaging} {Reports}},
	volume = {281},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {{ICIPEMIR}},
	doi = {10.3233/SHTI210193},
	abstract = {INTRODUCTION: Although electronic health records have been facilitating the management of medical information, there is still room for improvement in daily production of medical report. Possible areas for improvement would be: to improve reports quality (by increasing exhaustivity), to improve patients' understanding (by mean of a graphical display), to save physicians' time (by helping reports writing), and to improve sharing and storage (by enhancing interoperability). We set up the ICIPEMIR project (Improving the completeness, interoperability and patients explanation of medical imaging reports) as an academic solution to optimize medical imaging reports production. Such a project requires two layers: one engineering layer to build the automation process, and a second medical layer to determine domain-specific data models for each type of report. We describe here the medical layer of this project.
METHODS: We designed a reproducible methodology to identify -for a given medical imaging exam- mandatory fields, and describe a corresponding simple data model using validated formats. The mandatory fields had to meet legal requirements, domain-specific guidelines, and results of a bibliographic review on clinical studies. An UML representation, a JSON Schema, and a YAML instance dataset were defined. Based on this data model a form was created using Goupile, an open source eCRF script-based editor. In addition, a graphical display was designed and mapped with the data model, as well as a text template to automatically produce a free-text report. Finally, the YAML instance was encoded in a QR-Code to allow offline paper-based transmission of structured data.
RESULTS: We tested this methodology in a specific domain: computed tomography for urolithiasis. We successfully extracted 73 fields, and transformed them into a simple data model, with mapping to a simple graphical display, and textual report template. The offline QR-code transmission of a 2,615 characters YAML file was successful with simple smartphone QR-Code scanner.
CONCLUSION: Although automated production of medical report requires domain-specific data model and mapping, these can be defined using a reproducible methodology. Hopefully this proof of concept will lead to a computer solution to optimize medical imaging reports, driven by academic research.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Lauriot Dit Prevost, Arthur and Trencart, Marie and Gaillard, Vianney and Bouzille, Guillaume and Besson, Rémi and Sharma, Dyuti and Puech, Philippe and Chazard, Emmanuel},
	month = may,
	year = {2021},
	pmid = {34042778},
	keywords = {Data model, Diagnostic Imaging, Electronic Health Records, Humans, QR-Code, medical imaging report, patient participation},
	pages = {422--426},
}

INTRODUCTION: Although electronic health records have been facilitating the management of medical information, there is still room for improvement in daily production of medical report. Possible areas for improvement would be: to improve reports quality (by increasing exhaustivity), to improve patients' understanding (by mean of a graphical display), to save physicians' time (by helping reports writing), and to improve sharing and storage (by enhancing interoperability). We set up the ICIPEMIR project (Improving the completeness, interoperability and patients explanation of medical imaging reports) as an academic solution to optimize medical imaging reports production. Such a project requires two layers: one engineering layer to build the automation process, and a second medical layer to determine domain-specific data models for each type of report. We describe here the medical layer of this project. METHODS: We designed a reproducible methodology to identify -for a given medical imaging exam- mandatory fields, and describe a corresponding simple data model using validated formats. The mandatory fields had to meet legal requirements, domain-specific guidelines, and results of a bibliographic review on clinical studies. An UML representation, a JSON Schema, and a YAML instance dataset were defined. Based on this data model a form was created using Goupile, an open source eCRF script-based editor. In addition, a graphical display was designed and mapped with the data model, as well as a text template to automatically produce a free-text report. Finally, the YAML instance was encoded in a QR-Code to allow offline paper-based transmission of structured data. RESULTS: We tested this methodology in a specific domain: computed tomography for urolithiasis. We successfully extracted 73 fields, and transformed them into a simple data model, with mapping to a simple graphical display, and textual report template. The offline QR-code transmission of a 2,615 characters YAML file was successful with simple smartphone QR-Code scanner. CONCLUSION: Although automated production of medical report requires domain-specific data model and mapping, these can be defined using a reproducible methodology. Hopefully this proof of concept will lead to a computer solution to optimize medical imaging reports, driven by academic research.

@article{robert_integration_2021,
	title = {Integration of {Explicit} {Criteria} in a {Clinical} {Decision} {Support} {System} {Through} {Evaluation} of {Acute} {Kidney} {Injury} {Events}},
	volume = {281},
	issn = {1879-8365},
	doi = {10.3233/SHTI210249},
	abstract = {In Clinical Decision Support System (CDSS), relevance of alerts is essential to limit alert fatigue and risk of overriding relevant alerts by health professionals. Detection of acute kidney injury (AKI) situations is of great importance in clinical practice and could improve quality of care. Nevertheless, to our knowledge, no explicit rule has been created to detect AKI situations in CDSS. The objective of the study was to implement an AKI detection rule based on KDIGO criteria in a CDSS and to optimize this rule to increase its relevance in clinical pharmacy use. Two explicit rules were implemented in a CDSS (basic AKI rule and improved AKI rule), based on KDIGO criteria. Only the improved rule was optimized by a group of experts during the two-month study period. The CDSS provided 1,125 alerts on AKI situations (i.e. 643 were triggered for the basic AKI rule and 482 for the improved AKI rule). As the study proceeds, the pharmaceutically and medically relevance of alerts from the improved AKI rule increased. A ten-fold increase was shown for the improved AKI rule compared to the basic AKI rule. The study highlights the usefulness of a multidisciplinary review to enhance explicit rules integrated in CDSS. The improved AKI is able to detect AKI situations and can improve workflow of health professionals.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Robert, Laurine and Rousseliere, Chloé and Beuscart, Jean-Baptiste and Gautier, Sophie and Chazard, Emmanuel and Decaudin, Bertrand and Odou, Pascal},
	month = may,
	year = {2021},
	pmid = {34042654},
	keywords = {AKI, Acute Kidney Injury, CDSS, Decision Support Systems, Clinical, Detection, Explicit criteria, Humans, Pharmacy Service, Hospital},
	pages = {640--644},
}

In Clinical Decision Support System (CDSS), relevance of alerts is essential to limit alert fatigue and risk of overriding relevant alerts by health professionals. Detection of acute kidney injury (AKI) situations is of great importance in clinical practice and could improve quality of care. Nevertheless, to our knowledge, no explicit rule has been created to detect AKI situations in CDSS. The objective of the study was to implement an AKI detection rule based on KDIGO criteria in a CDSS and to optimize this rule to increase its relevance in clinical pharmacy use. Two explicit rules were implemented in a CDSS (basic AKI rule and improved AKI rule), based on KDIGO criteria. Only the improved rule was optimized by a group of experts during the two-month study period. The CDSS provided 1,125 alerts on AKI situations (i.e. 643 were triggered for the basic AKI rule and 482 for the improved AKI rule). As the study proceeds, the pharmaceutically and medically relevance of alerts from the improved AKI rule increased. A ten-fold increase was shown for the improved AKI rule compared to the basic AKI rule. The study highlights the usefulness of a multidisciplinary review to enhance explicit rules integrated in CDSS. The improved AKI is able to detect AKI situations and can improve workflow of health professionals.

@article{demesmaeker_pharmacoepidemiological_2021,
	title = {A pharmacoepidemiological study of the association of suicide reattempt risk with psychotropic drug exposure},
	volume = {138},
	issn = {1879-1379},
	doi = {10.1016/j.jpsychires.2021.04.006},
	abstract = {INTRODUCTION: Recent pharmacoepidemiological studies have suggested that consumption of certain classes of psychotropic drugs could be considered protective or risk factors for suicidal behaviour. The aim of the study was to evaluate the association between the risk of suicide reattempt within 6 and 14 months after a suicide attempt (SA) with the use of different classes of psychotropic drugs, combination pairs and treatment adequacy from inclusion through 6 and 14 months post-SA.
METHOD: A prospective observational cohort of 972 subjects from the ALGOS study from January 2010 to February 2013 was used to evaluate the association of risk of suicide reattempt within 6 and 14 months with the use of different classes of psychotropic drugs (antidepressants, anxiolytics, antipsychotics, lithium, anticonvulsants, analgesics, opioid maintenance therapy and maintenance treatment for alcohol dependence). A multivariable Cox model was performed after imputation of missing data using the multiple imputation method.
RESULTS: Our main results did not show an association between psychotropic drug use and suicide reattempt after 6 months of follow-up. We demonstrated that the use of benzodiazepines (HR = 1.87 [1.25; 2.81], p {\textless} 0.01) and hypnotics (HR = 1.49 [1.03; 2.17], p = 0.04) or a combination of both (HR = 1.80 [1.17; 2.72], p = 0.01) were associated with suicide reattempt within 14 months after a previous SA.
CONCLUSION: The early identification of a positive association between psychotropic drugs and the risk of suicidal behaviour is extremely important for prevention of suicide reattempts. Special precautions should be considered when prescribing psychotropic drugs for these subjects, particularly those at risk of suicide reattempt.},
	language = {eng},
	journal = {Journal of Psychiatric Research},
	author = {Demesmaeker, Alice and Chazard, Emmanuel and Vaiva, Guillaume and Amad, Ali},
	month = apr,
	year = {2021},
	pmid = {33872962},
	keywords = {Pharmacoepidemiology, Psychotropic drug, Suicide, Suicide attempt, pharmacoepidemiology, psychotropic drug, suicide attempt},
	pages = {256--263},
}

INTRODUCTION: Recent pharmacoepidemiological studies have suggested that consumption of certain classes of psychotropic drugs could be considered protective or risk factors for suicidal behaviour. The aim of the study was to evaluate the association between the risk of suicide reattempt within 6 and 14 months after a suicide attempt (SA) with the use of different classes of psychotropic drugs, combination pairs and treatment adequacy from inclusion through 6 and 14 months post-SA. METHOD: A prospective observational cohort of 972 subjects from the ALGOS study from January 2010 to February 2013 was used to evaluate the association of risk of suicide reattempt within 6 and 14 months with the use of different classes of psychotropic drugs (antidepressants, anxiolytics, antipsychotics, lithium, anticonvulsants, analgesics, opioid maintenance therapy and maintenance treatment for alcohol dependence). A multivariable Cox model was performed after imputation of missing data using the multiple imputation method. RESULTS: Our main results did not show an association between psychotropic drug use and suicide reattempt after 6 months of follow-up. We demonstrated that the use of benzodiazepines (HR = 1.87 [1.25; 2.81], p \textless 0.01) and hypnotics (HR = 1.49 [1.03; 2.17], p = 0.04) or a combination of both (HR = 1.80 [1.17; 2.72], p = 0.01) were associated with suicide reattempt within 14 months after a previous SA. CONCLUSION: The early identification of a positive association between psychotropic drugs and the risk of suicidal behaviour is extremely important for prevention of suicide reattempts. Special precautions should be considered when prescribing psychotropic drugs for these subjects, particularly those at risk of suicide reattempt.

@article{hendriks_change_2021,
	title = {Change over time in the surgical management of pelvic organ prolapse between 2008 and 2014 in {France}: patient profiles, surgical approaches, and outcomes},
	volume = {32},
	issn = {1433-3023},
	shorttitle = {Change over time in the surgical management of pelvic organ prolapse between 2008 and 2014 in {France}},
	doi = {10.1007/s00192-020-04491-2},
	abstract = {INTRODUCTION AND HYPOTHESIS: Pelvic organ prolapse (POP) is a common pathological condition that may require surgical management. Several surgical treatment options are possible, and practice varies from one center to another. The objective of the present study was to describe the surgical management and outcomes of POP in France from 2008 to 2014.
METHODS: We performed a retrospective cohort study of all patients operated on for POP from 2008 to 2014, according to the French national hospital discharge summary database. Patient characteristics, surgical approaches, concomitant hysterectomy and/or incontinence surgery, the length of stay, the proportion of day-case operations, and patient outcomes were analyzed.
RESULTS: We analyzed 310,938 hospital stays with POP surgery between 2008 and 2014; 130,908 (42\%) of the operations took place in hospitals performing more than 100 prolapse surgical procedures per year. The proportion of day-case operations was low, but rose significantly from 1.2\% to 4.6\% during the study period. More than half of the operations featured a vaginal approach. The proportions of operations with concomitant hysterectomy or urinary incontinence surgery fell from 41.0\% to 36.1\% and from 33.0\% to 25.8\% respectively. The proportions of laparoscopic procedures increased. The mortality rate was stable (0.07\% for all years).
CONCLUSIONS: The number of patients undergoing POP surgery remained stable from 2008 to 2014. The proportion of laparoscopic procedures increased (in parallel with the rising proportion of day-case operations) and the proportion of procedures with concomitant hysterectomy or incontinence treatment decreased.},
	language = {eng},
	number = {4},
	journal = {International Urogynecology Journal},
	author = {Hendriks, Mathilde and Bartolo, Stéphanie and Giraudet, Géraldine and Cosson, Michel and Chazard, Emmanuel},
	month = apr,
	year = {2021},
	pmid = {32894328},
	keywords = {Female, France, Gynecologic Surgical Procedures, Humans, Hysterectomy, Pelvic Organ Prolapse, Pelvic organ prolapse, Retrospective Studies, Treatment Outcome, Urinary Incontinence, Urinary incontinence},
	pages = {961--966},
}

INTRODUCTION AND HYPOTHESIS: Pelvic organ prolapse (POP) is a common pathological condition that may require surgical management. Several surgical treatment options are possible, and practice varies from one center to another. The objective of the present study was to describe the surgical management and outcomes of POP in France from 2008 to 2014. METHODS: We performed a retrospective cohort study of all patients operated on for POP from 2008 to 2014, according to the French national hospital discharge summary database. Patient characteristics, surgical approaches, concomitant hysterectomy and/or incontinence surgery, the length of stay, the proportion of day-case operations, and patient outcomes were analyzed. RESULTS: We analyzed 310,938 hospital stays with POP surgery between 2008 and 2014; 130,908 (42%) of the operations took place in hospitals performing more than 100 prolapse surgical procedures per year. The proportion of day-case operations was low, but rose significantly from 1.2% to 4.6% during the study period. More than half of the operations featured a vaginal approach. The proportions of operations with concomitant hysterectomy or urinary incontinence surgery fell from 41.0% to 36.1% and from 33.0% to 25.8% respectively. The proportions of laparoscopic procedures increased. The mortality rate was stable (0.07% for all years). CONCLUSIONS: The number of patients undergoing POP surgery remained stable from 2008 to 2014. The proportion of laparoscopic procedures increased (in parallel with the rising proportion of day-case operations) and the proportion of procedures with concomitant hysterectomy or incontinence treatment decreased.

@article{demesmaeker_risk_2021,
	title = {Risk {Factors} for {Reattempt} and {Suicide} {Within} 6 {Months} {After} an {Attempt} in the {French} {ALGOS} {Cohort}: {A} {Survival} {Tree} {Analysis}},
	volume = {82},
	issn = {1555-2101},
	shorttitle = {Risk {Factors} for {Reattempt} and {Suicide} {Within} 6 {Months} {After} an {Attempt} in the {French} {ALGOS} {Cohort}},
	doi = {10.4088/JCP.20m13589},
	abstract = {OBJECTIVE: Understanding the cumulative effect of several risk factors involved in suicidal behavior is crucial for the development of effective prevention plans. The objective of this study is to provide clinicians with a simple predictive model of the risk of suicide attempts and suicide within 6 months after suicide attempt.
METHODS: A prospective observational cohort of 972 subjects, included from January 26, 2010, to February 28, 2013, was used to perform a survival tree analysis with all sociodemographic and clinical variables available at inclusion. The results of the decision tree were then used to define a simple predictive algorithm for clinicians.
RESULTS: The results of survival tree analysis highlighted 3 subgroups of patients with an increased risk of suicide attempt or death by suicide within 6 months after suicide attempt: patients with alcohol use disorder and a previous suicide attempt with acute alcohol use (risk ratio [RR] = 2.92; 95\% CI, 2.08 to 4.10), patients with anxiety disorders (RR = 0.98; 95\% CI, 0.69 to 1.39), and patients with a history of more than 2 suicide attempts in the past 3 years (RR = 2.11; 95\% CI, 1.25 to 3.54). The good prognosis group comprised all other patients.
CONCLUSIONS: By using a data-driven method, this study identified 4 clinical factors interacting together to reduce or increase the risk of recidivism. These combinations of risk factors allow for a better evaluation of a subject's suicide risk in clinical practice.
TRIAL REGISTRATION: ClinicalTrials.gov identifier: NCT01123174.},
	language = {eng},
	number = {1},
	journal = {The Journal of Clinical Psychiatry},
	author = {Demesmaeker, Alice and Chazard, Emmanuel and Vaiva, Guillaume and Amad, Ali},
	month = feb,
	year = {2021},
	pmid = {33999539},
}

OBJECTIVE: Understanding the cumulative effect of several risk factors involved in suicidal behavior is crucial for the development of effective prevention plans. The objective of this study is to provide clinicians with a simple predictive model of the risk of suicide attempts and suicide within 6 months after suicide attempt. METHODS: A prospective observational cohort of 972 subjects, included from January 26, 2010, to February 28, 2013, was used to perform a survival tree analysis with all sociodemographic and clinical variables available at inclusion. The results of the decision tree were then used to define a simple predictive algorithm for clinicians. RESULTS: The results of survival tree analysis highlighted 3 subgroups of patients with an increased risk of suicide attempt or death by suicide within 6 months after suicide attempt: patients with alcohol use disorder and a previous suicide attempt with acute alcohol use (risk ratio [RR] = 2.92; 95% CI, 2.08 to 4.10), patients with anxiety disorders (RR = 0.98; 95% CI, 0.69 to 1.39), and patients with a history of more than 2 suicide attempts in the past 3 years (RR = 2.11; 95% CI, 1.25 to 3.54). The good prognosis group comprised all other patients. CONCLUSIONS: By using a data-driven method, this study identified 4 clinical factors interacting together to reduce or increase the risk of recidivism. These combinations of risk factors allow for a better evaluation of a subject's suicide risk in clinical practice. TRIAL REGISTRATION: ClinicalTrials.gov identifier: NCT01123174.

@article{disegni_hip_2021,
	title = {Hip arthroscopy in {France}: {An} epidemiological study of postoperative care and outcomes involving 3699 patients},
	volume = {107},
	issn = {1877-0568},
	shorttitle = {Hip arthroscopy in {France}},
	doi = {10.1016/j.otsr.2020.102767},
	abstract = {BACKGROUND: Hip arthroscopy is a surgical procedure that is becoming more and more prevalent in France. Even though indications are now well-established little is still known about patient outcomes. Therefore, the purpose of our retrospective study was to: (1) describe the circumstances in which hip arthroscopies are being performed; (2) study arthroscopy and arthroplasty reoperation rates; (3) assess the incidence of readmissions for complications.
HYPOTHESIS: Hip arthroscopy in France produced similar results to those observed in other countries.
MATERIALS AND METHODS: We conducted a cohort study from January 2008 to December 2014 in the French population using the national hospital discharge database called "Programme de médicalisation des systèmes d'information (PMSI)." We included all admissions that had a hip arthroscopy code and analyzed readmissions for conversion to hip arthroplasty, revision hip arthroscopy and complications (without being able to provide detailed descriptions). Risk factors associated with conversion, revision and readmission for complications were studied after performing a population analysis.
RESULTS: A total of 3,699 patients were included over a period of seven years. The mean age was 40 years, with women being significantly older (mean age of 43 years) than men (38 years) (p{\textless}0.05). The number of procedures increased from 240 in 2008 to 702 in 2014. Synovectomies (67.9\%; 2514/3699) and surgical bone procedures (acetabuloplasty or femoroplasty) (47.3\%; 1751/3699) were the main procedures performed during the primary arthroscopy. In total, 410 patients underwent a conversion to arthroplasty, 231 patients had a revision arthroscopy, and 126 patients suffered a complication. Five years after the index procedure, the conversion rate was 16.3\%, revision rate was 8.2\%, and readmission rate for a postoperative complication was 5\%. The main risk factor associated with conversions was [Hazard ratio (HR) and 95\% Confidence Index (CI)] an age between 40 and 79 years during the first arthroscopy [3.04 (2.40; 3.87) compared with the reference class of 25-39 years]. Patients between ages 16 to 24 years during the first arthroscopy (0.35 [0.20; 0.61] compared with the reference class of 25-39 years) had a decreased risk of conversion (HR and 95\% CI). The main risk factors associated with revisions were: synovectomies [1.90 (1.34; 2.70)] and surgical bone procedures on the femoral neck and/or the acetabulum [1.82 (1.36; 2.4)]. The risk factor associated with complication-related readmissions was an age greater than 40 years [2.23 (1.43; 3.49)].
CONCLUSION: Unlike the international literature, our study population was largely male. The rates of revision (8.2\% after five years) and conversion to arthroplasty (16.3\% after five years) were relatively low and comparable to the different international studies. This procedure, which is not widely performed, is growing in popularity, has low morbidity and remains an interesting approach given the revision and conversion rates after five years. The implementation of specific coding for arthroscopic hip procedures and the pathologies to be treated seems warranted.
LEVEL OF EVIDENCE: IV; descriptive epidemiological study.},
	language = {eng},
	number = {1},
	journal = {Orthopaedics \& traumatology, surgery \& research: OTSR},
	author = {Disegni, Elio and Martinot, Pierre and Dartus, Julien and Migaud, Henri and Putman, Sophie and May, Olivier and Girard, Julien and Chazard, Emmanuel},
	month = feb,
	year = {2021},
	pmid = {33333273},
	keywords = {Complication, Femoroacetabular impingement syndrome, Hip arthroplasty, Hip arthroscopy, Readmission},
	pages = {102767},
}

BACKGROUND: Hip arthroscopy is a surgical procedure that is becoming more and more prevalent in France. Even though indications are now well-established little is still known about patient outcomes. Therefore, the purpose of our retrospective study was to: (1) describe the circumstances in which hip arthroscopies are being performed; (2) study arthroscopy and arthroplasty reoperation rates; (3) assess the incidence of readmissions for complications. HYPOTHESIS: Hip arthroscopy in France produced similar results to those observed in other countries. MATERIALS AND METHODS: We conducted a cohort study from January 2008 to December 2014 in the French population using the national hospital discharge database called "Programme de médicalisation des systèmes d'information (PMSI)." We included all admissions that had a hip arthroscopy code and analyzed readmissions for conversion to hip arthroplasty, revision hip arthroscopy and complications (without being able to provide detailed descriptions). Risk factors associated with conversion, revision and readmission for complications were studied after performing a population analysis. RESULTS: A total of 3,699 patients were included over a period of seven years. The mean age was 40 years, with women being significantly older (mean age of 43 years) than men (38 years) (p\textless0.05). The number of procedures increased from 240 in 2008 to 702 in 2014. Synovectomies (67.9%; 2514/3699) and surgical bone procedures (acetabuloplasty or femoroplasty) (47.3%; 1751/3699) were the main procedures performed during the primary arthroscopy. In total, 410 patients underwent a conversion to arthroplasty, 231 patients had a revision arthroscopy, and 126 patients suffered a complication. Five years after the index procedure, the conversion rate was 16.3%, revision rate was 8.2%, and readmission rate for a postoperative complication was 5%. The main risk factor associated with conversions was [Hazard ratio (HR) and 95% Confidence Index (CI)] an age between 40 and 79 years during the first arthroscopy [3.04 (2.40; 3.87) compared with the reference class of 25-39 years]. Patients between ages 16 to 24 years during the first arthroscopy (0.35 [0.20; 0.61] compared with the reference class of 25-39 years) had a decreased risk of conversion (HR and 95% CI). The main risk factors associated with revisions were: synovectomies [1.90 (1.34; 2.70)] and surgical bone procedures on the femoral neck and/or the acetabulum [1.82 (1.36; 2.4)]. The risk factor associated with complication-related readmissions was an age greater than 40 years [2.23 (1.43; 3.49)]. CONCLUSION: Unlike the international literature, our study population was largely male. The rates of revision (8.2% after five years) and conversion to arthroplasty (16.3% after five years) were relatively low and comparable to the different international studies. This procedure, which is not widely performed, is growing in popularity, has low morbidity and remains an interesting approach given the revision and conversion rates after five years. The implementation of specific coding for arthroscopic hip procedures and the pathologies to be treated seems warranted. LEVEL OF EVIDENCE: IV; descriptive epidemiological study.

@article{chazard_towards_2021,
	title = {Towards {The} {Automated}, {Empirical} {Filtering} of {Drug}-{Drug} {Interaction} {Alerts} in {Clinical} {Decision} {Support} {Systems}: {Historical} {Cohort} {Study} of {Vitamin} {K} {Antagonists}},
	volume = {9},
	issn = {2291-9694},
	shorttitle = {Towards {The} {Automated}, {Empirical} {Filtering} of {Drug}-{Drug} {Interaction} {Alerts} in {Clinical} {Decision} {Support} {Systems}},
	doi = {10.2196/20862},
	abstract = {BACKGROUND: Drug-drug interactions (DDIs) involving vitamin K antagonists (VKAs) constitute an important cause of in-hospital morbidity and mortality. However, the list of potential DDIs is long; the implementation of all these interactions in a clinical decision support system (CDSS) results in over-alerting and alert fatigue, limiting the benefits provided by the CDSS.
OBJECTIVE: To estimate the probability of occurrence of international normalized ratio (INR) changes for each DDI rule, via the reuse of electronic health records.
METHODS: An 8-year, exhaustive, population-based, historical cohort study including a French community hospital, a group of Danish community hospitals, and a Bulgarian hospital. The study database included 156,893 stays. After filtering against two criteria (at least one VKA administration and at least one INR laboratory result), the final analysis covered 4047 stays. Exposure to any of the 145 drugs known to interact with VKA was tracked and analyzed if at least 3 patients were concerned. The main outcomes are VKA potentiation (defined as an INR≥5) and VKA inhibition (defined as an INR≤1.5). Groups were compared using the Fisher exact test and logistic regression, and the results were expressed as an odds ratio (95\% confidence limits).
RESULTS: The drugs known to interact with VKAs either did not have a statistically significant association regarding the outcome (47 drug administrations and 14 discontinuations) or were associated with significant reduction in risk of its occurrence (odds ratio{\textless}1 for 18 administrations and 21 discontinuations).
CONCLUSIONS: The probabilities of outcomes obtained were not those expected on the basis of our current body of pharmacological knowledge. The results do not cast doubt on our current pharmacological knowledge per se but do challenge the commonly accepted idea whereby this knowledge alone should be used to define when a DDI alert should be displayed. Real-life probabilities should also be considered during the filtration of DDI alerts by CDSSs, as proposed in SPC-CDSS (statistically prioritized and contextualized CDSS). However, these probabilities may differ from one hospital to another and so should probably be calculated locally.},
	language = {eng},
	number = {1},
	journal = {JMIR medical informatics},
	author = {Chazard, Emmanuel and Boudry, Augustin and Beeler, Patrick Emanuel and Dalleur, Olivia and Hubert, Hervé and Tréhou, Eric and Beuscart, Jean-Baptiste and Bates, David Westfall},
	month = jan,
	year = {2021},
	pmid = {33470938},
	keywords = {alert fatigue, anticoagulants, clinical decision support system, computerized physician order entry, decision support systems, clinical, drug-drug interaction, drug-related side effects and adverse reactions, medical order entry system, over-alerting, vitamin K antagonist},
	pages = {e20862},
}

BACKGROUND: Drug-drug interactions (DDIs) involving vitamin K antagonists (VKAs) constitute an important cause of in-hospital morbidity and mortality. However, the list of potential DDIs is long; the implementation of all these interactions in a clinical decision support system (CDSS) results in over-alerting and alert fatigue, limiting the benefits provided by the CDSS. OBJECTIVE: To estimate the probability of occurrence of international normalized ratio (INR) changes for each DDI rule, via the reuse of electronic health records. METHODS: An 8-year, exhaustive, population-based, historical cohort study including a French community hospital, a group of Danish community hospitals, and a Bulgarian hospital. The study database included 156,893 stays. After filtering against two criteria (at least one VKA administration and at least one INR laboratory result), the final analysis covered 4047 stays. Exposure to any of the 145 drugs known to interact with VKA was tracked and analyzed if at least 3 patients were concerned. The main outcomes are VKA potentiation (defined as an INR≥5) and VKA inhibition (defined as an INR≤1.5). Groups were compared using the Fisher exact test and logistic regression, and the results were expressed as an odds ratio (95% confidence limits). RESULTS: The drugs known to interact with VKAs either did not have a statistically significant association regarding the outcome (47 drug administrations and 14 discontinuations) or were associated with significant reduction in risk of its occurrence (odds ratio\textless1 for 18 administrations and 21 discontinuations). CONCLUSIONS: The probabilities of outcomes obtained were not those expected on the basis of our current body of pharmacological knowledge. The results do not cast doubt on our current pharmacological knowledge per se but do challenge the commonly accepted idea whereby this knowledge alone should be used to define when a DDI alert should be displayed. Real-life probabilities should also be considered during the filtration of DDI alerts by CDSSs, as proposed in SPC-CDSS (statistically prioritized and contextualized CDSS). However, these probabilities may differ from one hospital to another and so should probably be calculated locally.

@article{hubert_use_2020,
	title = {Use of out-of-hospital cardiac arrest registries to assess {COVID}-19 home mortality},
	volume = {20},
	issn = {1471-2288},
	doi = {10.1186/s12874-020-01189-3},
	abstract = {BACKGROUND: In most countries, the official statistics for the coronavirus disease 2019 (COVID-19) take account of in-hospital deaths but not those that occur at home. The study's objective was to introduce a methodology to assess COVID-19 home deaths by analysing the French national out-of-hospital cardiac arrest (OHCA) registry (RéAC).
METHODS: We performed a retrospective multicentre cohort study based on data recorded in the RéAC by 20 mobile medical teams (MMTs) between March 1st and April 15th, 2020. The participating MMTs covered 10.1\% of the French population. OHCA patients were classified as probable or confirmed COVID-19 cases or as non-COVID-19 cases. To achieve our primary objective, we computed the incidence and survival at hospital admission of cases of COVID-19 OHCA occurring at home. Cardiac arrests that occurred in retirement homes or public places were excluded. Hence, we estimated the number of at-home COVID-19-related deaths that were not accounted for in the French national statistics.
RESULTS: We included 670 patients with OHCA. The extrapolated annual incidence of OHCA per 100,000 inhabitants was 91.9 overall and 17.6 for COVID-19 OHCA occurring at home. In the latter group, the survival rate after being taken to the hospital after an OHCA was 10.9\%. We estimated that 1322 deaths were not accounted in the French national statistics on April 15, 2020.
CONCLUSIONS: The ratio of COVID-19 out-of-hospital deaths to in-hospital deaths was 12.4\%, and so the national statistics underestimated the death rate.},
	language = {eng},
	number = {1},
	journal = {BMC medical research methodology},
	author = {Hubert, Hervé and Baert, Valentine and Beuscart, Jean-Baptiste and Chazard, Emmanuel},
	month = dec,
	year = {2020},
	pmid = {33317467},
	pmcid = {PMC7734460},
	keywords = {COVID-19, COVID-19 home mortality, Epidemiology, Out-of-hospital cardiac arrest},
	pages = {305},
}

BACKGROUND: In most countries, the official statistics for the coronavirus disease 2019 (COVID-19) take account of in-hospital deaths but not those that occur at home. The study's objective was to introduce a methodology to assess COVID-19 home deaths by analysing the French national out-of-hospital cardiac arrest (OHCA) registry (RéAC). METHODS: We performed a retrospective multicentre cohort study based on data recorded in the RéAC by 20 mobile medical teams (MMTs) between March 1st and April 15th, 2020. The participating MMTs covered 10.1% of the French population. OHCA patients were classified as probable or confirmed COVID-19 cases or as non-COVID-19 cases. To achieve our primary objective, we computed the incidence and survival at hospital admission of cases of COVID-19 OHCA occurring at home. Cardiac arrests that occurred in retirement homes or public places were excluded. Hence, we estimated the number of at-home COVID-19-related deaths that were not accounted for in the French national statistics. RESULTS: We included 670 patients with OHCA. The extrapolated annual incidence of OHCA per 100,000 inhabitants was 91.9 overall and 17.6 for COVID-19 OHCA occurring at home. In the latter group, the survival rate after being taken to the hospital after an OHCA was 10.9%. We estimated that 1322 deaths were not accounted in the French national statistics on April 15, 2020. CONCLUSIONS: The ratio of COVID-19 out-of-hospital deaths to in-hospital deaths was 12.4%, and so the national statistics underestimated the death rate.

@article{cren_is_2020,
	title = {Is the survival of patients treated with ipilimumab affected by antibiotics? {An} analysis of 1585 patients from the {French} {National} hospital discharge summary database ({PMSI})},
	volume = {9},
	issn = {2162-402X},
	shorttitle = {Is the survival of patients treated with ipilimumab affected by antibiotics?},
	doi = {10.1080/2162402X.2020.1846914},
	abstract = {Background: The gut microbiota has a key role in the regulation of the immune system. Disruption of the gut microbiota's composition by antibiotics might significantly affect the efficacy of immune checkpoint inhibitors. In a study of patients treated with ipilimumab, we sought to assess the relationship between overall survival and in-hospital antibiotic administration. Methods: Patients having been treated with ipilimumab between January 2012 and November 2014 were selected from the French National Hospital Discharge Summary Database. Exposure to antibiotics was defined as the presence of a hospital stay with a documented systemic bacterial infection in the 2 months before or the month after initiation of the patient's first ever course of ipilimumab. The primary outcome was overall survival. Results: We studied 43,124 hospital stays involving 1585 patients from 97 centers. All patients had received ipilimumab monotherapy for advanced melanoma. Overall, 117 of the 1585 patients (7.4\%) were documented as having received systemic antibiotic therapy in hospital during the defined exposure period. The median overall survival time was shorter in patients with infection (6.3 months, vs. 15.4 months in patients without an infection; hazard ratio (HR) = 1.88, 95\% confidence interval [1.46; 2.43], p = 10-6). In a multivariate analysis adjusted for covariates, infection was still significantly associated with overall survival (HR = 1.68, [1.30; 2.18], p = 10-5). Conclusions: In patients treated with ipilimumab for advanced melanoma, infection, and antibiotic administration in hospital at around the time of the patient's first ever course of ipilimumab appears to be associated with significantly lower clinical benefit.},
	language = {eng},
	number = {1},
	journal = {Oncoimmunology},
	author = {Cren, Pierre-Yves and Bertrand, Nicolas and Le Deley, Marie-Cécile and Génin, Michaël and Mortier, Laurent and Odou, Pascal and Penel, Nicolas and Chazard, Emmanuel},
	month = nov,
	year = {2020},
	pmid = {33299658},
	pmcid = {PMC7714497},
	keywords = {Melanoma, antibiotics, data reuse, gut microbiota, immune checkpoint inhibitor, immunotherapy, infection, ipilimumab},
	pages = {1846914},
}

Background: The gut microbiota has a key role in the regulation of the immune system. Disruption of the gut microbiota's composition by antibiotics might significantly affect the efficacy of immune checkpoint inhibitors. In a study of patients treated with ipilimumab, we sought to assess the relationship between overall survival and in-hospital antibiotic administration. Methods: Patients having been treated with ipilimumab between January 2012 and November 2014 were selected from the French National Hospital Discharge Summary Database. Exposure to antibiotics was defined as the presence of a hospital stay with a documented systemic bacterial infection in the 2 months before or the month after initiation of the patient's first ever course of ipilimumab. The primary outcome was overall survival. Results: We studied 43,124 hospital stays involving 1585 patients from 97 centers. All patients had received ipilimumab monotherapy for advanced melanoma. Overall, 117 of the 1585 patients (7.4%) were documented as having received systemic antibiotic therapy in hospital during the defined exposure period. The median overall survival time was shorter in patients with infection (6.3 months, vs. 15.4 months in patients without an infection; hazard ratio (HR) = 1.88, 95% confidence interval [1.46; 2.43], p = 10-6). In a multivariate analysis adjusted for covariates, infection was still significantly associated with overall survival (HR = 1.68, [1.30; 2.18], p = 10-5). Conclusions: In patients treated with ipilimumab for advanced melanoma, infection, and antibiotic administration in hospital at around the time of the patient's first ever course of ipilimumab appears to be associated with significantly lower clinical benefit.

@article{chazard_big_2020,
	title = {Big data, data reuse en santé : un chemin semé d’embûches nécessitant une approche pluridisciplinaire},
	issn = {1243-275X},
	url = {https://www.hcsp.fr/Explore.cgi/adsp?clef=1173},
	language = {Fr},
	number = {112},
	urldate = {2021-01-05},
	journal = {Actualité et dossier en santé publique},
	author = {Chazard, Emmanuel},
	month = sep,
	year = {2020},
	pages = {51--53},
}

@article{chazard_statistically_2020,
	title = {Statistically {Prioritized} and {Contextualized} {Clinical} {Decision} {Support} {Systems}, the {Future} of {Adverse} {Drug} {Events} {Prevention}?},
	volume = {270},
	issn = {1879-8365},
	doi = {10.3233/SHTI200247},
	abstract = {Clinical decision support systems (CDSS) fail to prevent adverse drug events (ADE), notably due to over-alerting and alert-fatigue. Many methods have been proposed in the literature to reduce over-alerting of CDSS: enhancing post-alert medical management, taking into account user-related context, patient-related context and temporal aspects, improving medical relevance of alerts, filtering or tiering alerts on the basis of their strength of evidence, their severity, their override rate, or the probability of outcome. This paper analyzes the different options, and proposes the setup of SPC-CDSS (statistically prioritized and contextualized CDSS). The principle is that, when a SPC-CDSS is implemented in a medical unit, it first reuses actual clinical data, and searches for traceable outcomes. Then, for each rule trying to prevent this outcome, the SPC-CDSS automatically estimates the conditional probability of outcome knowing that the conditions of the rule are met, by retrospective secondary use of data. The alert can be turned off below a chosen probability threshold. This probability computation can be performed in each medical unit, in order to take into account its sensitivity to context.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Chazard, Emmanuel and Beuscart, Jean-Baptiste and Rochoy, Michaël and Dalleur, Olivia and Decaudin, Bertrand and Odou, Pascal and Ficheur, Grégoire},
	month = jun,
	year = {2020},
	pmid = {32570470},
	keywords = {Adverse drug events, Clinical decision support systems, data reuse},
	pages = {683--687},
}

Clinical decision support systems (CDSS) fail to prevent adverse drug events (ADE), notably due to over-alerting and alert-fatigue. Many methods have been proposed in the literature to reduce over-alerting of CDSS: enhancing post-alert medical management, taking into account user-related context, patient-related context and temporal aspects, improving medical relevance of alerts, filtering or tiering alerts on the basis of their strength of evidence, their severity, their override rate, or the probability of outcome. This paper analyzes the different options, and proposes the setup of SPC-CDSS (statistically prioritized and contextualized CDSS). The principle is that, when a SPC-CDSS is implemented in a medical unit, it first reuses actual clinical data, and searches for traceable outcomes. Then, for each rule trying to prevent this outcome, the SPC-CDSS automatically estimates the conditional probability of outcome knowing that the conditions of the rule are met, by retrospective secondary use of data. The alert can be turned off below a chosen probability threshold. This probability computation can be performed in each medical unit, in order to take into account its sensitivity to context.

@article{dhalluin_comparison_2020,
	title = {Comparison of {Unplanned} 30-{Day} {Readmission} {Prediction} {Models}, {Based} on {Hospital} {Warehouse} and {Demographic} {Data}},
	volume = {270},
	issn = {1879-8365},
	doi = {10.3233/SHTI200220},
	abstract = {Anticipating unplanned hospital readmission episodes is a safety and medico-economic issue. We compared statistics (Logistic Regression) and machine learning algorithms (Gradient Boosting, Random Forest, and Neural Network) for predicting the risk of all-cause, 30-day hospital readmission using data from the clinical data warehouse of Rennes and from other sources. The dataset included hospital stays based on the criteria of the French national methodology for the 30-day readmission rate (i.e., patients older than 18 years, geolocation, no iterative stays, and no hospitalization for palliative care), with a similar pre-processing for all algorithms. We calculated the area under the ROC curve (AUC) for 30-day readmission prediction by each model. In total, we included 259114 hospital stays, with a readmission rate of 8.8\%. The AUC was 0.61 for the Logistic Regression, 0.69 for the Gradient Boosting, 0.69 for the Random Forest, and 0.62 for the Neural Network model. We obtained the best performance and reproducibility to predict readmissions with Random Forest, and found that the algorithms performed better when data came from different sources.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Dhalluin, Thibault and Bannay, Aurélie and Lemordant, Pierre and Sylvestre, Emmanuelle and Chazard, Emmanuel and Cuggia, Marc and Bouzille, Guillaume},
	month = jun,
	year = {2020},
	pmid = {32570443},
	keywords = {Data Warehousing, Medical Informatics, Patient Readmission/statistics and numerical data, Supervised Machine Learning},
	pages = {547--551},
}

Anticipating unplanned hospital readmission episodes is a safety and medico-economic issue. We compared statistics (Logistic Regression) and machine learning algorithms (Gradient Boosting, Random Forest, and Neural Network) for predicting the risk of all-cause, 30-day hospital readmission using data from the clinical data warehouse of Rennes and from other sources. The dataset included hospital stays based on the criteria of the French national methodology for the 30-day readmission rate (i.e., patients older than 18 years, geolocation, no iterative stays, and no hospitalization for palliative care), with a similar pre-processing for all algorithms. We calculated the area under the ROC curve (AUC) for 30-day readmission prediction by each model. In total, we included 259114 hospital stays, with a readmission rate of 8.8%. The AUC was 0.61 for the Logistic Regression, 0.69 for the Gradient Boosting, 0.69 for the Random Forest, and 0.62 for the Neural Network model. We obtained the best performance and reproducibility to predict readmissions with Random Forest, and found that the algorithms performed better when data came from different sources.

@article{lamer_exploring_2020,
	title = {Exploring {Patient} {Path} {Through} {Sankey} {Diagram}: {A} {Proof} of {Concept}},
	volume = {270},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {Exploring {Patient} {Path} {Through} {Sankey} {Diagram}},
	doi = {10.3233/SHTI200154},
	abstract = {Managers, physicians and researchers need to study patient's path for purposes of management, quality of care and research. We present the proof of concept of the use of a flow diagram, the Sankey diagram, to visualize the trajectory of a population that experienced an event. This representation was tested with two case studies in populations from the anesthesia data warehouse of Lille University Hospital. For the 551 patients undergoing a pancreaticoduodenectomy, Sankey diagram helped us identify atypical care paths of patient being transferred too late in an intensive care unit. For 473953 patients who have had anesthesia procedure, Sankey diagram highlighted that mortality and re-operation rates increase with the number of operations. This preliminary work has been well received by end-users and allowed managers, physicians and researchers to visualize the paths of patients and to provide visualization support for research questions. This work will be followed by generalization.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Lamer, Antoine and Laurent, Gery and Pelayo, Sylvia and El Amrani, Mehdi and Chazard, Emmanuel and Marcilly, Romaric},
	month = jun,
	year = {2020},
	pmid = {32570378},
	keywords = {Data Reuse, Data Visualization, Patient Path, Sankey Diagram},
	pages = {218--222},
}

Managers, physicians and researchers need to study patient's path for purposes of management, quality of care and research. We present the proof of concept of the use of a flow diagram, the Sankey diagram, to visualize the trajectory of a population that experienced an event. This representation was tested with two case studies in populations from the anesthesia data warehouse of Lille University Hospital. For the 551 patients undergoing a pancreaticoduodenectomy, Sankey diagram helped us identify atypical care paths of patient being transferred too late in an intensive care unit. For 473953 patients who have had anesthesia procedure, Sankey diagram highlighted that mortality and re-operation rates increase with the number of operations. This preliminary work has been well received by end-users and allowed managers, physicians and researchers to visualize the paths of patients and to provide visualization support for research questions. This work will be followed by generalization.

@article{martignene_heimdall_2020,
	title = {Heimdall, a {Computer} {Program} for {Electronic} {Health} {Records} {Data} {Visualization}},
	volume = {270},
	issn = {1879-8365},
	doi = {10.3233/SHTI200160},
	abstract = {INTRODUCTION: Electronic health records (EHR) comprehend structured and unstructured data, that are usually time dependent, enabling the use of timelines. However, it is often difficult to display all data without inducing information overload. In both clinical usual care and medical research, users should be able to quickly find relevant information, with minimal cognitive overhead. Our goal was to devise simple visualization techniques for handling medical data in both contexts.
METHODS: An abstraction layer for structured EHR data was devised after an informal literature review and discussions between authors. The "Heimdall" prototype was developed. Two experts evaluated the tool by answering 5 questions on 24 clinical cases.
RESULTS: Temporal data was abstracted in three simple types: events, states and measures, with appropriate visual representations for each type. Heimdall can load and display complex heterogeneous structured temporal data in a straightforward way. The main view can display events, states and measures along a shared timeline. Users can summarize data using temporal, hierarchical compression and filters. Default and custom views can be used to work in problem- oriented ways. The evaluation found conclusive results.
CONCLUSION: The "Heimdall" prototype provides a comprehensive and efficient graphical interface for EHR data visualization. It is open source, can be used with an R package, and is available at https://koromix.dev/files/R.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Martignene, Niels and Balcaen, Thibaut and Bouzille, Guillaume and Calafiore, Matthieu and Beuscart, Jean-Baptiste and Lamer, Antoine and Legrand, Bertrand and Ficheur, Grégoire and Chazard, Emmanuel},
	month = jun,
	year = {2020},
	pmid = {32570384},
	keywords = {Electronic health records, Feature extraction, Timeline, Visualization},
	pages = {247--251},
}

INTRODUCTION: Electronic health records (EHR) comprehend structured and unstructured data, that are usually time dependent, enabling the use of timelines. However, it is often difficult to display all data without inducing information overload. In both clinical usual care and medical research, users should be able to quickly find relevant information, with minimal cognitive overhead. Our goal was to devise simple visualization techniques for handling medical data in both contexts. METHODS: An abstraction layer for structured EHR data was devised after an informal literature review and discussions between authors. The "Heimdall" prototype was developed. Two experts evaluated the tool by answering 5 questions on 24 clinical cases. RESULTS: Temporal data was abstracted in three simple types: events, states and measures, with appropriate visual representations for each type. Heimdall can load and display complex heterogeneous structured temporal data in a straightforward way. The main view can display events, states and measures along a shared timeline. Users can summarize data using temporal, hierarchical compression and filters. Default and custom views can be used to work in problem- oriented ways. The evaluation found conclusive results. CONCLUSION: The "Heimdall" prototype provides a comprehensive and efficient graphical interface for EHR data visualization. It is open source, can be used with an R package, and is available at https://koromix.dev/files/R.

@article{sylvestre_semi-automated_2020,
	title = {A {Semi}-{Automated} {Approach} for {Multilingual} {Terminology} {Matching}: {Mapping} the {French} {Version} of the {ICD}-10 to the {ICD}-10 {CM}},
	volume = {270},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {A {Semi}-{Automated} {Approach} for {Multilingual} {Terminology} {Matching}},
	doi = {10.3233/SHTI200114},
	abstract = {The aim of this study was to develop a simple method to map the French International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems, 10th revision (ICD-10) with the International Classification of Diseases, 10th Revision, Clinical Modification (ICD-10 CM). We sought to map these terminologies forward (ICD-10 to ICD-10 CM) and backward (ICD-10 CM to ICD-10) and to assess the accuracy of these two mappings. We used several terminology resources such as the Unified Medical Language System (UMLS) Metathesaurus, Bioportal, the latest version available of the French ICD-10 and several official mapping files between different versions of the ICD-10. We first retrieved existing partial mapping between the ICD-10 and the ICD-10 CM. Then, we automatically matched the ICD-10 with the ICD-10-CM, using our different reference mapping files. Finally, we used manual review and natural language processing (NLP) to match labels between the two terminologies. We assessed the accuracy of both methods with a manual review of a random dataset from the results files. The overall matching was between 94.2 and 100\%. The backward mapping was better than the forward one, especially regarding exact matches. In both cases, the NLP step was highly accurate. When there are no available experts from the ontology or NLP fields for multi-lingual ontology matching, this simple approach enables secondary reuse of Electronic Health Records (EHR) and billing data for research purposes in an international context.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Sylvestre, Emmanuelle and Bouzillé, Guillaume and McDuffie, Michael and Chazard, Emmanuel and Avillach, Paul and Cuggia, Marc},
	month = jun,
	year = {2020},
	pmid = {32570338},
	keywords = {Clinical terminologies, ICD-10, Interoperability, Multilingual matching},
	pages = {18--22},
}

The aim of this study was to develop a simple method to map the French International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems, 10th revision (ICD-10) with the International Classification of Diseases, 10th Revision, Clinical Modification (ICD-10 CM). We sought to map these terminologies forward (ICD-10 to ICD-10 CM) and backward (ICD-10 CM to ICD-10) and to assess the accuracy of these two mappings. We used several terminology resources such as the Unified Medical Language System (UMLS) Metathesaurus, Bioportal, the latest version available of the French ICD-10 and several official mapping files between different versions of the ICD-10. We first retrieved existing partial mapping between the ICD-10 and the ICD-10 CM. Then, we automatically matched the ICD-10 with the ICD-10-CM, using our different reference mapping files. Finally, we used manual review and natural language processing (NLP) to match labels between the two terminologies. We assessed the accuracy of both methods with a manual review of a random dataset from the results files. The overall matching was between 94.2 and 100%. The backward mapping was better than the forward one, especially regarding exact matches. In both cases, the NLP step was highly accurate. When there are no available experts from the ontology or NLP fields for multi-lingual ontology matching, this simple approach enables secondary reuse of Electronic Health Records (EHR) and billing data for research purposes in an international context.

@article{hequette-ruz_hip_2020,
	title = {Hip fractures and characteristics of living area: a fine-scale spatial analysis in {France}},
	issn = {1433-2965},
	shorttitle = {Hip fractures and characteristics of living area},
	doi = {10.1007/s00198-020-05363-7},
	abstract = {We investigated the association between hip fracture incidence and living area characteristics in France. The spatial distribution of hip fracture incidence was heterogeneous and there was a significant relationship between social deprivation, urbanization, health access, and hip fracture risk.
INTRODUCTION: Several studies have shown great disparities in spatial repartition of hip fractures (HF). The aim of the study was to analyze the association between HF incidence and characteristics of the living area.
METHODS: All patients aged 50 or older, living in France, who were hospitalized for HF between 2012 and 2014 were included, using the French national hospital discharge database. Standardized incidence ratio (SIR) was calculated for each spatial unit and adjusted on age and sex. An ecological regression was performed to analyze the association between HF standardized incidence and ecological variables. We adjusted the model for neighborhood spatial structure. We used three variables to characterize the living areas: a deprivation index (French-EDI); healthcare access (French standardized index); land use (percentage of artificialized surfaces).
RESULTS: A total of 236,328 HF were recorded in the French hospital national database, leading to an annual HF incidence of 333/100,000. The spatial analysis revealed geographical variations of HF incidence with SIR varying from 0.67 (0.52; 0.85) to 1.45 (1.23; 1.70). There was a significant association between HF incidence rates and (1) French-EDI (trend p = 0.0023); (2) general practitioner and nurse accessibility (trend p = 0.0232 and p = 0.0129, respectively); (3) percentage of artificialized surfaces (p {\textless} 0.0001).
CONCLUSION: The characteristics of the living area are associated with significant differences in the risk of hip fracture of older people.},
	language = {eng},
	journal = {Osteoporosis international: a journal established as result of cooperation between the European Foundation for Osteoporosis and the National Osteoporosis Foundation of the USA},
	author = {Héquette-Ruz, R. and Beuscart, J.-B. and Ficheur, G. and Chazard, E. and Guillaume, E. and Paccou, J. and Puisieux, F. and Genin, M.},
	month = mar,
	year = {2020},
	pmid = {32140738},
	keywords = {Aged, Aged, 80 and over, Ecological factors, Elderly, France, Hip Fractures, Hip fracture, Humans, Incidence, Middle Aged, Residence Characteristics, Spatial Analysis, Spatial regression},
}

We investigated the association between hip fracture incidence and living area characteristics in France. The spatial distribution of hip fracture incidence was heterogeneous and there was a significant relationship between social deprivation, urbanization, health access, and hip fracture risk. INTRODUCTION: Several studies have shown great disparities in spatial repartition of hip fractures (HF). The aim of the study was to analyze the association between HF incidence and characteristics of the living area. METHODS: All patients aged 50 or older, living in France, who were hospitalized for HF between 2012 and 2014 were included, using the French national hospital discharge database. Standardized incidence ratio (SIR) was calculated for each spatial unit and adjusted on age and sex. An ecological regression was performed to analyze the association between HF standardized incidence and ecological variables. We adjusted the model for neighborhood spatial structure. We used three variables to characterize the living areas: a deprivation index (French-EDI); healthcare access (French standardized index); land use (percentage of artificialized surfaces). RESULTS: A total of 236,328 HF were recorded in the French hospital national database, leading to an annual HF incidence of 333/100,000. The spatial analysis revealed geographical variations of HF incidence with SIR varying from 0.67 (0.52; 0.85) to 1.45 (1.23; 1.70). There was a significant association between HF incidence rates and (1) French-EDI (trend p = 0.0023); (2) general practitioner and nurse accessibility (trend p = 0.0232 and p = 0.0129, respectively); (3) percentage of artificialized surfaces (p \textless 0.0001). CONCLUSION: The characteristics of the living area are associated with significant differences in the risk of hip fracture of older people.

@article{martignene_heimdall_2020-1,
	series = {{VIIe} {Colloque} national organisé conjointement par l’{Association} des {Epidémiologistes} de langue française ({Adelf}) et par l’{Association} {Evaluation}, management, organisations, santé ({Emois}) {Livre} des résumés présentés au {Congrès} {Paris}, 12 et 13 mars 2020},
	title = {Heimdall, logiciel de visualisation des données temporelles des dossiers patients électroniques},
	volume = {68},
	issn = {0398-7620},
	url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762020300651},
	doi = {10.1016/j.respe.2020.01.057},
	abstract = {Introduction
Le dossier patient électronique contient des données temporelles structurées (PMSI, biologie médicale, médicaments, etc.) ou non (documents, images, etc.). Leur utilisation est double : transactionnelle (un seul patient, pour le soin) ou décisionnelle (plusieurs patients, réutilisation de données). Des outils de visualisation existent mais ne couvrent pas ces deux champs, rendent mal l’aspect hiérarchique des terminologies, et décloisonnent mal les données de sources différentes. L’objectif est de concevoir un tel outil.
Méthodes
Conception : nous abstrayons les types de données, puis spécifions les composants graphiques et leur mode de compactage. Développement : le prototype est développé en C++, disponible en librairie R. Évaluation : deux médecins répondent à cinq questions portant sur 24 cas cliniques réels d’insuffisance rénale aiguë, en utilisant trois interfaces dont Heimdall.
Résultats
Prototype : le temps suit l’axe horizontal, les concepts suivent l’axe vertical. Les « événements » sont représentés sous forme de triangles, les « états » de rectangles, les « mesures » de courbes (avec interpolation LOCF, linéaire ou spline). Ces composants sont embarqués dans une arborescence exploitant notamment celle des terminologies (CIM10, CCAM, etc.). Cette arborescence permet un repliement vertical, avec fusion des composants. Une condensation temporelle est possible. En mode décisionnel, les patients peuvent être alignés sur un événement (ex : appendicectomie). Les vues par problème (ex : fonction rénale, hématologie, etc.) déploient automatiquement des composants et en compactent d’autres. Évaluation : pour charger 3500 patients (360 000 valeurs), il faut une seconde et 50 Mo de mémoire. L’interface Heimdall est aussi rapide à utiliser par des médecins qu’une interface filtrée, et plus qu’une interface brute. Le taux d’erreur est identique.
Discussion/Conclusion
Heimdall est intuitif, entièrement automatisé et interfacé avec R. Les vues par problème font gagner du temps. Actuellement, les données non temporelles n’y trouvent pas de place, et Heimdall n’embarque pas d’outil de requête. Heimdall est open source et peut être téléchargé sur https://koromix.dev/files/R.},
	language = {fr},
	urldate = {2020-03-23},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Martignene, N. and Balcaen, T. and Bouzillé, G. and Calafiore, M. and Legrand, B. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2020},
	keywords = {Dossier patient électronique, Extraction de caractéristiques, Visualisation de données},
	pages = {S26},
}

Introduction Le dossier patient électronique contient des données temporelles structurées (PMSI, biologie médicale, médicaments, etc.) ou non (documents, images, etc.). Leur utilisation est double : transactionnelle (un seul patient, pour le soin) ou décisionnelle (plusieurs patients, réutilisation de données). Des outils de visualisation existent mais ne couvrent pas ces deux champs, rendent mal l’aspect hiérarchique des terminologies, et décloisonnent mal les données de sources différentes. L’objectif est de concevoir un tel outil. Méthodes Conception : nous abstrayons les types de données, puis spécifions les composants graphiques et leur mode de compactage. Développement : le prototype est développé en C++, disponible en librairie R. Évaluation : deux médecins répondent à cinq questions portant sur 24 cas cliniques réels d’insuffisance rénale aiguë, en utilisant trois interfaces dont Heimdall. Résultats Prototype : le temps suit l’axe horizontal, les concepts suivent l’axe vertical. Les « événements » sont représentés sous forme de triangles, les « états » de rectangles, les « mesures » de courbes (avec interpolation LOCF, linéaire ou spline). Ces composants sont embarqués dans une arborescence exploitant notamment celle des terminologies (CIM10, CCAM, etc.). Cette arborescence permet un repliement vertical, avec fusion des composants. Une condensation temporelle est possible. En mode décisionnel, les patients peuvent être alignés sur un événement (ex : appendicectomie). Les vues par problème (ex : fonction rénale, hématologie, etc.) déploient automatiquement des composants et en compactent d’autres. Évaluation : pour charger 3500 patients (360 000 valeurs), il faut une seconde et 50 Mo de mémoire. L’interface Heimdall est aussi rapide à utiliser par des médecins qu’une interface filtrée, et plus qu’une interface brute. Le taux d’erreur est identique. Discussion/Conclusion Heimdall est intuitif, entièrement automatisé et interfacé avec R. Les vues par problème font gagner du temps. Actuellement, les données non temporelles n’y trouvent pas de place, et Heimdall n’embarque pas d’outil de requête. Heimdall est open source et peut être téléchargé sur https://koromix.dev/files/R.

@article{boullenger_diabetiques_2020,
	series = {{VIIe} {Colloque} national organisé conjointement par l’{Association} des {Epidémiologistes} de langue française ({Adelf}) et par l’{Association} {Evaluation}, management, organisations, santé ({Emois}) {Livre} des résumés présentés au {Congrès} {Paris}, 12 et 13 mars 2020},
	title = {Diabétiques de type 2 suivis en médecine générale : séquences de traitements et évolution},
	volume = {68},
	issn = {0398-7620},
	shorttitle = {Diabétiques de type 2 suivis en médecine générale},
	url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0398762020300584},
	doi = {10.1016/j.respe.2020.01.050},
	abstract = {Introduction
Le traitement des diabétiques de type 2 repose sur le régime, les antidiabétiques oraux (ADO) et l’insuline. L’enchaînement des séquences et l’évolution du poids et de l’hémoglobine glyquée (HbA1c) ont été décrites aux USA et en Australie notamment, pas en France. La plupart des cabinets de médecine générale sont informatisés, mais à ce jour très peu de données ambulatoires sont exploitées en France, en dehors des données de remboursement. L’objectif est de réutiliser des données de médecine générale pour décrire l’évolution des patients diabétiques de type 2 traités en ville.
Méthodes
Les données d’un cabinet de groupe de médecine générale de Tourcoing de 2006 à 2018 sont analysées. Pour les patients diabétiques de type 2, sont analysés : traitements, diagnostics, résultats d’analyse de biologie médicale, taille et poids. Les femmes enceintes sont exclues.
Résultats
Sont inclus : 403 patients, 1030 séquences de traitement, 39 042 consultations, 2440 mesures d’HbA1c et 9722 poids. À l’inclusion, on trouve 50,1 \% de femmes, un âge moyen de 57,0 ans, un poids moyen de 84,4kg, un IMC moyen de 30,3kg/m2. L’HbA1c médiane est de 6,8 \%. Les patients sont sous régime (40,7 \%), ADO (54,1 \%) ou insuline (5,2 \%). Le suivi dure en médiane 3,51 ans. On observe en moyenne 5,18 poids par an et par patient, et 1,30 HbA1c. Pour les 375 patients compatibles avec une séquence « régime puis ADO puis insuline » (durées et âges médians), le régime commence à 54,7 ans et se termine après 3,71 ans, le traitement oral commence à 56,6 ans et dure 3,61 ans, enfin le traitement par insuline commence à 62,5 ans. Le poids est stable deux ans sous régime puis augmente, puis est stable sous ADO, puis finit par diminuer sous insuline. L’HbA1c baisse puis remonte sous régime, est stable sous ADO, puis diminue sous insuline.
Discussion/Conclusion
Ces résultats descriptifs sont utiles pour anticiper et expliquer aux patients leur évolution. Ils illustrent la richesse des données de médecine générale, et leur potentiel de réutilisation.},
	language = {fr},
	urldate = {2020-03-23},
	journal = {Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique},
	author = {Boullenger, L. and Balcaen, T. and Calafiore, M. and Legrand, B. and Rochoy, M. and Chazard, E.},
	month = mar,
	year = {2020},
	keywords = {Diabète type 2, HbA, Logiciels des cabinets médicaux, Médecine générale, Réutilisation de données},
	pages = {S23},
}

Introduction Le traitement des diabétiques de type 2 repose sur le régime, les antidiabétiques oraux (ADO) et l’insuline. L’enchaînement des séquences et l’évolution du poids et de l’hémoglobine glyquée (HbA1c) ont été décrites aux USA et en Australie notamment, pas en France. La plupart des cabinets de médecine générale sont informatisés, mais à ce jour très peu de données ambulatoires sont exploitées en France, en dehors des données de remboursement. L’objectif est de réutiliser des données de médecine générale pour décrire l’évolution des patients diabétiques de type 2 traités en ville. Méthodes Les données d’un cabinet de groupe de médecine générale de Tourcoing de 2006 à 2018 sont analysées. Pour les patients diabétiques de type 2, sont analysés : traitements, diagnostics, résultats d’analyse de biologie médicale, taille et poids. Les femmes enceintes sont exclues. Résultats Sont inclus : 403 patients, 1030 séquences de traitement, 39 042 consultations, 2440 mesures d’HbA1c et 9722 poids. À l’inclusion, on trouve 50,1 % de femmes, un âge moyen de 57,0 ans, un poids moyen de 84,4kg, un IMC moyen de 30,3kg/m2. L’HbA1c médiane est de 6,8 %. Les patients sont sous régime (40,7 %), ADO (54,1 %) ou insuline (5,2 %). Le suivi dure en médiane 3,51 ans. On observe en moyenne 5,18 poids par an et par patient, et 1,30 HbA1c. Pour les 375 patients compatibles avec une séquence « régime puis ADO puis insuline » (durées et âges médians), le régime commence à 54,7 ans et se termine après 3,71 ans, le traitement oral commence à 56,6 ans et dure 3,61 ans, enfin le traitement par insuline commence à 62,5 ans. Le poids est stable deux ans sous régime puis augmente, puis est stable sous ADO, puis finit par diminuer sous insuline. L’HbA1c baisse puis remonte sous régime, est stable sous ADO, puis diminue sous insuline. Discussion/Conclusion Ces résultats descriptifs sont utiles pour anticiper et expliquer aux patients leur évolution. Ils illustrent la richesse des données de médecine générale, et leur potentiel de réutilisation.

@article{degoul_lntraoperative_2020,
	title = {lntraoperative administration of 6\% hydroxyethyl starch 130/0.4 is not associated with acute kidney injury in elective non-cardiac surgery: a sequential and propensity-matched analysis},
	issn = {2352-5568},
	shorttitle = {lntraoperative administration of 6\% hydroxyethyl starch 130/0.4 is not associated with acute kidney injury in elective non-cardiac surgery},
	doi = {10.1016/j.accpm.2019.08.002},
	abstract = {BACKGROUND: Intraoperative use of hydroxyethyl starch (HES) may increase the risk of postoperative acute kidney injury (AKI). Data from large populations are lacking. We aimed to assess whether intraoperative administration of 6\% HES 130/0.4 is associated with AKI in non-cardiac surgery.
METHODS: This retrospective study used the electronic records concerning elective abdominal, urologic, thoracic and peripheral vascular surgeries from 2010 to 2015. HES and non-HES patients were compared using a propensity score matching. Postoperative AKI, defined by stage 3 of the Kidney Disease Improving Global Outcomes (KDIGO) score, was the primary outcome. Because the use of HES markedly decreased in 2013, additional analyses, restricted to the 2010-2012 period, were also performed.
RESULTS: 23 045, and 11 691 patients were included in the whole, and restricted periods, respectively. The reduction in HES use was not accompanied by any change in the incidence of AKI. Unadjusted association between HES and KDIGO 3 AKI was significant (OR [95\% CI] of 2.13 [1.67, 2.71]). For the whole period, 6460 patients were matched. Odd ratios for KDIGO 3 and all-stage AKI when using HES (10.3 ± 4.7 ml.kg-1 ) were 1.20 (95\% CI [0.74, 1.95]), and 1.21 (95\% CI [0.95, 1.54]), respectively. There was no association with the initiation of renal replacement therapy or in-hospital mortality either. Similar results were found for the restricted period.
CONCLUSION: The intraoperative use of moderate doses of 6\% HES 130/0.4 was not associated with increased risk of AKI. No conclusion can be drawn for higher doses of HES.},
	language = {eng},
	journal = {Anaesthesia, Critical Care \& Pain Medicine},
	author = {Degoul, Samuel and Chazard, Emmanuel and Lamer, Antoine and Lebuffe, Gilles and Duhamel, Alain and Tavernier, Benoît},
	month = feb,
	year = {2020},
	pmid = {32068135},
	keywords = {Acute Kidney Injury, Acute kidney injury, Elective Surgical Procedures, Elective surgical procedures, Hydroxyethyl Starch Derivatives, Hydroxyethyl starch derivatives, Patient Outcome Assessment, Patient outcome assessment},
}

BACKGROUND: Intraoperative use of hydroxyethyl starch (HES) may increase the risk of postoperative acute kidney injury (AKI). Data from large populations are lacking. We aimed to assess whether intraoperative administration of 6% HES 130/0.4 is associated with AKI in non-cardiac surgery. METHODS: This retrospective study used the electronic records concerning elective abdominal, urologic, thoracic and peripheral vascular surgeries from 2010 to 2015. HES and non-HES patients were compared using a propensity score matching. Postoperative AKI, defined by stage 3 of the Kidney Disease Improving Global Outcomes (KDIGO) score, was the primary outcome. Because the use of HES markedly decreased in 2013, additional analyses, restricted to the 2010-2012 period, were also performed. RESULTS: 23 045, and 11 691 patients were included in the whole, and restricted periods, respectively. The reduction in HES use was not accompanied by any change in the incidence of AKI. Unadjusted association between HES and KDIGO 3 AKI was significant (OR [95% CI] of 2.13 [1.67, 2.71]). For the whole period, 6460 patients were matched. Odd ratios for KDIGO 3 and all-stage AKI when using HES (10.3 ± 4.7 ml.kg-1 ) were 1.20 (95% CI [0.74, 1.95]), and 1.21 (95% CI [0.95, 1.54]), respectively. There was no association with the initiation of renal replacement therapy or in-hospital mortality either. Similar results were found for the restricted period. CONCLUSION: The intraoperative use of moderate doses of 6% HES 130/0.4 was not associated with increased risk of AKI. No conclusion can be drawn for higher doses of HES.

@article{mairesse_complications_2020,
	title = {Complications and reoperation after pelvic organ prolapse, impact of hysterectomy, surgical approach and surgeon experience},
	issn = {1433-3023},
	doi = {10.1007/s00192-019-04210-6},
	abstract = {INTRODUCTION AND HYPOTHESIS: The surgical treatment of pelvic organ prolapse (POP) is associated with specific complications. Our primary objective was to assess the recurrence requiring reoperation after prolapse surgery, and our secondary objectives were to assess the early complications and secondary surgery for urinary incontinence.
METHODS: Retrospective study of a population-based cohort of all hospital or outpatient stays including POP surgery from 2008 to 2014, using the French nationwide discharge summary database. We calculated the rates of hospital readmission following surgery as well as the rates of reoperation for recurrent prolapse and subsequent procedures performed for urinary incontinence.
RESULTS: A total of 310,938 patients had undergone surgery for POP. Two hundred fourteen (0.07\%) patients died, and 0.45\% were admitted to an intensive care unit; 4.4\% of the patients underwent surgery for the recurrence of prolapse. Concomitant hysterectomy in the first surgery was associated with a significantly lower risk of POP surgery recurrence: (hazard ratio (HR) [95\% confidence interval (CI)] = 0.51 [0.49; 0.53]). A total of 1386 (2.5\%) patients were readmitted to the hospital for early (30-day) complications of prolapse surgery. The most frequent reasons for early readmission were local infection (32.8\%), hemorrhage (21.4\%) and pain (17.2\%). Risk factors for complications were obesity, hospitals with low levels of activity and associated incontinence surgery; 4.6\% of the patients required secondary surgery for urinary incontinence; obesity was a risk factor (HR [95\% CI] = 1.12 [1.01; 1.24]), and the vaginal route was a protective factor (odds ratio = 1.86 for laparoscopy, 1.44 for laparotomy and 1.25 for multiple approaches).
CONCLUSIONS: POP surgery is associated with low rates of complication and recurrence. Complications occurred most commonly following combined surgeries for both prolapse and incontinence and in hospitals with low surgical volumes. Concomitant hysterectomy appears to be protective for the need for additional prolapse surgery, and the vaginal route leads to a lower frequency of secondary surgery for urinary incontinence.},
	language = {eng},
	journal = {International Urogynecology Journal},
	author = {Mairesse, Sybil and Chazard, Emmanuel and Giraudet, Géraldine and Cosson, Michel and Bartolo, Stéphanie},
	month = jan,
	year = {2020},
	pmid = {31912174},
	keywords = {Complication, Hysterectomy, Prolapse surgery, Urinary incontinence},
}

INTRODUCTION AND HYPOTHESIS: The surgical treatment of pelvic organ prolapse (POP) is associated with specific complications. Our primary objective was to assess the recurrence requiring reoperation after prolapse surgery, and our secondary objectives were to assess the early complications and secondary surgery for urinary incontinence. METHODS: Retrospective study of a population-based cohort of all hospital or outpatient stays including POP surgery from 2008 to 2014, using the French nationwide discharge summary database. We calculated the rates of hospital readmission following surgery as well as the rates of reoperation for recurrent prolapse and subsequent procedures performed for urinary incontinence. RESULTS: A total of 310,938 patients had undergone surgery for POP. Two hundred fourteen (0.07%) patients died, and 0.45% were admitted to an intensive care unit; 4.4% of the patients underwent surgery for the recurrence of prolapse. Concomitant hysterectomy in the first surgery was associated with a significantly lower risk of POP surgery recurrence: (hazard ratio (HR) [95% confidence interval (CI)] = 0.51 [0.49; 0.53]). A total of 1386 (2.5%) patients were readmitted to the hospital for early (30-day) complications of prolapse surgery. The most frequent reasons for early readmission were local infection (32.8%), hemorrhage (21.4%) and pain (17.2%). Risk factors for complications were obesity, hospitals with low levels of activity and associated incontinence surgery; 4.6% of the patients required secondary surgery for urinary incontinence; obesity was a risk factor (HR [95% CI] = 1.12 [1.01; 1.24]), and the vaginal route was a protective factor (odds ratio = 1.86 for laparoscopy, 1.44 for laparotomy and 1.25 for multiple approaches). CONCLUSIONS: POP surgery is associated with low rates of complication and recurrence. Complications occurred most commonly following combined surgeries for both prolapse and incontinence and in hospitals with low surgical volumes. Concomitant hysterectomy appears to be protective for the need for additional prolapse surgery, and the vaginal route leads to a lower frequency of secondary surgery for urinary incontinence.

@article{lamer_transforming_2020,
	title = {Transforming {French} {Electronic} {Health} {Records} into the {Observational} {Medical} {Outcome} {Partnership}'s {Common} {Data} {Model}: {A} {Feasibility} {Study}},
	volume = {11},
	issn = {1869-0327},
	shorttitle = {Transforming {French} {Electronic} {Health} {Records} into the {Observational} {Medical} {Outcome} {Partnership}'s {Common} {Data} {Model}},
	doi = {10.1055/s-0039-3402754},
	abstract = {BACKGROUND: Common data models (CDMs) enable data to be standardized, and facilitate data exchange, sharing, and storage, particularly when the data have been collected via distinct, heterogeneous systems. Moreover, CDMs provide tools for data quality assessment, integration into models, visualization, and analysis. The observational medical outcome partnership (OMOP) provides a CDM for organizing and standardizing databases. Common data models not only facilitate data integration but also (and especially for the OMOP model) extends the range of available statistical analyses.
OBJECTIVE: This study aimed to evaluate the feasibility of implementing French national electronic health records in the OMOP CDM.
METHODS: The OMOP's specifications were used to audit the source data, specify the transformation into the OMOP CDM, implement an extract-transform-load process to feed data from the French health care system into the OMOP CDM, and evaluate the final database.
RESULTS: Seventeen vocabularies corresponding to the French context were added to the OMOP CDM's concepts. Three French terminologies were automatically mapped to standardized vocabularies. We loaded nine tables from the OMOP CDM's "standardized clinical data" section, and three tables from the "standardized health system data" section. Outpatient and inpatient data from 38,730 individuals were integrated. The median (interquartile range) number of outpatient and inpatient stays per patient was 160 (19-364).
CONCLUSION: Our results demonstrated that data from the French national health care system can be integrated into the OMOP CDM. One of the main challenges was the use of international OMOP concepts to annotate data recorded in a French context. The use of local terminologies was an obstacle to conceptual mapping; with the exception of an adaptation of the International Classification of Diseases 10th Revision, the French health care system does not use international terminologies. It would be interesting to extend our present findings to the 65 million people registered in the French health care system.},
	language = {eng},
	number = {1},
	journal = {Applied Clinical Informatics},
	author = {Lamer, Antoine and Depas, Nicolas and Doutreligne, Matthieu and Parrot, Adrien and Verloop, David and Defebvre, Marguerite-Marie and Ficheur, Grégoire and Chazard, Emmanuel and Beuscart, Jean-Baptiste},
	month = jan,
	year = {2020},
	pmid = {31914471},
	pmcid = {PMC6949163},
	keywords = {Observational Health Data Sciences and Informatics, data integration, observational medical outcome partnership, secondary use},
	pages = {13--22},
}

BACKGROUND: Common data models (CDMs) enable data to be standardized, and facilitate data exchange, sharing, and storage, particularly when the data have been collected via distinct, heterogeneous systems. Moreover, CDMs provide tools for data quality assessment, integration into models, visualization, and analysis. The observational medical outcome partnership (OMOP) provides a CDM for organizing and standardizing databases. Common data models not only facilitate data integration but also (and especially for the OMOP model) extends the range of available statistical analyses. OBJECTIVE: This study aimed to evaluate the feasibility of implementing French national electronic health records in the OMOP CDM. METHODS: The OMOP's specifications were used to audit the source data, specify the transformation into the OMOP CDM, implement an extract-transform-load process to feed data from the French health care system into the OMOP CDM, and evaluate the final database. RESULTS: Seventeen vocabularies corresponding to the French context were added to the OMOP CDM's concepts. Three French terminologies were automatically mapped to standardized vocabularies. We loaded nine tables from the OMOP CDM's "standardized clinical data" section, and three tables from the "standardized health system data" section. Outpatient and inpatient data from 38,730 individuals were integrated. The median (interquartile range) number of outpatient and inpatient stays per patient was 160 (19-364). CONCLUSION: Our results demonstrated that data from the French national health care system can be integrated into the OMOP CDM. One of the main challenges was the use of international OMOP concepts to annotate data recorded in a French context. The use of local terminologies was an obstacle to conceptual mapping; with the exception of an adaptation of the International Classification of Diseases 10th Revision, the French health care system does not use international terminologies. It would be interesting to extend our present findings to the 65 million people registered in the French health care system.

@article{thillard_psychiatric_2020,
	title = {Psychiatric {Adverse} {Events} {Associated} {With} {Infliximab}: {A} {Cohort} {Study} {From} the {French} {Nationwide} {Discharge} {Abstract} {Database}},
	volume = {11},
	issn = {1663-9812},
	shorttitle = {Psychiatric {Adverse} {Events} {Associated} {With} {Infliximab}},
	doi = {10.3389/fphar.2020.00513},
	abstract = {Introduction: Infliximab (IFX) was the first anti-tumor necrosis factor (TNFα) antibody to be used in the treatment of severe chronic inflammatory diseases, such as Crohn's disease and rheumatoid arthritis. A number of serious adverse drug reactions are known to be associated with IFX use; they include infections, malignancies, and injection site reactions. Although a few case reports have described potential psychiatric adverse events (including suicide attempts and manic episodes), the latter are barely mentioned in IFX's summary of product characteristics. The objective of the present retrospective study was to detect potential psychiatric adverse events associated with IFX treatment by analyzing a national discharge abstract database.
Materials and Methods: We performed an historical cohort study by analyzing data from the French national hospital discharge abstract database (PMSI) between 2008 and 2014. All patients admitted with one of the five diseases treated with IFX were included.
Results: Of the 325,319 patients included in the study, 7,600 had been treated with IFX. The proportion of hospital admissions for one or more psychiatric events was higher among IFX-exposed patients (750 out of 7,600; 9.87\%) than among non-exposed patients (17,456 out of 317,719; 5.49\%). After taking account of potential confounders in the cohort as a whole, a semi-parametric Cox regression analysis gave an overall hazard ratio (HR) [95\% confidence interval] (CI) of 4.5 [3.95; 5.13] for a hospital admission with a psychiatric adverse event during treatment with IFX. The HR (95\%CI) for a depressive disorder was 4.97 (7.35; 6.68). Even higher risks were observed for certain pairs of adverse events and underlying pathologies: psychotic disorders in patients treated for ulcerative colitis (HR = 5.43 [2.01; 14.6]), manic episodes in patients treated for severe psoriasis (HR = 12.6 [4.65; 34.2]), and suicide attempts in patients treated for rheumatoid arthritis (HR = 4.45 [1.11; 17.9]).
Discussion: The present retrospective, observational study confirmed that IFX treatment is associated with an elevated risk of psychiatric adverse events. Depending on the disease treated, physicians should be aware of these potential adverse events.},
	language = {eng},
	journal = {Frontiers in Pharmacology},
	author = {Thillard, Eve-Marie and Gautier, Sophie and Babykina, Evgeniya and Carton, Louise and Amad, Ali and Bouzillé, Guillaume and Beuscart, Jean-Baptiste and Ficheur, Grégoire and Chazard, Emmanuel},
	year = {2020},
	pmid = {32390850},
	pmcid = {PMC7188945},
	keywords = {Adverse event (AE), Database (DB), Depression, Infliximab (ifx), Pharmacovigilance, Psychiatry, adverse events, database, depression, infliximab, pharmacoepidaemiology, pharmacoepidemiology, pharmacovigilance, psychiatry},
	pages = {513},
}

Introduction: Infliximab (IFX) was the first anti-tumor necrosis factor (TNFα) antibody to be used in the treatment of severe chronic inflammatory diseases, such as Crohn's disease and rheumatoid arthritis. A number of serious adverse drug reactions are known to be associated with IFX use; they include infections, malignancies, and injection site reactions. Although a few case reports have described potential psychiatric adverse events (including suicide attempts and manic episodes), the latter are barely mentioned in IFX's summary of product characteristics. The objective of the present retrospective study was to detect potential psychiatric adverse events associated with IFX treatment by analyzing a national discharge abstract database. Materials and Methods: We performed an historical cohort study by analyzing data from the French national hospital discharge abstract database (PMSI) between 2008 and 2014. All patients admitted with one of the five diseases treated with IFX were included. Results: Of the 325,319 patients included in the study, 7,600 had been treated with IFX. The proportion of hospital admissions for one or more psychiatric events was higher among IFX-exposed patients (750 out of 7,600; 9.87%) than among non-exposed patients (17,456 out of 317,719; 5.49%). After taking account of potential confounders in the cohort as a whole, a semi-parametric Cox regression analysis gave an overall hazard ratio (HR) [95% confidence interval] (CI) of 4.5 [3.95; 5.13] for a hospital admission with a psychiatric adverse event during treatment with IFX. The HR (95%CI) for a depressive disorder was 4.97 (7.35; 6.68). Even higher risks were observed for certain pairs of adverse events and underlying pathologies: psychotic disorders in patients treated for ulcerative colitis (HR = 5.43 [2.01; 14.6]), manic episodes in patients treated for severe psoriasis (HR = 12.6 [4.65; 34.2]), and suicide attempts in patients treated for rheumatoid arthritis (HR = 4.45 [1.11; 17.9]). Discussion: The present retrospective, observational study confirmed that IFX treatment is associated with an elevated risk of psychiatric adverse events. Depending on the disease treated, physicians should be aware of these potential adverse events.

@article{caron_risk_2019,
	title = {Risk of {Pulmonary} {Embolism} {More} {Than} 6 {Weeks} {After} {Surgery} {Among} {Cancer}-{Free} {Middle}-aged {Patients}},
	issn = {2168-6262},
	doi = {10.1001/jamasurg.2019.3742},
	abstract = {Importance: The risk of postoperative pulmonary embolism has been reported to be highest during the first 5 weeks after surgery. However, how long the excess risk of postoperative pulmonary embolism persists remains unknown.
Objective: To assess the duration and magnitude of the late postoperative risk of pulmonary embolism among cancer-free middle-aged patients by the type of surgery.
Design, Setting, and Participants: Case-crossover analysis to compute the respective risks of pulmonary embolism after 6 types of surgery using data from a French national inpatient database, which covers a total of 203 million inpatient stays over an 8-year period between 2007 and 2014. Participants were cancer-free middle-aged adult patients (aged 45 to 64) with a diagnosis of a first pulmonary embolism.
Exposures: Hospital admission for surgery. Surgical procedures were classified into 6 types: (1) vascular surgery, (2) gynecological surgery, (3) gastrointestinal surgery, (4) hip or knee replacement, (5) fractures, and (6) other orthopedic operations.
Main Outcomes and Measures: Diagnosis of a first pulmonary embolism.
Results: A total of 60 703 patients were included (35 766 [58.9\%] male; mean [SD] age, 56.6 [6.0] years). The risk of postoperative pulmonary embolism was elevated for at least 12 weeks after all types of surgery and was highest during the immediate postoperative period (1 to 6 weeks). The excess risk of postoperative pulmonary embolism ranged from odds ratio (OR), 5.24 (95\% CI, 3.91-7.01) for vascular surgery to OR, 8.34 (95\% CI, 6.07-11.45) for surgery for fractures. The risk remained elevated from 7 to 12 weeks, with the OR ranging from 2.26 (95\% CI, 1.81-2.82) for gastrointestinal operations to 4.23 (95\% CI, 3.01-5.92) for surgery for fractures. The risk was not clinically significant beyond 18 weeks postsurgery for all types of procedures.
Conclusions and Relevance: The risk of postoperative pulmonary embolism is elevated beyond 6 weeks postsurgery regardless of the type of procedure. The persistence of this excess risk suggests that further randomized clinical trials are required to evaluate whether the duration of postoperative prophylactic anticoagulation should be extended and to define the optimal duration of treatment with regard to both the thrombotic and bleeding risks.},
	language = {eng},
	journal = {JAMA surgery},
	author = {Caron, Alexandre and Depas, Nicolas and Chazard, Emmanuel and Yelnik, Cécile and Jeanpierre, Emmanuelle and Paris, Camille and Beuscart, Jean-Baptiste and Ficheur, Grégoire},
	month = oct,
	year = {2019},
	pmid = {31596449},
}

Importance: The risk of postoperative pulmonary embolism has been reported to be highest during the first 5 weeks after surgery. However, how long the excess risk of postoperative pulmonary embolism persists remains unknown. Objective: To assess the duration and magnitude of the late postoperative risk of pulmonary embolism among cancer-free middle-aged patients by the type of surgery. Design, Setting, and Participants: Case-crossover analysis to compute the respective risks of pulmonary embolism after 6 types of surgery using data from a French national inpatient database, which covers a total of 203 million inpatient stays over an 8-year period between 2007 and 2014. Participants were cancer-free middle-aged adult patients (aged 45 to 64) with a diagnosis of a first pulmonary embolism. Exposures: Hospital admission for surgery. Surgical procedures were classified into 6 types: (1) vascular surgery, (2) gynecological surgery, (3) gastrointestinal surgery, (4) hip or knee replacement, (5) fractures, and (6) other orthopedic operations. Main Outcomes and Measures: Diagnosis of a first pulmonary embolism. Results: A total of 60 703 patients were included (35 766 [58.9%] male; mean [SD] age, 56.6 [6.0] years). The risk of postoperative pulmonary embolism was elevated for at least 12 weeks after all types of surgery and was highest during the immediate postoperative period (1 to 6 weeks). The excess risk of postoperative pulmonary embolism ranged from odds ratio (OR), 5.24 (95% CI, 3.91-7.01) for vascular surgery to OR, 8.34 (95% CI, 6.07-11.45) for surgery for fractures. The risk remained elevated from 7 to 12 weeks, with the OR ranging from 2.26 (95% CI, 1.81-2.82) for gastrointestinal operations to 4.23 (95% CI, 3.01-5.92) for surgery for fractures. The risk was not clinically significant beyond 18 weeks postsurgery for all types of procedures. Conclusions and Relevance: The risk of postoperative pulmonary embolism is elevated beyond 6 weeks postsurgery regardless of the type of procedure. The persistence of this excess risk suggests that further randomized clinical trials are required to evaluate whether the duration of postoperative prophylactic anticoagulation should be extended and to define the optimal duration of treatment with regard to both the thrombotic and bleeding risks.

@article{delrot_medical_2019,
	title = {Do {Medical} {Practitioners} {Trust} {Automated} {Interpretation} of {Electrocardiograms}?},
	volume = {264},
	issn = {1879-8365},
	doi = {10.3233/SHTI190280},
	abstract = {The objective is to study the way physicians use the ECG computerized interpretation (ECG-CI). Anonymous questionnaires were mailed to 282 primary care physicians (PCPs) and 140 cardiologists in France. 225 complete surveys were analyzed. PCPs performed a median of 5 ECGs per month, vs. 200 ECGs for cardiologists. Among PCPs with ECG, 57\% felt confident about their skills in interpreting ECGs. Whereas 91.7\% of cardiologists first interpreted the ECG by themselves, 27.9\% of PCPs first read the computerized interpretation. PCPs found that ECG-CI was more reliable than cardiologists did for atrial or ventricular hypertrophy. PCPs and cardiologists agreed that ECG-CI was reliable for conduction troubles and "normal ECG" statement, but was not for other rhythm or repolarization troubles. PCPs are less experienced with ECG interpretation, but are also more likely to trust the computerized interpretation, whereas those interpreters are not fully reliable.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Delrot, Cédric and Bouzillé, Guillaume and Calafiore, Matthieu and Rochoy, Michaël and Legrand, Bertrand and Ficheur, Grégoire and Chazard, Emmanuel},
	month = aug,
	year = {2019},
	pmid = {31437981},
	keywords = {Computer interpretation, Electrocardiography},
	pages = {536--540},
}

The objective is to study the way physicians use the ECG computerized interpretation (ECG-CI). Anonymous questionnaires were mailed to 282 primary care physicians (PCPs) and 140 cardiologists in France. 225 complete surveys were analyzed. PCPs performed a median of 5 ECGs per month, vs. 200 ECGs for cardiologists. Among PCPs with ECG, 57% felt confident about their skills in interpreting ECGs. Whereas 91.7% of cardiologists first interpreted the ECG by themselves, 27.9% of PCPs first read the computerized interpretation. PCPs found that ECG-CI was more reliable than cardiologists did for atrial or ventricular hypertrophy. PCPs and cardiologists agreed that ECG-CI was reliable for conduction troubles and "normal ECG" statement, but was not for other rhythm or repolarization troubles. PCPs are less experienced with ECG interpretation, but are also more likely to trust the computerized interpretation, whereas those interpreters are not fully reliable.

@article{bouzille_automated_2019,
	title = {An {Automated} {Detection} {System} of {Drug}-{Drug} {Interactions} from {Electronic} {Patient} {Records} {Using} {Big} {Data} {Analytics}},
	volume = {264},
	issn = {1879-8365},
	doi = {10.3233/SHTI190180},
	abstract = {The aim of the study was to build a proof-of-concept demonstratrating that big data technology could improve drug safety monitoring in a hospital and could help pharmacovigilance professionals to make data-driven targeted hypotheses on adverse drug events (ADEs) due to drug-drug interactions (DDI). We developed a DDI automatic detection system based on treatment data and laboratory tests from the electronic health records stored in the clinical data warehouse of Rennes academic hospital. We also used OrientDb, a graph database to store informations from five drug knowledge databases and Spark to perform analysis of potential interactions betweens drugs taken by hospitalized patients. Then, we developed a machine learning model to identify the patients in whom an ADE might have occurred because of a DDI. The DDI detection system worked efficiently and computation time was manageable. The system could be routinely employed for monitoring.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Bouzillé, Guillaume and Morival, Camille and Westerlynck, Richard and Lemordant, Pierre and Chazard, Emmanuel and Lecorre, Pascal and Busnel, Yann and Cuggia, Marc},
	month = aug,
	year = {2019},
	pmid = {31437882},
	keywords = {Computing Methodologies, Drug Interaction, Machine Learning},
	pages = {45--49},
}

The aim of the study was to build a proof-of-concept demonstratrating that big data technology could improve drug safety monitoring in a hospital and could help pharmacovigilance professionals to make data-driven targeted hypotheses on adverse drug events (ADEs) due to drug-drug interactions (DDI). We developed a DDI automatic detection system based on treatment data and laboratory tests from the electronic health records stored in the clinical data warehouse of Rennes academic hospital. We also used OrientDb, a graph database to store informations from five drug knowledge databases and Spark to perform analysis of potential interactions betweens drugs taken by hospitalized patients. Then, we developed a machine learning model to identify the patients in whom an ADE might have occurred because of a DDI. The DDI detection system worked efficiently and computation time was manageable. The system could be routinely employed for monitoring.

@article{mellot_what_2019,
	title = {What {Is} a {Chronic} {Disease}? {A} {Contribution} {Based} on the {Secondary} {Use} of 161 {Million} {Discharge} {Records}},
	volume = {264},
	issn = {1879-8365},
	shorttitle = {What {Is} a {Chronic} {Disease}?},
	doi = {10.3233/SHTI190224},
	abstract = {Several definitions of chronic diseases exist. The objective is to reuse a nationwide medical-administrative database (PMSI) to estimate the lifespan of diagnostic codes, hence the chronicity of the corresponding diseases. We analyzed 162 million inpatient stays from 2008 to 2014, and estimate the lifespan of every ICD-10 code for every patient, identified by a unique imprint. We calculated 200 indicators for different time and survival values, and selected the ones that maximized the area under the ROC curve (AUC) drawn by comparison against 4 chronic disease classifications: CCI, ALD, result from the analysis of ICD-10 labels, and a handmade list. The best indicator was the time to reach a survival of 4.5\%. It enables to get the following AUC: 78.9\% compared with CCI, 90.3\% compared with ALD, 75.1\% compared with labels analysis, and 91.5\% compared with the handmade list. This indicator enables to classify 23,349 ICD-10 codes from "most chronic" to "most acute". The 100 most chronic codes are listed.},
	language = {eng},
	journal = {Studies in Health Technology and Informatics},
	author = {Mellot, Emeric and Balcaen, Thibaut and Calafiore, Matthieu and Bouzillé, Guillaume and Beuscart, Jean-Baptiste and Ficheur, Grégoire and Chazard, Emmanuel},
	month = aug,
	year = {2019},
	pmid = {31437926},
	keywords = {Big data, Chronic disease, Patient discharge},
	pages = {263--267},
}

Several definitions of chronic diseases exist. The objective is to reuse a nationwide medical-administrative database (PMSI) to estimate the lifespan of diagnostic codes, hence the chronicity of the corresponding diseases. We analyzed 162 million inpatient stays from 2008 to 2014, and estimate the lifespan of every ICD-10 code for every patient, identified by a unique imprint. We calculated 200 indicators for different time and survival values, and selected the ones that maximized the area under the ROC curve (AUC) drawn by comparison against 4 chronic disease classifications: CCI, ALD, result from the analysis of ICD-10 labels, and a handmade list. The best indicator was the time to reach a survival of 4.5%. It enables to get the following AUC: 78.9% compared with CCI, 90.3% compared with ALD, 75.1% compared with labels analysis, and 91.5% compared with the handmade list. This indicator enables to classify 23,349 ICD-10 codes from "most chronic" to "most acute". The 100 most chronic codes are listed.

@article{negre_breast_2019,
	title = {Breast reconstruction in {France}, observational study of 140,904 cases of mastectomy for breast cancer},
	issn = {1768-319X},
	doi = {10.1016/j.anplas.2019.07.014},
	abstract = {OBJECTIVES: In France, there are few up-to-date epidemiological data on breast reconstruction after mastectomy for breast cancer. The objective of the present study was to measure immediate and delayed breast reconstruction (IBR and DBR, respectively) rates and thus the proportion of patients not benefiting from any reconstruction.
METHODS: We performed an observational study by assessing data from the French nationwide discharge summary database (Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information) for the period 2008-2014. All women having undergone a total mastectomy for breast cancer during this period were included. We then searched for reconstructive surgery during the initial or subsequent hospital stays, and recorded the time interval between mastectomy and reconstruction.
RESULTS: Among the 140,904 mastectomies included, the IBR rate was 16.1\% on average, and increased over the study period. The time interval between mastectomy and DBR was≤3 years in 92\% of cases. For patients included in 2008 and 2009, the DBR rate was 17.8\%, and the non-reconstruction rate was 66.4\%.
CONCLUSION: The high proportion of women not undergoing breast reconstruction after mastectomy suggests that access to this procedure should be improved.},
	language = {eng},
	journal = {Annales De Chirurgie Plastique Et Esthetique},
	author = {Nègre, G. and Balcaen, T. and Dast, S. and Sinna, R. and Chazard, E.},
	month = aug,
	year = {2019},
	pmid = {31383624},
	keywords = {Breast cancer, Breast reconstruction, Cancer du sein, Epidemiology, Mastectomie, Mastectomy, PMSI, Reconstruction mammaire, Épidémiologie},
}

OBJECTIVES: In France, there are few up-to-date epidemiological data on breast reconstruction after mastectomy for breast cancer. The objective of the present study was to measure immediate and delayed breast reconstruction (IBR and DBR, respectively) rates and thus the proportion of patients not benefiting from any reconstruction. METHODS: We performed an observational study by assessing data from the French nationwide discharge summary database (Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information) for the period 2008-2014. All women having undergone a total mastectomy for breast cancer during this period were included. We then searched for reconstructive surgery during the initial or subsequent hospital stays, and recorded the time interval between mastectomy and reconstruction. RESULTS: Among the 140,904 mastectomies included, the IBR rate was 16.1% on average, and increased over the study period. The time interval between mastectomy and DBR was≤3 years in 92% of cases. For patients included in 2008 and 2009, the DBR rate was 17.8%, and the non-reconstruction rate was 66.4%. CONCLUSION: The high proportion of women not undergoing breast reconstruction after mastectomy suggests that access to this procedure should be improved.

@article{migaud_reponse_2019,
	title = {Réponse au courrier adressé au comité de rédaction d’{Orthopaedics} and {Traumatology}: {Surgery} and {Research} par {Federico} {Solla}, {Antoine} {Tran} et {Virginie} {Rampal}. {Rappel} sur les critères de choix du niveau de preuve : précisions sur le classement en niveau 3 ou 4 d’une étude thérapeutique},
	volume = {105},
	issn = {1877-0517},
	shorttitle = {Réponse au courrier adressé au comité de rédaction d’{Orthopaedics} and {Traumatology}},
	url = {http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877051719301522},
	doi = {10.1016/j.rcot.2019.04.017},
	language = {fr},
	number = {4},
	urldate = {2020-03-23},
	journal = {Revue de Chirurgie Orthopédique et Traumatologique},
	author = {Migaud, Henri and Chazard, Emmanuel and Seringe, Raphaël and Beaufils, Philippe},
	month = jun,
	year = {2019},
	pages = {537--539},
}

@article{migaud_reply_2019,
	title = {Reply to the letter set to the {OTSR} editorial board by {Federico} {Solla}, {Antoine} {Tran}, and {Virginie} {Rampal}. {Level} of evidence criteria: {Distinguishing} level 3 from level 4 therapeutic studies},
	issn = {1877-0568},
	shorttitle = {Reply to the letter set to the {OTSR} editorial board by {Federico} {Solla}, {Antoine} {Tran}, and {Virginie} {Rampal}. {Level} of evidence criteria},
	doi = {10.1016/j.otsr.2019.04.002},
	language = {eng},
	journal = {Orthopaedics \& traumatology, surgery \& research: OTSR},
	author = {Migaud, Henri and Chazard, Emmanuel and Seringe, Raphaël and Beaufils, Philippe},
	month = apr,
	year = {2019},
	pmid = {31006643},
}